(1S,3R,4R,7R)-7-tert-butyldimethylsilyloxy-1-hydroxymethyl-3-(urac-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (1S,3R,4R,7R)-7-tert-butyldimethylsilyloxy-1-hydroxymethyl-3-(urac-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
• 英文别名: (1S,3R,4R,7S)-7-tert-butyldimethylsilyloxy-1-hydroxymethyl-3-(uracil-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane；1-[(1S,3R,4R,7S)-7-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-1-(hydroxymethyl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-3-yl]pyrimidine-2,4-dione
• 化学式: C₁₆H₂₆N₂O₆Si
• 分子量: 370.478
• InChiKey: LXHFKGZMGGIGGH-IATRGZMQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.59
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  97.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,3R,4R,7R)-7-tert-butyldimethylsilyloxy-1-hydroxymethyl-3-(urac-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane 在 三氟化硼乙醚 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-1-[5-tert-butoxycarbonylamino-5-deoxy-2,3-O-(3-pentylidene)-β-D-ribofuranosyloxy]methyl-7-tert-butyldimethylsilyloxy-3-(uracil-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  作为 MraY 抑制剂的 LNA/BNA 型 5'-O-氨基核糖苷尿苷的设计、合成和构象-活性关系分析

  摘要：

  了解和控制药物化学中的生物活性构象非常重要。Muraymycins 和 caprazamycins 是 MraY 的强抑制剂，是具有新作用方式的有前途的抗菌剂。着眼于这些天然产物的尿苷部分的糖褶皱和二面角 φ，设计了 LNA/BNA 型 5'-O-氨基核糖基尿苷类似物，其核糖部分的褶皱完全限于N型。合成为简化的 MraY 抑制剂。进一步详细研究了它们的构象-活性关系。本研究中研究的构象-活性关系分析可以作为简化和合理设计 MraY 抑制性核苷天然产物的一般指南。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2022.116744
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O,4'-C-methyleneuridine 在 吡啶 、 三乙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 生成 (1S,3R,4R,7R)-7-tert-butyldimethylsilyloxy-1-hydroxymethyl-3-(urac-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  [EN] NUCLEIC ACID-POLYPEPTIDE COMPOSITIONS AND USES THEREOF
  [FR] COMPOSITIONS D'ACIDE NUCLÉIQUE-POLYPEPTIDE ET UTILISATIONS DE CELLES-CI

  摘要：

  本文披露了包含与修饰的多核苷酸分子和聚合物结合基团的组合物和药物配方。本文还描述了利用包含与多核苷酸分子和聚合物结合基团共轭的组合物或药物配方治疗癌症的方法。

  公开号：

  WO2019071028A1

文献信息

• [EN] NUCLEIC ACID-POLYPEPTIDE COMPOSITIONS AND USES THEREOF<br/>[FR] COMPOSITIONS D'ACIDE NUCLÉIQUE-POLYPEPTIDE ET UTILISATIONS DE CELLES-CI
  申请人：AVIDITY BIOSCIENCES LLC

  公开号：WO2019071028A1

  公开（公告）日：2019-04-11

  Disclosed herein are compositions and pharmaceutical formulations that comprise a binding moiety conjugated to a modified polynucleic acid molecule and a polymer. Also described herein include methods for treating a cancer which utilize a composition or a pharmaceutical formulation comprising a binding moiety conjugated to a polynucleic acid molecule and a polymer.

  本文披露了包含与修饰的多核苷酸分子和聚合物结合基团的组合物和药物配方。本文还描述了利用包含与多核苷酸分子和聚合物结合基团共轭的组合物或药物配方治疗癌症的方法。
• [EN] COMPOSITIONS AND METHODS FOR IMPROVING STRAND BIASED<br/>[FR] COMPOSITIONS ET MÉTHODES POUR AMÉLIORER LA DISTORSION DE BRIN
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2019217397A3

  公开（公告）日：2020-07-23
• [EN] HETERODUPLEX NUCLEIC ACID MOLECULES AND USES THEREOF<br/>[FR] MOLÉCULES D'ACIDE NUCLÉIQUE HÉTÉRODUPLEX ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：AVIDITY BIOSCIENCES LLC

  公开号：WO2019136180A3

  公开（公告）日：2019-08-29
• Synthesis of 4′,4′-C-diaminomethyl nucleoside derivative as a building block for constructing libraries via amide bond formation
  作者：Chung-Shan Yu、Ren-Tsong Wang、Li-Wu Chiang、Ming-Hsun Lee

  DOI：10.1016/j.tetlet.2007.03.002

  日期：2007.4

  Preparation of the 4',4-C-diaminomethyl uridine analog starting from the commercial uridine via 4',4'-C-dihydroxymethyl uridine, 4',4'- C-bis-trifluoromethanesulfonyl oxymethyl uridine, and 4',4'-C-diazidomethyl uridine in total eight steps was achieved in 8% yield. Steric hindrance between 3'-O-TBDMS and 5'-O-triflate prevented the undesired ring closure which made the synthesis of target compound feasible. (c) 2007 Published by Elsevier Ltd.
• Design, synthesis and conformation-activity relationship analysis of LNA/BNA-type 5′-O-aminoribosyluridine as MraY inhibitors
  作者：Shintaro Kusaka、Kazuki Yamamoto、Motoko Shinohara、Yusuke Minato、Satoshi Ichikawa

  DOI：10.1016/j.bmc.2022.116744

  日期：2022.7

  the uridine moiety of these natural products, LNA/BNA-type 5′-O-aminoribosyluridine analogues, whose puckering of the ribose moiety are completely restricted to the N-type, were designed and synthesized as simplified MraY inhibitors. Their conformation-activity relationship was further investigated in details. The conformation-activity relationship analysis investigated in this study could be a general

  了解和控制药物化学中的生物活性构象非常重要。Muraymycins 和 caprazamycins 是 MraY 的强抑制剂，是具有新作用方式的有前途的抗菌剂。着眼于这些天然产物的尿苷部分的糖褶皱和二面角 φ，设计了 LNA/BNA 型 5'-O-氨基核糖基尿苷类似物，其核糖部分的褶皱完全限于N型。合成为简化的 MraY 抑制剂。进一步详细研究了它们的构象-活性关系。本研究中研究的构象-活性关系分析可以作为简化和合理设计 MraY 抑制性核苷天然产物的一般指南。