(2E,4E)-N-((2S,3R)-3-hydroxy-1-(((5S,8S,E)-5-methyl-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododec-3-en-8-yl)amino)-1-oxobutan-2-yl)-11-methyldodeca-2,4-dienamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2E,4E)-N-((2S,3R)-3-hydroxy-1-(((5S,8S,E)-5-methyl-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododec-3-en-8-yl)amino)-1-oxobutan-2-yl)-11-methyldodeca-2,4-dienamide
• 英文别名: desoxycepafungin I；Luminmycin D；(2E,4E)-N-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-[[(3E,5S,8S)-5-methyl-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododec-3-en-8-yl]amino]-1-oxobutan-2-yl]-11-methyldodeca-2,4-dienamide
• 化学式: C₂₈H₄₆N₄O₅
• 分子量: 518.697
• InChiKey: LDVOKBNDYUGJCS-NAXDEXLSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  6-溴正己醇 在 草酰氯 、 magnesium 、 二甲基亚砜 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 、 3-(二乙氧基邻酰氧基)-1,2,3-苯并三嗪-4-酮 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 lithium hydroxide 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 50.5h， 生成 (2E,4E)-N-((2S,3R)-3-hydroxy-1-(((5S,8S,E)-5-methyl-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododec-3-en-8-yl)amino)-1-oxobutan-2-yl)-11-methyldodeca-2,4-dienamide
  参考文献：
  名称：

  头孢芬净 I 细胞靶点的简明化学酶促全合成及鉴定。

  摘要：

  最近通过一系列体外研究报道，天然产物头孢芬净I是20S蛋白酶体核心颗粒最有效的共价抑制剂之一。活性测定。在这里，我们报告了头孢芬净 I 的简短化学酶促全合成，其特点是使用区域选择性酶促氧化以可扩展的方式制备关键的羟基化氨基酸构建块。本文开发的策略使得能够使用化学蛋白质组学探针，这反过来揭示了头孢芬净 I 对蛋白酶体 β2 和 β5 亚基的特殊选择性和效力。进一步的构效关系研究表明羟基在大环中的关键作用和脂质尾部在调节该天然产物家族效力方面的特性。本研究为进一步的药物化学探索奠定了基础，以充分发挥头孢芬净 I 的抗癌潜力。

  DOI：

  10.1016/j.chembiol.2020.07.012

文献信息

• Concise Chemoenzymatic Total Synthesis and Identification of Cellular Targets of Cepafungin I
  作者：Alexander Amatuni、Anton Shuster、Alexander Adibekian、Hans Renata

  DOI：10.1016/j.chembiol.2020.07.012

  日期：2020.10

  The natural product cepafungin I was recently reported to be one of the most potent covalent inhibitors of the 20S proteasome core particle through a series of in vitro activity assays. Here, we report a short chemoenzymatic total synthesis of cepafungin I featuring the use of a regioselective enzymatic oxidation to prepare a key hydroxylated amino acid building block in a scalable fashion. The strategy

  最近通过一系列体外研究报道，天然产物头孢芬净I是20S蛋白酶体核心颗粒最有效的共价抑制剂之一。活性测定。在这里，我们报告了头孢芬净 I 的简短化学酶促全合成，其特点是使用区域选择性酶促氧化以可扩展的方式制备关键的羟基化氨基酸构建块。本文开发的策略使得能够使用化学蛋白质组学探针，这反过来揭示了头孢芬净 I 对蛋白酶体 β2 和 β5 亚基的特殊选择性和效力。进一步的构效关系研究表明羟基在大环中的关键作用和脂质尾部在调节该天然产物家族效力方面的特性。本研究为进一步的药物化学探索奠定了基础，以充分发挥头孢芬净 I 的抗癌潜力。