3-[2-(5-tert-butyl-1H-1,3-benzodiazol-2-yl)ethyl]cyclobutan-1-one hydrochloride

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 3-[2-(5-tert-butyl-1H-1,3-benzodiazol-2-yl)ethyl]cyclobutan-1-one hydrochloride
• 英文别名: 5-tert-butyl-2-[2-(3-oxocyclobutyl)ethyl]-1H-1,3-benzodiazol-1-ium chloride；3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutan-1-one hydrochloride；3-(2-(6-(tert-Butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutanone hydrochloride；3-[2-(6-tert-butyl-1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]cyclobutan-1-one;hydrochloride
• 化学式: C₁₇H₂₂N₂O*ClH
• 分子量: 306.835
• InChiKey: JBRZMDSGZFJSEO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.01
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  46
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-[2-(5-tert-butyl-1H-1,3-benzodiazol-2-yl)ethyl]cyclobutan-1-one hydrochloride 在 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 0.08h， 以99%的产率得到3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutanone
  参考文献：
  名称：

  基于碳环C-核苷的甲基转移酶DOT1L高选择性抑制剂的合成与分析

  摘要：

  组蛋白甲基转移酶 DOT1L 是治疗血液恶性肿瘤的一个有吸引力的治疗靶点。在这里，我们报告了基于非常规碳环 C-核苷支架的新型 DOT1L 抑制剂的设计、合成和分析。发现实验观察到的 SAR 并非微不足道，因为单个取代基的看似微小的变化导致对 DOT1L 的亲和力发生显着变化。分子模型表明，这些趋势可能与蛋白质与抑制剂相互作用后的显着构象变化有关。化合物22和 (-)- 53 ( MU1656 )，天然核苷衍生物EPZ004777的碳环 C-核苷类似物，以及临床候选物EPZ5676 (pinometostat) 在体外以及在细胞中有效且选择性地抑制 DOT1L。发现最有效的化合物MU1656比 pinometostat 本身在体内代谢更稳定且毒性显着降低。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c02228
• 作为产物：
  描述：

  4-戊烯酸苄酯 在 盐酸 、 草酰氯 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 铁粉 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙二醇二甲醚 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 160.5h， 生成 3-[2-(5-tert-butyl-1H-1,3-benzodiazol-2-yl)ethyl]cyclobutan-1-one hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  [EN] METHODS OF SYNTHESIZING SUBSTITUTED PURINE COMPOUNDS
  [FR] PROCÉDÉS DE SYNTHÈSE DE COMPOSÉS DE PURINE SUBSTITUÉS

  摘要：

  公开号：

  WO2014152566A3

文献信息

• [EN] SUBSTITUTED 7-DEAZAPURINE COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS 7-DÉAZAPURINE SUBSTITUÉS
  申请人：EPIZYME INC

  公开号：WO2014152261A1

  公开（公告）日：2014-09-25

  The present invention relates to substituted 7-deazapurine compounds. The present invention also relates to pharmaceutical compositions containing these compounds and methods of treating disorders in which DOT1-mediated protein methylation plays a part, such as cancer, by administering these compounds and pharmaceutical compositions to subjects in need thereof.

  本发明涉及取代的7-脱氮嘌呤化合物。本发明还涉及包含这些化合物的药物组合物，以及通过向需要它们的受试者施用这些化合物和药物组合物来治疗DOT1介导的蛋白质甲基化发挥作用的疾病的方法，例如癌症。
• Methods of Synthesizing Substituted Purine Compounds
  申请人：EPIZYME, INC.

  公开号：US20150011495A1

  公开（公告）日：2015-01-08

  The present invention provides an efficient process for the synthesis of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof and methods for treating disorders in which DOT1-mediated protein methylation plays a part, such as cancer and neurological disorders, by administering these compounds and pharmaceutical compositions to subjects in need thereof. The present invention also provides novel crystalline forms of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof (Form A, Form B, and Form C), characterized by a unique X-ray diffraction pattern and Differential Scanning Calorimetry profile, as well as a unique crystalline structure.

  本发明提供了一种有效的合成过程，用于合成(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3,4-二醇及其水合物，并通过向需要治疗DOT1介导的蛋白质甲基化在内的疾病的受试者投与这些化合物和制药组合物来治疗这些疾病，例如癌症和神经系统疾病。本发明还提供了(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3,4-二醇及其水合物的新型晶体形式(Form A、Form B和Form C)，其具有独特的X射线衍射图案和差示扫描量热分析曲线，以及独特的晶体结构。
• METHODS OF SYNTHESIZING SUBSTITUTED PURINE COMPOUNDS
  申请人：EPIZYME, INC.

  公开号：US20160024134A1

  公开（公告）日：2016-01-28

  The present invention provides an efficient process for the synthesis of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof and methods for treating disorders in which DOT1-mediated protein methylation plays a part, such as cancer and neurological disorders, by administering these compounds and pharmaceutical compositions to subjects in need thereof. The present invention also provides novel crystalline forms of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof (Form A, Form B, and Form C), characterized by a unique X-ray diffraction pattern and Differential Scanning calorimetry profile, as well as a unique crystalline structure.

  本发明提供了一种有效的合成(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3,4-二醇及其水合物的过程，并通过向需要治疗DOT1介导的蛋白质甲基化在其中发挥作用的疾病（如癌症和神经系统疾病）的受试者施用这些化合物和药物组合物的方法。本发明还提供了(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3,4-二醇及其水合物的新晶体形式(Form A, Form B和Form C)，其具有独特的X射线衍射图案和差示扫描量热分析谱，以及独特的晶体结构。
• Methods of synthesizing substituted purine compounds
  申请人：Epizyme, Inc.

  公开号：US10968247B2

  公开（公告）日：2021-04-06

  The present invention provides an efficient process for the synthesis of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof and methods for treating disorders in which DOT1-mediated protein methylation plays a part, such as cancer and neurological disorders, by administering these compounds and pharmaceutical compositions to subjects in need thereof. The present invention also provides novel crystalline forms of (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol and hydrates thereof (Form A, Form B, and Form C), characterized by a unique X-ray diffraction pattern and Differential Scanning Calorimetry profile, as well as a unique crystalline structure.

  本发明提供了一种用于合成(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3、4-二醇及其水合物，以及通过向有需要的受试者施用这些化合物和药物组合物来治疗由 DOT1 介导的蛋白质甲基化起作用的疾病（如癌症和神经系统疾病）的方法。本发明还提供了新型结晶形式的(2R,3R,4S,5R)-2-(6-氨基-9H-嘌呤-9-基)-5-((((1r,3S)-3-(2-(5-(叔丁基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)乙基)环丁基)(异丙基)氨基)甲基)四氢呋喃-3、4-二醇及其水合物（形式 A、形式 B 和形式 C），具有独特的 X 射线衍射图样和差示扫描量热曲线，以及独特的晶体结构。
• US9175032B2
  申请人：——

  公开号：US9175032B2

  公开（公告）日：2015-11-03