Conformationally Constrained Analogues of Diacylglycerol (DAG). 16. How Much Structural Complexity Is Necessary for Recognition and High Binding Affinity to Protein Kinase C?
作者:Kassoum Nacro、Bruno Bienfait、Jeewoo Lee、Kee-Chung Han、Ji-Hye Kang、Samira Benzaria、Nancy E. Lewin、Dipak K. Bhattacharyya、Peter M. Blumberg、Victor E. Marquez
DOI:10.1021/jm9904607
日期:2000.3.1
modifying the DAG-lactone template with a combination of linear or branched acyl and alpha-alkylidene chains, which functioned as variable hydrophobic "affinity domains", helped identify compounds that optimized hydrophobic contacts with a group of conserved hydrophobic amino acids located on the top half of the C1 domain where the phorbol binds. The hydrophilic/hydrophobic balance of the molecules was estimated
具有低纳摩尔结合亲和力的有效蛋白激酶C(PK-C)配体的设计是通过结合使用基于生理酶激活剂二酰基甘油(DAG)的药效基团和受体指导的方法来完成的。以前使用基于DAG和佛波酯酯药效基团的结构等效性的方法,确定了用于构建半刚性“识别域”的固定模板,该模板包含受限制在内酯环(DAG)中的DAG的三个主要药效基团。 -内酯)。在目前的工作中,基于与佛波醇13-O-乙酸酯复合的PK-Cdelta C1b结构域的X射线结构,将药效团引导的方法改进到了更高的水平。一个系统的搜索,涉及用线性或支链酰基和α-亚烷基链的组合修饰DAG-内酯模板,它们起可变的疏水“亲和结构域”的作用,帮助鉴定了优化与一组保守的疏水氨基酸的疏水接触的化合物位于佛波结合的C1域的上半部分。分子的亲水/疏水平衡通过根据基于片段的方法计算出的辛醇/水分配系数(log P)进行估算。支链α-亚烷基或酰基链的存在对于达到PK-C的低纳摩尔