Discovery of Pyrazolo[1,5-<i>a</i>]pyrimidine B-Cell Lymphoma 6 (BCL6) Binders and Optimization to High Affinity Macrocyclic Inhibitors
作者:William McCoull、Roman D. Abrams、Erica Anderson、Kevin Blades、Peter Barton、Matthew Box、Jonathan Burgess、Kate Byth、Qing Cao、Claudio Chuaqui、Rodrigo J. Carbajo、Tony Cheung、Erin Code、Andrew D. Ferguson、Shaun Fillery、Nathan O. Fuller、Eric Gangl、Ning Gao、Matthew Grist、David Hargreaves、Martin R. Howard、Jun Hu、Paul D. Kemmitt、Jennifer E. Nelson、Nichole O’Connell、D. Bryan Prince、Piotr Raubo、Philip B. Rawlins、Graeme R. Robb、Junjie Shi、Michael J. Waring、David Whittaker、Marta Wylot、Xiahui Zhu
DOI:10.1021/acs.jmedchem.7b00359
日期:2017.5.25
identified a pyrazolo[1,5-a]pyrimidine series of BCL6 binders from a fragment screen in parallel with a virtual screen. Using structure-based drug design, binding affinity was increased 100000-fold. This involved displacing crystallographic water, forming new ligand–protein interactions and a macrocyclization to favor the bioactive conformation of the ligands. Optimization for slow off-rate constant kinetics
抑制B细胞淋巴瘤6(BCL6)和共抑制因子之间的蛋白相互作用是在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)癌症中的治疗目标,有效和选择性BCL6抑制剂的概况分析对于检验该假设至关重要。我们鉴定了吡唑并[1,5- a片段筛选中的] pyrimidine系列BCL6结合物与虚拟筛选平行。使用基于结构的药物设计,结合亲和力增加了100000倍。这包括置换结晶水,形成新的配体-蛋白质相互作用和大环化,以促进配体的生物活性构象。进行了慢速离解速率恒定动力学的优化,并提高了对脱靶激酶CK2的选择性。进一步优化了细胞BCL6分析的效价,以提供高度选择性的探针分子。在许多DLBCL细胞系和多发性骨髓瘤细胞系中仅观察到微弱的抗增殖作用,而与BCL6的效力没有明显的关系。结果,我们得出结论,DLBCL癌症中的BCL6假设仍未得到证实。