(7-甲基-2-氧代-2,3-二氢-1H-吲哚-3-基)乙酸 | 959241-61-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: (7-甲基-2-氧代-2,3-二氢-1H-吲哚-3-基)乙酸
• 英文名称: 2-(7-methyl-2-oxoindolin-3-yl)acetic acid
• 英文别名: (7-Methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indol-3-yl)acetic acid；2-(7-methyl-2-oxo-1,3-dihydroindol-3-yl)acetic acid
• CAS: 959241-61-3
• 化学式: C₁₁H₁₁NO₃
• 分子量: 205.213
• InChiKey: WUUIYXLJVZVXHC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  66.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 海关编码：
  2933790090
• WGK Germany：
  3
• 危险标志：
  GHS07
• 危险性描述：
  H302

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (7-甲基-2-氧代-2,3-二氢-1H-吲哚-3-基)乙酸 、 Methyl 4-aminobut-2-enoate;2,2,2-trifluoroacetic acid 在 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  一种基于片段的方法来发现半胱氨酸蛋白酶的不可逆共价抑制剂

  摘要：

  报道了一种新的基于片段的药物发现方法，该方法不可逆地将类药物片段束缚在催化半胱氨酸上。我们将亲电试剂连接到 100 个片段上，而亲电试剂的反应性没有显着改变。质谱分析发现了半胱氨酸蛋白酶木瓜蛋白酶的三种非肽抑制剂。鉴定出的化合物显示出不可逆抑制剂的特征。不可逆的束缚系统也显示出特异性：三种鉴定出的木瓜蛋白酶抑制剂不与 UbcH7、USP08 或带有 GST 标签的人类鼻病毒 3C 蛋白酶共价反应。

  DOI：

  10.1021/jm500345q

文献信息

• Novel HIV-1 capsid-targeting small molecules of the PF74 binding site
  作者：Lei Wang、Mary C. Casey、Sanjeev Kumar V. Vernekar、Rajkumar Lalji Sahani、Jayakanth Kankanala、Karen A. Kirby、Haijuan Du、Atsuko Hachiya、Huanchun Zhang、Philip R. Tedbury、Jiashu Xie、Stefan G. Sarafianos、Zhengqiang Wang

  DOI：10.1016/j.ejmech.2020.112626

  日期：2020.10

  stability in liver microsomes. Molecular modeling was performed to verify compound binding to the PF74 site. In the end, 5-hydroxyindole analogs (8,9 and 12) showed improved potency (up to 20-fold) over PF74. Of the novel sub-chemotypes, α- and β-naphthyl analogs (33 and 27) exhibited sub micromolar antiviral potencies comparable to that of PF74. Interestingly, although only moderately inhibiting HIV-1 (single-digit

  HIV-1 衣壳蛋白 (CA) 中的PF74结合位点是一个引人注目的抗病毒药物靶点。尽管PF74通过与宿主因子竞争 CA 结合来赋予机械上不同的抗病毒表型，但它的代谢稳定性低得令人望而却步。因此，人们对设计新的PF74亚化学型越来越感兴趣。具有相似的结合模式和改善的代谢稳定性。我们在此报告了我们为设计新型 CA 靶向小分子而探索域间相互作用吲哚部分的努力。我们的设计包括对吲哚环的简单取代，更重要的是，用少数富电子环取代吲哚部分的新型亚化学型。合成并评估了所有 56 种新型类似物的抗病毒活性、细胞毒性和对 CA 六聚体稳定性的影响。对选定的类似物在肝微粒体中的代谢稳定性进行了测试。进行分子建模以验证化合物与PF74位点的结合。最后，5-羟基吲哚类似物（8，9和12）上显示出改善的效力（高达20倍）PF74。在新的亚化学型中，α-和 β-萘基类似物（33和27）表现出与PF74相当的亚微摩尔抗病毒效力。有趣的是，虽然仅适度抑制
• ANTIVIRAL COMPOUNDS
  申请人：REGENTS OF THE UNIVERSITY OF MINNESOTA

  公开号：US20210322416A1

  公开（公告）日：2021-10-21

  The invention provides a compound of formula I, formula II, or formula III: or a salt thereof, wherein R 1 -R 10 have any of the values described in the specification, as well as compositions comprising a compound of formula I. The compounds are useful as HIV-1 CA-targeting molecules and as antiviral agents.

  该发明提供了公式I、公式II或公式III的化合物：或其盐，其中R1-R10具有规范中描述的任何值，以及包含公式I化合物的组合物。这些化合物可用作HIV-1 CA靶向分子和抗病毒剂。
• Identification of non-peptidic cysteine reactive fragments as inhibitors of cysteine protease rhodesain
  作者：Danielle McShan、Stefan Kathman、Brittiney Lowe、Ziyang Xu、Jennifer Zhan、Alexander Statsyuk、Ifedayo Victor Ogungbe

  DOI：10.1016/j.bmcl.2015.08.074

  日期：2015.10

  Rhodesain, the major cathepsin L-like cysteine protease in the protozoan Trypanosoma brucei rhodesiense, the causative agent of African sleeping sickness, is a well-validated drug target. In this work, we used a fragment-based approach to identify inhibitors of this cysteine protease, and identified inhibitors of T. brucei. To discover inhibitors active against rhodesain and T. brucei, we screened a library of covalent fragments against rhodesain and conducted preliminary SAR studies. We envision that in vitro enzymatic assays will further expand the use of the covalent tethering method, a simple fragment-based drug discovery technique to discover covalent drug leads. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• A Fragment-Based Method to Discover Irreversible Covalent Inhibitors of Cysteine Proteases
  作者：Stefan G. Kathman、Ziyang Xu、Alexander V. Statsyuk

  DOI：10.1021/jm500345q

  日期：2014.6.12

  reported which irreversibly tethers drug-like fragments to catalytic cysteines. We attached an electrophile to 100 fragments without significant alterations in the reactivity of the electrophile. A mass spectrometry assay discovered three nonpeptidic inhibitors of the cysteine protease papain. The identified compounds display the characteristics of irreversible inhibitors. The irreversible tethering system

  报道了一种新的基于片段的药物发现方法，该方法不可逆地将类药物片段束缚在催化半胱氨酸上。我们将亲电试剂连接到 100 个片段上，而亲电试剂的反应性没有显着改变。质谱分析发现了半胱氨酸蛋白酶木瓜蛋白酶的三种非肽抑制剂。鉴定出的化合物显示出不可逆抑制剂的特征。不可逆的束缚系统也显示出特异性：三种鉴定出的木瓜蛋白酶抑制剂不与 UbcH7、USP08 或带有 GST 标签的人类鼻病毒 3C 蛋白酶共价反应。