(S)-5-硝基-2-(戊-4-烯-2-氧基)苯甲酸 | 1255213-22-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: (S)-5-硝基-2-(戊-4-烯-2-氧基)苯甲酸
• 英文名称: 5-nitro-2-[(2S)-pent-4-en-2-yl]oxybenzoic acid
• CAS: 1255213-22-9
• 化学式: C₁₂H₁₃NO₅
• 分子量: 251.239
• InChiKey: CXZUUYDSTHJTMZ-QMMMGPOBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  92.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-5-硝基-2-(戊-4-烯-2-氧基)苯甲酸 在 2,6-二甲基吡啶 、 Hoveyda-Grubbs catalyst second generation 、 palladium 10% on activated carbon 、 叔丁基二甲硅基三氟甲磺酸酯 、 四丁基氟化铵 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 氢气 、 sodium hydride 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 1-((2S,8R,9R)-11-((S)-1-((4-methoxybenzyl)oxy)propan-2-yl)-2,9-dimethyl-8-((methylamino)methyl)-12-oxo-3,4,5,6,9,10,11,12-octahydro-2H,8H-benzo[b][1,9]dioxa[5]azacyclotetradecin-14-yl)-3-phenylurea
  参考文献：
  名称：

  Diversity-Oriented Synthesis Yields a Novel Lead for the Treatment of Malaria

  摘要：

  Here, we describe the discovery of a novel antimalarial agent using phenotypic screening of Plasmodium falciparum asexual blood-stage parasites. Screening a novel compound collection created using diversity-oriented synthesis (DOS) led to the initial hit. Structure activity relationships guided the synthesis of compounds having improved potency and water solubility, yielding a subnanomolar inhibitor of parasite asexual blood-stage growth. Optimized compound 27 has an excellent off-target activity profile in erythrocyte lysis and HepG2 assays and is stable in human plasma. This compound is available via the molecular libraries probe production centers network (MLPCN) and is designated ML238.

  DOI：

  10.1021/ml200244k
• 作为产物：
  描述：

  (R)-(-)-4-烯基-2-戊醇 在 偶氮二甲酸二异丙酯 、 水 、 三苯基膦 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 (S)-5-硝基-2-(戊-4-烯-2-氧基)苯甲酸
  参考文献：
  名称：

  用于合成中型和大型环的基于羟醛的构建/偶联/配对策略：大环组蛋白脱乙酰酶抑制剂的发现

  摘要：

  应用基于羟醛的构建/耦合/配对 (B/C/P) 策略来生成立体化学和骨架不同的小分子的集合。在构建阶段，进行了一系列不对称的合成和反羟醛反应以产生 Boc 保护的 γ-氨基酸的四种立体异构体。此外，还生成了 O-PMB 保护的丙氨醇的两种立体异构体，以提供手性胺偶联伙伴。在偶联步骤中，通过偶联手性酸和胺结构单元合成了八种立体异构酰胺。随后将酰胺还原以生成相应的仲胺。在配对相中，采用了三种不同的反应来实现分子内成环过程：亲核芳香取代 (S(N)Ar)、Huisgen [3+2] 环加成和闭环复分解 (RCM)。尽管存在一些立体化学依赖性，但对成环反应进行了优化，以从良好到极好的产率进行，提供了大小从 8 到 14 元环的各种骨架。由 RCM 配对反应产生的支架在固相上多样化，以产生 14 400 成员的大环内酰胺文库。对该文库的筛选导致发现了一类新的组蛋白去乙酰化酶抑制剂，其表现出混合酶抑制

  DOI：

  10.1021/ja105119r

文献信息

• Diversity-Oriented Synthesis-Facilitated Medicinal Chemistry: Toward the Development of Novel Antimalarial Agents
  作者：Eamon Comer、Jennifer A. Beaudoin、Nobutaka Kato、Mark E. Fitzgerald、Richard W. Heidebrecht、Maurice duPont Lee、Daniela Masi、Marion Mercier、Carol Mulrooney、Giovanni Muncipinto、Ann Rowley、Keila Crespo-Llado、Adelfa E. Serrano、Amanda K. Lukens、Roger C. Wiegand、Dyann F. Wirth、Michelle A. Palmer、Michael A. Foley、Benito Munoz、Christina A. Scherer、Jeremy R. Duvall、Stuart L. Schreiber

  DOI：10.1021/jm500994n

  日期：2014.10.23

  Here, we describe medicinal chemistry that was accelerated by a diversity-oriented synthesis (DOS) pathway, and in vivo studies of our previously reported macrocyclic antimalarial agent that derived from the synthetic pathway. Structure-activity relationships that focused on both appendage and skeletal features yielded a nanomolar inhibitor of P. falciparum asexual blood-stage growth with improved solubility and microsomal stability and reduced hERG binding. The build/couple/pair (B/C/P) synthetic strategy, used in the preparation of the original screening library, facilitated medicinal chemistry optimization of the antimalarial lead.
• [EN] MACROLACTAM COMPOUNDS AND METHODS FOR THE TREATMENT OF MALARIA<br/>[FR] COMPOSÉS MACROLACTAMES ET MÉTHODES DE TRAITEMENT DU PALUDISME
  申请人：BROAD INST INC

  公开号：WO2012142457A2

  公开（公告）日：2012-10-18

  The present invention relates to a macrolactam compound, and methods for treating a subject with malaria using the macrolactam compound, represented by the following structural formula (l), wherein the values and preferred values of the variables are defined herein.
• An Aldol-Based Build/Couple/Pair Strategy for the Synthesis of Medium- and Large-Sized Rings: Discovery of Macrocyclic Histone Deacetylase Inhibitors
  作者：Lisa A. Marcaurelle、Eamon Comer、Sivaraman Dandapani、Jeremy R. Duvall、Baudouin Gerard、Sarathy Kesavan、Maurice D. Lee、Haibo Liu、Jason T. Lowe、Jean-Charles Marie、Carol A. Mulrooney、Bhaumik A. Pandya、Ann Rowley、Troy D. Ryba、Byung-Chul Suh、Jingqiang Wei、Damian W. Young、Lakshmi B. Akella、Nathan T. Ross、Yan-Ling Zhang、Daniel M. Fass、Surya A. Reis、Wen-Ning Zhao、Stephen J. Haggarty、Michelle Palmer、Michael A. Foley

  DOI：10.1021/ja105119r

  日期：2010.12.1

  Despite some stereochemical dependencies, the ring-forming reactions were optimized to proceed with good to excellent yields, providing a variety of skeletons ranging in size from 8- to 14-membered rings. Scaffolds resulting from the RCM pairing reaction were diversified on the solid phase to yield a 14 400-membered library of macrolactams. Screening of this library led to the discovery of a novel class

  应用基于羟醛的构建/耦合/配对 (B/C/P) 策略来生成立体化学和骨架不同的小分子的集合。在构建阶段，进行了一系列不对称的合成和反羟醛反应以产生 Boc 保护的 γ-氨基酸的四种立体异构体。此外，还生成了 O-PMB 保护的丙氨醇的两种立体异构体，以提供手性胺偶联伙伴。在偶联步骤中，通过偶联手性酸和胺结构单元合成了八种立体异构酰胺。随后将酰胺还原以生成相应的仲胺。在配对相中，采用了三种不同的反应来实现分子内成环过程：亲核芳香取代 (S(N)Ar)、Huisgen [3+2] 环加成和闭环复分解 (RCM)。尽管存在一些立体化学依赖性，但对成环反应进行了优化，以从良好到极好的产率进行，提供了大小从 8 到 14 元环的各种骨架。由 RCM 配对反应产生的支架在固相上多样化，以产生 14 400 成员的大环内酰胺文库。对该文库的筛选导致发现了一类新的组蛋白去乙酰化酶抑制剂，其表现出混合酶抑制
• Diversity-Oriented Synthesis Yields a Novel Lead for the Treatment of Malaria
  作者：Richard W. Heidebrecht、Carol Mulrooney、Christopher P. Austin、Robert H. Barker、Jennifer A. Beaudoin、Ken Chih-Chien Cheng、Eamon Comer、Sivaraman Dandapani、Justin Dick、Jeremy R. Duvall、Eric H. Ekland、David A. Fidock、Mark E. Fitzgerald、Michael Foley、Rajarshi Guha、Paul Hinkson、Martin Kramer、Amanda K. Lukens、Daniela Masi、Lisa A. Marcaurelle、Xin-Zhuan Su、Craig J. Thomas、Michel Weïwer、Roger C. Wiegand、Dyann Wirth、Menghang Xia、Jing Yuan、Jinghua Zhao、Michelle Palmer、Benito Munoz、Stuart Schreiber

  DOI：10.1021/ml200244k

  日期：2012.2.9

  Here, we describe the discovery of a novel antimalarial agent using phenotypic screening of Plasmodium falciparum asexual blood-stage parasites. Screening a novel compound collection created using diversity-oriented synthesis (DOS) led to the initial hit. Structure activity relationships guided the synthesis of compounds having improved potency and water solubility, yielding a subnanomolar inhibitor of parasite asexual blood-stage growth. Optimized compound 27 has an excellent off-target activity profile in erythrocyte lysis and HepG2 assays and is stable in human plasma. This compound is available via the molecular libraries probe production centers network (MLPCN) and is designated ML238.