Targeting Protein–Protein Interactions of Tyrosine Phosphatases with Microarrayed Fragment Libraries Displayed on Phosphopeptide Substrate Scaffolds
作者:Megan Hogan、Medhanit Bahta、Kohei Tsuji、Trung X. Nguyen、Scott Cherry、George T. Lountos、Joseph E. Tropea、Bryan M. Zhao、Xue Zhi Zhao、David S. Waugh、Terrence R. Burke、Robert G. Ulrich
DOI:10.1021/acscombsci.8b00122
日期:2019.3.11
derivatized peptide library was printed in microarrays on nitrocellulose-coated glass surfaces for assessment of PTPase catalytic activity or on gold monolayers for analysis of kinetic interactions by surface plasmon resonance (SPR). Focusing on amino acid positions and chemical features, we first analyzed dephosphorylation of the peptide pTyr residues within the microarrayed library by the human dual-specificity
仅关注催化事件的化学文库筛选方法可能会忽略蛋白质-蛋白质相互作用的独特作用,这种作用可用于开发特定的抑制剂。嵌入肽基序中的磷酸酪氨酰(pTyr)残基包含确定蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTPases)底物特异性的最小识别元件。我们将含氨基氧基的氨基酸残基掺入7个残基的表皮生长因子受体(EGFR)衍生的含磷酸酪氨酸的肽中,并使该肽通过与含醛类药物官能团反应而进行溶液相肟多样化。pTyr残基未修饰。将所得的衍生肽文库以微阵列形式印刷在硝酸纤维素涂层的玻璃表面上,以评估PTPase的催化活性,或印刷在金单层上,以通过表面等离振子共振(SPR)分析动力学相互作用。关注氨基酸位置和化学特征,我们首先分析了人双特异性磷酸酶(DUSP)DUSP14和DUSP22以及痘病毒(VH1)和鼠疫耶尔森氏菌(P. YopH)。为了鉴定最高亲和力的肟基序,使用非催化PTPase突变体通过SPR检测了活性最高的衍生化磷酸肽的