氨基甲酸N,N'-[(3-氨丙基)碳亚氨基]双-,C,C'-双(1,1-二甲基乙基)酯 | 214151-16-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 氨基甲酸N,N'-[(3-氨丙基)碳亚氨基]双-,C,C'-双(1,1-二甲基乙基)酯
• 英文名称: 3-[2,3-bis(tert-butoxycarbonyl)guanidino]propylamine
• 英文别名: N,N'-bis-Boc-N''-(3-aminopropyl)guanidine；tert-butyl N-{[(3-aminopropyl)amino]({[(tert-butoxy)carbonyl]amino})methylidene}carbamate；tert-butyl N-[N'-(3-aminopropyl)-N-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]carbamimidoyl]carbamate
• CAS: 214151-16-3
• 化学式: C₁₄H₂₈N₄O₄
• 分子量: 316.401
• InChiKey: MERZIXRCYCOFLI-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  168-170 °C(Solv: ethanol (64-17-5))
• 密度：
  1.12±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  氨基甲酸N,N'-[(3-氨丙基)碳亚氨基]双-,C,C'-双(1,1-二甲基乙基)酯 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  西尼罗河病毒NS2B / NS3丝氨酸蛋白酶的新型胍丁胺和类胍胺肽模拟物抑制剂

  摘要：

  该信息通报了西尼罗河病毒NS2B / NS3蛋白酶的新型非共价拟肽抑制剂的合成和抑制活性，该抑制剂含有脱羧化的P1精氨酸（胍丁胺； 4-氨基丁基胍）和相关类似物。一种胍丁胺肽模拟物（4-苯基-苯乙酰基-Lys-Lys-胍丁胺;化合物2）显示为竞争性抑制剂，结合亲和力为K i 2.05±0.13μM，对凝血酶没有活性（IC 50 > 100μM）。我们的结果表明，与含反应性亲电战斗部的抑制剂相比，由于它们的相对稳定性和化学合成的简便性，在P1位置具有胍丁胺的拟肽可能被用作设计非共价竞争性蛋白酶抑制剂的起始工具。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2011.04.055
• 作为产物：
  描述：

  1,3-二-BOC-2-(三氟甲基磺酰)胍 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 氨基甲酸N,N'-[(3-氨丙基)碳亚氨基]双-,C,C'-双(1,1-二甲基乙基)酯
  参考文献：
  名称：

  Tobramycin analogues with C-5 aminoalkyl ether chains intended to mimic rings III and IV of paromomycin

  摘要：

  Based on available X-ray structural and modeling data, a series of tobramycin derivatives with C-5 ether chains bearing basic groups were synthesized. These were intended to be hybrid molecules that combine features of tobramycin and paromomycin. Their binding to ribosomes and their antibacterial activity were determined. The 5-O-(2-guanidylethyl) ether of tobramycin (9g) was the most active analogue in the series. (C) 2003 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(02)01624-1

文献信息

• Preparation of l-proline based aeruginosin 298-A analogs: Optimization of the P1-moiety
  作者：Guijun Wang、Navneet Goyal、Branden Hopkinson

  DOI：10.1016/j.bmcl.2009.04.056

  日期：2009.7

  residue. The structure optimization was focused on modification of the P1 position. In choosing the P1 group, an effort was made to avoid using the highly basic guanidine groups present in nearly all naturally occurring aeruginosins. The synthesis and enzyme assays of these aeruginosin analogs against thrombin and trypsin are reported. We found that several compounds with neutral P1 groups exhibit excellent

  铜绿素是一族天然的寡肽，具有共同的双环氨基酸核心结构。该家族中的许多化合物都是丝氨酸蛋白酶的抑制剂，例如凝血酶和胰蛋白酶。凝血酶是凝血级联反应中的重要酶，并且是抗凝药物开发的有希望的靶标。为了了解结构-活性关系（SAR）并找到选择性的凝血酶抑制剂，我们合成了一系列铜绿菌素298-A类似物，其中P 2双环氨基酸被1-脯氨酸残基取代。结构优化的重点是修改P 1位置。在选择P 1时为了避免这种情况，人们努力避免使用几乎所有天然存在的铜绿素酶中都存在的高碱性胍基。报道了这些铜绿素类似物针对凝血酶和胰蛋白酶的合成和酶测定。我们发现几种具有中性P 1基团的化合物相对于胰蛋白酶表现出优异的选择性，并且对凝血酶具有良好的效力。此处获得的P 1基团的SAR数据可用于制备对胰蛋白酶具有更好选择性的其他凝血酶抑制剂。
• An Optimised Synthesis of 2-[2,3-Bis(tert-butoxycarbonyl)guanidino]ethylamine
  作者：Frederick Pfeffer、Shane Hickey、Trent Ashton、Simren Khosa

  DOI：10.1055/s-0031-1290698

  日期：2012.7

  This short report describes an improved, reliable, and high-yielding (>90%) synthesis of 2-[2,3-bis(tert-butoxycarbonyl)guanidino]ethylamine. The method is scalable (>5 g), and the product obtained directly from the reaction mixture requires no further purification. In addition, this methodology can be successfully applied to other diamine substrates (1,3-propyl and 1,4-butyl; 70% and 61% yield, respectively)

  这份简短的报告描述了 2-[2,3-双(叔丁氧基羰基)胍基]乙胺的改进、可靠和高产率 (>90%) 合成。该方法是可扩展的 (>5 g)，直接从反应混合物中获得的产物不需要进一步纯化。此外，该方法可以成功应用于其他二胺底物（1,3-丙基和 1,4-丁基；产率分别为 70% 和 61%）。
• Synthesis and evaluation of cationic norbornanes as peptidomimetic antibacterial agents
  作者：Shane M. Hickey、Trent D. Ashton、Simren K. Khosa、Ryan N. Robson、Jonathan M. White、Jian Li、Roger L. Nation、Heidi Y. Yu、Alysha G. Elliott、Mark S. Butler、Johnny X. Huang、Matthew A. Cooper、Frederick M. Pfeffer

  DOI：10.1039/c5ob00621j

  日期：——

  A series of structurally amphiphilic biscationic norbornanes have been synthesised as rigidified, low molecular weight peptidomimetics of cationic antimicrobial peptides. A variety of charged hydrophilic functionalities were attached to the norbornane scaffold including aminium, guanidinium, imidazolium and pyridinium moieties. Additionally, a range of hydrophobic groups of differing sizes were incorporated

  已经合成了一系列结构两亲的双阳离子降冰片烷作为阳离子抗微生物肽的刚性，低分子量拟肽。将各种带电的亲水性官能团连接到降冰片烷骨架上，包括铵，胍，咪唑鎓和吡啶鎓部分。另外，通过缩醛键结合了一系列不同尺寸的疏水基团。评价化合物对革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的抗菌活性。在整个系列中都观察到了活动；其中最有效的药物对肺炎链球菌，粪肠球菌和几种金黄色葡萄球菌菌株的MIC≤1μgmL -1包括多重耐药性耐甲氧西林（mMRSA），中间糖肽（GISA）和中间万古霉素（VISA）金黄色葡萄球菌。
• Histone H4-based peptoids are inhibitors of protein arginine methyltransferase 1 (PRMT1)
  作者：Sarah A. Mann、Megan K. DeMart、Braidy May、Corey P. Causey、Bryan Knuckley

  DOI：10.1042/bcj20200534

  日期：2020.8.28

  called the protein arginine methyltransferases (PRMTs). This modification can lead to transcriptional activation or repression of cancer-related genes. To date, a number of inhibitors, based on natural peptide substrates, have been developed for the PRMT family of enzymes. However, because peptides are easily degraded in vivo, the utility of these inhibitors as potential therapeutics is limited. The

  精氨酸残基的甲基化发生在许多蛋白质底物上，最显着的是组蛋白的N末端尾巴，并被称为蛋白精氨酸甲基转移酶（PRMT）的一族酶催化。这种修饰可导致癌症相关基因的转录激活或抑制。迄今为止，已经为PRMT酶家族开发了许多基于天然肽底物的抑制剂。但是，由于肽在体内容易降解，因此这些抑制剂作为潜在治疗剂的用途受到限制。使用类肽是肽模拟物，其中氨基酸侧链连接到酰胺主链上的氮而不是α-碳上，可以避免与肽降解有关的问题。鉴于结构上的相似之处，类肽支架可提供增强的稳定性，同时保留作用机理。在本文中，我们已经确定基于天然肽底物的类肽不会被PRMT1催化生成产物，而是该酶的抑制剂。减少类肽的长度可减少抑制作用，并表明远离修饰位点的残基对于结合很重要。此外，N末端的正电荷有助于促进结合并改善抑制作用。基于对PRMT1相对于PRMT5具有中等选择性的抑制作用，家族成员之间的选择性可能是可能的，并且提供了可用于开发针对此
• Rational Design, Synthesis, and X-ray Structure of Selective Noncovalent Thrombin Inhibitors
  作者：Jürgen Wagner、Jörg Kallen、Claus Ehrhardt、Jean-Pierre Evenou、Dieter Wagner

  DOI：10.1021/jm981013e

  日期：1998.9.1

  We have designed, synthesized, and tested in vitro a novel class of noncovalent thrombin inhibitors. The main feature of these inhibitors is a 6,5-fused bicyclic core structure that fills the S2 pocket of the active site of thrombin. The bicycle introduces conformational constraint into the ligand and locks the Xaa-Pro amide bond into the desired trans configuration. Among the known ring systems, we

  我们已经设计，合成和体外测试了一类新型的非共价凝血酶抑制剂。这些抑制剂的主要特征是6,5-稠合的双环核心结构，该结构充满了凝血酶活性位点的S2口袋。自行车将构象约束引入配体中，并将​​Xaa-Pro酰胺键锁定为所需的反式构型。在已知的环系统中，我们通过分子建模选择了7-噻吩并吲哚并酮（BTD）作为我们的基本模板。分析了几个结构特征的影响：精氨酸侧链的长度，C6处的立体化学以及优化利用S3袋的重要性。最后，以2.3 A的分辨率获得了与凝血酶结合的抑制剂15的X射线晶体结构。这些设计的凝血酶抑制剂，通过高效合成制备的蛋白质显示出比胰蛋白酶和其他丝氨酸蛋白酶高的选择性。基于通过X射线晶体学获得的信息的进一步推导当然应该允许提高效力。