2,4-二氨基-5-羟甲基嘧啶 | 42310-45-2

• 物质功能分类: 医药中间体 - 嘧啶类化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 2,4-二氨基-5-羟甲基嘧啶
• 英文名称: 2,4-diamino-5-hydroxymethyl-pyrimidine
• 英文别名: (2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methanol；2,4-Diamino-5-hydroxymethyl-pyrimidin；2,4-Diamino-5-pyrimidinemethanol
• CAS: 42310-45-2
• 化学式: C₅H₈N₄O
• mdl: MFCD06410821
• 分子量: 140.145
• InChiKey: MMDZZHAZMNJFMW-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  265 °C (decomp)
• 沸点：
  502.0±58.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.486±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  98
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,4-二氨基-5-羟甲基嘧啶 在 氢溴酸 、 溶剂黄146 作用下， 生成 2,4-diamino-5-bromomethylpyrimidine hydrobromide
  参考文献：
  名称：

  机会病原菌新型二氢叶酸还原酶抑制剂的设计，合成，生物学评价和计算研究

  摘要：

  目前的工作涉及新型，多样的化合物的设计，合成和生物学评估，这些化合物可作为机会微生物中二氢叶酸还原酶（DHFR）的潜在抑制剂。卡氏肺孢子虫（pc），弓形虫（tg）和鸟分枝 杆菌（嘛）。设计了一组14种结构多样的化合物，这些化合物具有DHFR抑制剂的关键药理学特征，远侧大体积取代以及连接远侧部分和2,4-二氨基嘧啶核的不同桥。合成了设计的化合物，并在酶分析中针对pc，tg和ma DHFR进行了评估。大鼠肝脏（rI）DHFR被用作哺乳动物标准品。作为该项目的下一个逻辑步骤，进行了灵活的分子对接研究，以预测这些化合物在pcDHFR活性位点的结合方式，并使用MM-GBSA协议对获得的对接位姿进行后处理，以预测相对结合亲和力。在大多数情况下，预测的结合模式能够使实验结果合理化。特别令人感兴趣的是，对接分数和MM-GBSA预测的ΔG结合能够区分活性化合物和低活性化合物。此外，在IC 50值和MM-GBSA预测的ΔG结合之间获得了0

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2010.03.031
• 作为产物：
  描述：

  2,4-二氨基嘧啶-5-甲醛 在 sodium tetrahydroborate 、 水 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以55.4%的产率得到2,4-二氨基-5-羟甲基嘧啶
  参考文献：
  名称：

  机会病原菌新型二氢叶酸还原酶抑制剂的设计，合成，生物学评价和计算研究

  摘要：

  目前的工作涉及新型，多样的化合物的设计，合成和生物学评估，这些化合物可作为机会微生物中二氢叶酸还原酶（DHFR）的潜在抑制剂。卡氏肺孢子虫（pc），弓形虫（tg）和鸟分枝 杆菌（嘛）。设计了一组14种结构多样的化合物，这些化合物具有DHFR抑制剂的关键药理学特征，远侧大体积取代以及连接远侧部分和2,4-二氨基嘧啶核的不同桥。合成了设计的化合物，并在酶分析中针对pc，tg和ma DHFR进行了评估。大鼠肝脏（rI）DHFR被用作哺乳动物标准品。作为该项目的下一个逻辑步骤，进行了灵活的分子对接研究，以预测这些化合物在pcDHFR活性位点的结合方式，并使用MM-GBSA协议对获得的对接位姿进行后处理，以预测相对结合亲和力。在大多数情况下，预测的结合模式能够使实验结果合理化。特别令人感兴趣的是，对接分数和MM-GBSA预测的ΔG结合能够区分活性化合物和低活性化合物。此外，在IC 50值和MM-GBSA预测的ΔG结合之间获得了0

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2010.03.031

文献信息

• 2,4-diamino-5-(1,2,3,4-tetrahydro-(substituted or
  申请人：Burroughs Wellcome Co.

  公开号：US04587341A1

  公开（公告）日：1986-05-06

  Compounds of the formula (II) ##STR1## or a salt, N-oxide or acyl derivative thereof, wherein Y is a group ##STR2## which is optionaly substituted and which optionally contain a nitrogen atom at one of positions A, B, C, D or E, in which the dotted line represents aromatic rings unless one of the rings contains a nitrogen atom in which case this ring is either aromatic or partially saturated, have antimicrobial properties. Processes for making these compounds, pharmaceutical compositions containing them and the medical use of the compounds are also disclosed.

  式（II）的化合物##STR1##或其盐、N-氧化物或酰基衍生物，其中Y是一个组##STR2##，可选择地被取代，并且可选择地在位置A、B、C、D或E之一含有氮原子，在这些位置中的虚线代表芳香环，除非其中一个环含有氮原子，在这种情况下，该环要么是芳香的，要么是部分饱和的，具有抗微生物特性。还公开了制备这些化合物的方法、含有它们的药物组合物以及这些化合物的医药用途。
• 2,4-Diamino-5-benzylpyrimidines and analogs as antibacterial agents. 10. 2,4-Diamino-5-(6-quinolylmethyl)- and -[(tetrahydro-6-quinolyl)methyl]pyrimidine derivatives. Further specificity studies
  作者：Barbara S. Rauckman、Mary Y. Tidwell、Jay V. Johnson、Barbara Roth

  DOI：10.1021/jm00128a040

  日期：1989.8

  A series of 18 2,4-diamino-5-[(1,2,3,4-tetrahydro-6-quinolyl)methyl]pyrimidines has been prepared by the condensation of 2,4-diamino-5-(hydroxymethyl)pyrimidine with 1,2,3,4-tetrahydroquinolines in acidic medium. Several derivatives were catalytically aromatized; others were synthesized from these by routine aromatic substitution or by condensations of (anilinomethyl)pyrimidines to give quinolinylmethyl

  通过缩合2,4-二氨基-5-（羟甲基）嘧啶制备了一系列18个2,4-二氨基-5-[（1,2,3,4-四氢-6-喹啉基）甲基]嘧啶与1,2,3,4-四氢喹啉在酸性介质中。几种衍生物被催化芳构化；通过常规的芳族取代或通过（苯胺基甲基）嘧啶的缩合，由它们合成其他化合物，得到喹啉基甲基类似物。具有4-甲基-8-甲氧基取代的化合物在结构上与甲氧苄氨嘧啶（1a）密切相关，并且是细菌二氢叶酸还原酶的优异抑制剂，其活性至少相当于1a。刚性芳族系列获得了最高的抑制程度，但四氢喹啉衍生物之间实现了更高的特异性。这与4-甲基-8-甲氧基衍生物的N-1取代直接相关。N-1周围的空间关系和该位置的质子化都可能影响选择性。这些化合物还具有优异的广谱体外抗菌活性。
• 2,4-Diamino-5-benzylpyrimidines and analogs as antibacterial agents. 6. A one-step synthesis of new trimethoprim derivatives and activity analysis by molecular modeling
  作者：Alexander Stuart、Thomas Paterson、Barbara Roth、Edward Aig

  DOI：10.1021/jm00359a009

  日期：1983.5

  ines. The use of 1,2,3-trimethoxybenzene in place of a phenol produces 2,4-diamino-5-(2,3,4-trimethoxybenzyl)pyrimidine, a trimethoprim isomer with low antibacterial activity. The use of molecular models of several of the new ortho-substituted derivatives in the active site of dihydrofolate reductase has provided a rational explanation for their activities relative to trimethoprim.

  已经开发出一种新的2，4-二氨基-5-（4-羟基苄基）嘧啶的路线，该路线涉及2，4-二氨基-5-（羟甲基）嘧啶与苯酚在酸性介质中的缩合。苯酚及其2,6-二烷基衍生物的使用仅产生5-（4-羟基苄基）嘧啶。然而，2，6-二甲氧基苯酚产生5-（3-羟基-2，4-二甲氧基苄基）-和5-（4-羟基-3，5-二甲氧基苄基）嘧啶的混合物。酚缩合已用于制备一系列烷基取代的5-（4-羟基苄基）-和5-（4-烷氧基苄基）嘧啶。用1,2,3-三甲氧基苯代替苯酚可产生2,4-二氨基-5-（2,3,4-三甲氧基苄基）嘧啶，这是一种抗菌活性低的甲氧苄啶异构体。
• Probing riboswitch–ligand interactions using thiamine pyrophosphate analogues
  作者：Liuhong Chen、Elena Cressina、Neil Dixon、Karl Erixon、Kwasi Agyei-Owusu、Jason Micklefield、Alison G. Smith、Chris Abell、Finian J. Leeper

  DOI：10.1039/c2ob07116a

  日期：——

  The Escherichia coli thiM riboswitch forms specific contacts with its natural ligand, thiamine pyrophosphate (TPP or thiamine diphosphate), allowing it to generate not only nanomolar binding affinity, but also a high degree of discrimination against similar small molecules. A range of synthetic TPP analogues have been used to probe each of the riboswitch–ligand interactions. The results show that the pyrimidine-sensing helix of thiM is exquisitely tuned to select for TPP by recognising the H-bonding donor and acceptors around its aminopyrimidine ring and also by forming π-stacking interactions that may be sensitive to the electronics of the ring. The central thiazolium ring of TPP appears to be more important for ligand recognition than previously thought. It may contribute to binding via long-range electrostatic interactions and/or by exerting an electron withdrawing effect on the pyrimidine ring, allowing its presence to be sensed indirectly and thereby allowing discrimination between thiamine (and its phosphate esters) and other aminopyrimidines found in vivo. The pyrophosphate moiety is essential for submicromolar binding affinity, but unexpectedly, it does not appear to be strictly necessary for modulation of gene expression.

  大肠杆菌中的thiM核糖开关能够与其天然配体硫胺素焦磷酸（TPP或硫胺素二磷酸）形成特异性接触，不仅能够产生纳摩尔级的结合亲和力，还能对类似的小分子展现出高度选择性。一系列合成的TPP类似物被用来探究核糖开关与配体之间的相互作用。结果显示，thiM的嘧啶感知螺旋经过精妙调整，通过识别其氨基嘧啶环周围的氢键供体和受体，以及可能对环电子性质敏感的π堆积相互作用，来选择TPP。TPP的中心噻唑环在配体识别中的重要性似乎比之前认为的更高。它可能通过长程静电相互作用和/或通过对嘧啶环施加电子 withdrawing 效应来促进结合，使得其存在能够被间接感知，从而在体内区分硫胺素（及其磷酸酯）与其他氨基嘧啶。焦磷酸部分对于亚微摩尔级的结合亲和力至关重要，但出乎意料的是，它似乎并不严格需要调控基因表达。
• 2,4-Diamino-5-benzylpyrimidines and analogs as antibacterial agents. 12. 1,2-Dihydroquinolylmethyl analogs with high activity and specificity for bacterial dihydrofolate reductase
  作者：Jay V. Johnson、Barbara S. Rauckman、David P. Baccanari、Barbara Roth

  DOI：10.1021/jm00128a042

  日期：1989.8

  Twelve 2,4-diamino-5-[(1,2-dihydro-6-quinolyl)methyl]pyrimidines containing gem-dimethyl or fluoromethyl substituents at the 2-position of the dihydroquinoline ring were prepared by condensations of dihydroquinolines with 2,4-diamino-5-(hydroxymethyl)pyrimidine. The dihydroquinolines were produced from the reaction of anilines with mesityl oxide or fluoroacetone. In some cases, 1-aryl-2,4-dimethylpyrroles

  通过二氢喹啉与2,4的缩合反应制得十二个2,4-二氨基-5-[（1,2-二氢-6-喹啉基）甲基]嘧啶，在二氢喹啉环的2位上含有二甲基或氟甲基取代基。 -二氨基-5-（羟甲基）嘧啶。二氢喹啉是由苯胺与氧化异丁烯或氟丙酮反应制得的。在某些情况下，获得了1-芳基-2,4-二甲基吡咯作为副产物。这些嘧啶中的大多数对大肠杆菌二氢叶酸还原酶（DHFR）具有高度抑制作用，并且对细菌酶具有高度特异性。2,4-二氨基-5-[[[1,2-二氢-2,4-二甲基-3-氟-2-（氟甲基）-8-甲氧基-6（1H）喹啉基]甲基]嘧啶的表观Ki值大肠杆菌DHFR比对照甲氧苄啶（13）低13倍，对细菌酶的选择性高出1个数量级。它在体外对革兰氏阳性生物具有出色的活性，以及​​与1相当的广谱抗菌活性。体内测试的结果将在其他地方报道。二氢喹啉衍生物的宝石-二甲基取代基被认为负责高选择性，并有助于有效抑制细菌DHFR。提出了分子模