2-(3-羟基丙基氨基)乙酸 | 100747-20-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 2-(3-羟基丙基氨基)乙酸
• 英文名称: N-(3- hydroxypropyl)glycine
• 英文别名: Glycine, N-(3-hydroxypropyl)-；2-(3-hydroxypropylamino)acetic acid
• CAS: 100747-20-4
• 化学式: C₅H₁₁NO₃
• 分子量: 133.147
• InChiKey: QIVWFDDLWNUYST-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.2
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  69.6
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(3-羟基丙基氨基)乙酸 在 氢氧化钾 、 sodium hydroxide 、 盐酸羟胺 、 caesium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 生成 [3-(6-Amino-purin-9-yl)-propyl]-hydroxycarbamoylmethyl-carbamic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  基于异羟肟酸酯的腺苷酸环化酶抑制剂。第1部分：无环接头对P位点结合的影响。

  摘要：

  腺苷酸环化酶（AC）是一类酶，由于其将ATP转化为cAMP的能力而成为信号转导的关键元素。这种转化的催化机制是通过ATP与嘌呤结合位点（P-位点）的初始结合而进行的，随后是金属介导的环化反应而失去了焦磷酸盐。用已知抑制剂对AC进行的晶体学分析表明，活性位点中存在两种金属。目前，已知腺苷酸环化酶的九种同工型，并且以组织特异性的方式表达独特的同工型组合。腺苷酸环化酶同工型特异性抑制剂的开发可能被证明是设计新型治疗剂的有用策略。为了开发新型AC抑制剂，我们选择了一种利用腺嘌呤环系统分子通过柔性无环接头与金属配位异羟肟酸连接的设计方法。对设计的抑制剂针对V AC型进行分析，其中接头的大小和杂原子含量发生变化，以探测酶中核苷酸和金属结合位点的相互作用。

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(02)00653-4
• 作为产物：
  描述：

  3,4,8,12b-tetrahydro-2H-benzo[f][1,3]oxazino[3,2-d][1,4]diazepin-7-one 在 水 作用下， 生成 2-氨基苯甲醛 、 2-(3-羟基丙基氨基)乙酸
  参考文献：
  名称：

  The Behavior of 1,4-Benzodiazepine Drugs in Acidic Media, Part XVII. Kinetics and Mechanism of the Acid-Base Equilibrium and the Hydrolysis of Benzodiazepinooxazines.

  摘要：

  我们对苯并二氮杂卓（BZINs）的六元恶嗪的开环和闭环（酸碱平衡）反应以及随后的二氮杂卓环水解进行了动力学研究，并与具有五元恶唑烷环的苯并二氮杂卓（BZOLs）的反应进行了比较。由于 BZINs 移动分子的自由度增加，BZINs 的开环反应比 BZOLs 慢。开环反应的速率几乎与 12b 位上的取代基（H-(1)、CH3-(2) 和 C6H5-(3)）无关，这表明攻击质子可以平等地（非立体地）接近 N5 原子的孤对子。提出了 BZIN 在溶液中的可能构象。对于 2 和 3，二氮杂环的裂解（水解）发生在 C12b-N5（亚氨基）键上，速度比相应的 BZOL 快 10-100 倍。与 2 和 3 相反，1 的水解发生在二氮杂环的酰胺键（N8-C7）上，而不是亚氨基键上，这与 11b 氢 BZOL 的情况类似。

  DOI：

  10.1248/cpb.39.3323

文献信息

• ——
  作者：Beate Greiner、Gerhard Breipohl、Eugen Uhlmann

  DOI：10.1002/1522-2675(200209)85:9<2619::aid-hlca2619>3.0.co;2-7

  日期：2002.9

  The automated on-line synthesis of DNA-3'-PNA chimeras 1-4 and (2'-O-methyl-RNA)-3'-PNA chimeras 5-8 is described, in which the 3'-terminal part of the oligonucleotide is linked to the N-terminal part of the PNA via N-(omega-hydroxyalkyl)-N-[(thymin-1-yl)acetyl]glycine units (alkyl = Et, Ph, Bu, and pentyl). By means of UV thermal denaturation, the binding affinities of all chimeras were directly compared by determining their T values in the duplex with complementary DNA and RNA. All investigated DNA-3'-PNA chimeras and (2'-O-methyl-RNA)-3'-PNA chimeras form more-stable duplexes with complementary DNA and RNA than the corresponding unmodified DNA. Interestingly, a N-(3-hydroxypropyl)glycine linker resulted in the highest binding affinity for DNA-3'-PNA chimeras, whereas the (2'-O-methyl-RNA)-3'-PNA chimeras showed optimal binding with the homologous N-(4-hydroxybutyl)glycine linker. The duplexes of (2'-O-methyl-RNA)-3'-PNA chimeras and RNA were significantly more stable than those containing the corresponding DNA-3'-PNA chimeras. Surprisingly, we found that the charged (2'-O-methyl-RNA)-3'-PNA chimera with a N-(4-hydroxybutyl)glycine-based unit at the junction to the PNA part shows the same binding affinity to RNA as uncharged PNA. Potential applications of (2'-O-methyl-RNA)-3'-PNA chimeras include their use as antisense agents acting by a RNase-independent mechanism of action, a prerequisite for antisense-oligonucleotide-mediated correction of aberrant splicing of pre-mRNA.
• Hydroxamate based inhibitors of adenylyl cyclase. Part 1: The effect of acyclic linkers on P-site binding
  作者：Daniel E Levy、Charles Marlowe、Kim Kane-Maguire、Ming Bao、Diana B Cherbavaz、James E Tomlinson、David M Sedlock、Robert M Scarborough

  DOI：10.1016/s0960-894x(02)00653-4

  日期：2002.11

  The adenylyl cyclases (ACs) are a family of enzymes that are key elements of signal transduction by virtue of their ability to convert ATP to cAMP. The catalytic mechanism of this transformation proceeds through initial binding of ATP to the purine binding site (P-site) followed by metal mediated cyclization with loss of pyrophosphate. Crystallographic analysis of ACs with known inhibitors reveals

  腺苷酸环化酶（AC）是一类酶，由于其将ATP转化为cAMP的能力而成为信号转导的关键元素。这种转化的催化机制是通过ATP与嘌呤结合位点（P-位点）的初始结合而进行的，随后是金属介导的环化反应而失去了焦磷酸盐。用已知抑制剂对AC进行的晶体学分析表明，活性位点中存在两种金属。目前，已知腺苷酸环化酶的九种同工型，并且以组织特异性的方式表达独特的同工型组合。腺苷酸环化酶同工型特异性抑制剂的开发可能被证明是设计新型治疗剂的有用策略。为了开发新型AC抑制剂，我们选择了一种利用腺嘌呤环系统分子通过柔性无环接头与金属配位异羟肟酸连接的设计方法。对设计的抑制剂针对V AC型进行分析，其中接头的大小和杂原子含量发生变化，以探测酶中核苷酸和金属结合位点的相互作用。
• The Behavior of 1,4-Benzodiazepine Drugs in Acidic Media, Part XVII. Kinetics and Mechanism of the Acid-Base Equilibrium and the Hydrolysis of Benzodiazepinooxazines.
  作者：Yukihisa KURONO、hidetoshi TANI、Tomonari KUWAYAMA、Keiichiro Hatano、Tamotsu YASHIRO、Ken IKEDA

  DOI：10.1248/cpb.39.3323

  日期：——

  Ring-opening and ring-closing (acid-base equilibrium) reactions of the six-membered oxazine of benzodiazepinoxazines (BZINs) and the subsequent hydrolyses of the diazepine ring have been investigated kinetically and compared with the reactions of benzodiazepinooxazoles (BZOLs) which have the five-membered oxazolidine ring. The ring-closing reaction for BZINs is slower than that for BZOLs due to the increase in the degree of freedom for the moving molety of BZINs. The rates of the ring-opening reactions are almost independent of the substituents at 12b-position (H-(1), CH3-(2), and C6H5-(3)), indicating that an attacking proton may approach equally (non-sterically) to the lone pair of N5 atoms. Possible conformational aspects of BZINs in solution are proposed. Cleavages (hydrolyses) of the diazepine ring occur at the C12b-N5 (iminium) bond for 2 and 3 and are 10-100 times faster than those for the corresponding BZOLs. For 1, in contrast to 2 and 3, hydrolysis of the amide bond (N8-C7) of the diazepine ring takes place instead of the iminium bond, similar to the case of 11b-hydrogen BZOL.

  我们对苯并二氮杂卓（BZINs）的六元恶嗪的开环和闭环（酸碱平衡）反应以及随后的二氮杂卓环水解进行了动力学研究，并与具有五元恶唑烷环的苯并二氮杂卓（BZOLs）的反应进行了比较。由于 BZINs 移动分子的自由度增加，BZINs 的开环反应比 BZOLs 慢。开环反应的速率几乎与 12b 位上的取代基（H-(1)、CH3-(2) 和 C6H5-(3)）无关，这表明攻击质子可以平等地（非立体地）接近 N5 原子的孤对子。提出了 BZIN 在溶液中的可能构象。对于 2 和 3，二氮杂环的裂解（水解）发生在 C12b-N5（亚氨基）键上，速度比相应的 BZOL 快 10-100 倍。与 2 和 3 相反，1 的水解发生在二氮杂环的酰胺键（N8-C7）上，而不是亚氨基键上，这与 11b 氢 BZOL 的情况类似。