2-(4-氨基-5-甲基-2-氧代-1(2H)-嘧啶基)-1,5-脱水-2-脱氧-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇 | 937031-52-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 中文名称: 2-(4-氨基-5-甲基-2-氧代-1(2H)-嘧啶基)-1,5-脱水-2-脱氧-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇
• 英文名称: 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-(5-methylcytosin-1-yl)-D-altro-hexitol
• 英文别名: 4-Amino-1-((2R,4aR,7R,8S,8aS)-8-hydroxy-2-phenylhexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl)-5-methylpyrimidin-2(1H)-one；1-[(2R,4aR,7R,8S,8aS)-8-hydroxy-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl]-4-amino-5-methylpyrimidin-2-one
• CAS: 937031-52-2
• 化学式: C₁₈H₂₁N₃O₅
• 分子量: 359.382
• InChiKey: MBNIDHHPLBOFCX-OWVAZHOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(4-氨基-5-甲基-2-氧代-1(2H)-嘧啶基)-1,5-脱水-2-脱氧-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇 、 氯甲酸-9-芴基甲酯 在 吡啶 作用下， 反应 2.0h， 以43%的产率得到1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-3-O-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-2-[N⁴-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-5-methylcytosin-1-yl]-D-altro-hexitol
  参考文献：
  名称：

  Fmoc 保护的 Altriitol 亚磷酰胺结构单元及其在合成 Altriitol 核酸 (ANA) 中的应用

  摘要：

  已经合成了以腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、胞嘧啶和 5-甲基胞嘧啶为碱基的 Fmoc 保护的阿曲糖醇核苷亚磷酰胺结构单元。这些构件用于合成阿曲糖醇核酸 (ANA) 和嵌合 ANA-RNA 寡核苷酸。虽然寡核苷酸的产率低于使用 3'-O-苯甲酰基保护的 atriitol 构建块获得的产率，但与 Pac-RNA 化学在嵌合寡核苷酸合成方面的出色兼容性使 Fmoc 成为了用于仲醇功能的有价值的保护基团用于寡核苷酸合成的核苷糖部分。（© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007）

  DOI：

  10.1002/ejoc.200600868
• 作为产物：
  描述：

  1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-(thymin-1-yl)-D-altro-hexitol 在 吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 1H-1,2,4-三唑 、 三氯氧磷 、 ammonium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 6.75h， 以55%的产率得到2-(4-氨基-5-甲基-2-氧代-1(2H)-嘧啶基)-1,5-脱水-2-脱氧-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇
  参考文献：
  名称：

  Fmoc 保护的 Altriitol 亚磷酰胺结构单元及其在合成 Altriitol 核酸 (ANA) 中的应用

  摘要：

  已经合成了以腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、胞嘧啶和 5-甲基胞嘧啶为碱基的 Fmoc 保护的阿曲糖醇核苷亚磷酰胺结构单元。这些构件用于合成阿曲糖醇核酸 (ANA) 和嵌合 ANA-RNA 寡核苷酸。虽然寡核苷酸的产率低于使用 3'-O-苯甲酰基保护的 atriitol 构建块获得的产率，但与 Pac-RNA 化学在嵌合寡核苷酸合成方面的出色兼容性使 Fmoc 成为了用于仲醇功能的有价值的保护基团用于寡核苷酸合成的核苷糖部分。（© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007）

  DOI：

  10.1002/ejoc.200600868