3-(2-chloropyrimidin-4-yl)-5-nitro-1H-indole | 1214264-45-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-(2-chloropyrimidin-4-yl)-5-nitro-1H-indole
• 英文别名: 3-(2-Chloro-4-pyrimidinyl)-5-nitro-1H-indole
• CAS: 1214264-45-5
• 化学式: C₁₂H₇ClN₄O₂
• 分子量: 274.666
• InChiKey: BGXWDROETWBICI-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  203 °C
• 沸点：
  597.4±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.548±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  87.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(2-chloropyrimidin-4-yl)-5-nitro-1H-indole 、 2,6-二甲基苯胺 在 对甲苯磺酸 作用下， 反应 18.0h， 以37%的产率得到N-(2,6-dimethylphenyl)-4-(5-nitro-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-amine
  参考文献：
  名称：

  基于结构的海洋衍生 Meridianin C 衍生物作为糖原合酶激酶 3β 抑制剂的设计，具有改善的口服生物利用度：从氨基嘧啶基吲哚到磺酰基类似物

  摘要：

  糖原合酶激酶 3β (GSK-3β) 已成为治疗糖尿病的有吸引力的靶点。化合物I是一种基于吲哚的 GSK-3β 抑制剂，由 Meridianin C 设计，Meridianin C 是一种从Aplidium meridianum中分离的海洋天然产物 (MNP) 。然而，该化合物对 GSK-3β 具有中等抑制活性（IC 50  = 24.4 μM），葡萄糖摄取中等（38%），尤其是口服生物利用度低（F = 11.4%）。在本研究中，应用基于结构的设计策略，在先导化合物I的基础上合成了一系列吲哚部分修饰的衍生物，随后评估了它们的细胞毒活性、抗高血糖活性和激酶抑制活性。在这个系列中，复合6x磺酰基在肌肉 L6 细胞中显示出最高的葡萄糖摄取 (83.5%)，对 GSK-3β 显示出更高的抑制活性 (IC 50  = 5.25 μM)。分子对接表明，与化合物I （-6.950 kcal/mol）相比，化合物6x正确插入到

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2021.105537
• 作为产物：
  描述：

  2,4-二氯嘧啶 、 5-硝基吲哚 在 aluminum (III) chloride 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 3.08h， 生成 3-(2-chloropyrimidin-4-yl)-5-nitro-1H-indole
  参考文献：
  名称：

  基于结构的海洋衍生 Meridianin C 衍生物作为糖原合酶激酶 3β 抑制剂的设计，具有改善的口服生物利用度：从氨基嘧啶基吲哚到磺酰基类似物

  摘要：

  糖原合酶激酶 3β (GSK-3β) 已成为治疗糖尿病的有吸引力的靶点。化合物I是一种基于吲哚的 GSK-3β 抑制剂，由 Meridianin C 设计，Meridianin C 是一种从Aplidium meridianum中分离的海洋天然产物 (MNP) 。然而，该化合物对 GSK-3β 具有中等抑制活性（IC 50  = 24.4 μM），葡萄糖摄取中等（38%），尤其是口服生物利用度低（F = 11.4%）。在本研究中，应用基于结构的设计策略，在先导化合物I的基础上合成了一系列吲哚部分修饰的衍生物，随后评估了它们的细胞毒活性、抗高血糖活性和激酶抑制活性。在这个系列中，复合6x磺酰基在肌肉 L6 细胞中显示出最高的葡萄糖摄取 (83.5%)，对 GSK-3β 显示出更高的抑制活性 (IC 50  = 5.25 μM)。分子对接表明，与化合物I （-6.950 kcal/mol）相比，化合物6x正确插入到

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2021.105537

文献信息

• Hexafluoroisopropanol/trifluoromethanesulfonic acid assists the synthesis of 3-(2-chloropyrimidin-4-yl)-1H-indoles
  作者：Shuai Liu、Fang Xia Pan、Yu Qi、Hai Yun Bai

  DOI：10.1016/j.tet.2023.133630

  日期：2023.10

  This work mainly reports a method of selectively functionalizing indole compounds using hexafluoroisopropanol (HFIP)/CF3SO3H to promote electrophilic substitution of Lewis acid activated indoles, providing a new approach for the synthesis of 3-(2-chloropyrimidin-4-yl)-1H-indoles. Compared with the existing approaches, our work expands the capabilities of synthesizing different 3-(2-chloropyrimidin-4-yl)-1H-indoles

  该工作主要报道了一种利用六氟异丙醇(HFIP)/CF 3 SO 3 H对吲哚类化合物进行选择性官能化以促进Lewis酸活化吲哚的亲电取代的方法，为3-(2-氯嘧啶-4-基)的合成提供了新的途径。 )-1 H-吲哚。与现有方法相比，我们的工作扩展了合成不同3-(2-氯嘧啶-4-基)-1 H-吲哚的能力，且收率高，为进一步开发重要的药物中间体提供了另一种实用方法。此外，对环境更友好的条件和更好的官能团耐受性展示了这种化学的实用性。
• One-pot synthesis of meridianins and meridianin analogues via indolization of nitrosoarenes
  作者：Francesco Tibiletti、Marco Simonetti、Kenneth M. Nicholas、Giovanni Palmisano、Matteo Parravicini、Federico Imbesi、Stefano Tollari、Andrea Penoni

  DOI：10.1016/j.tet.2009.12.020

  日期：2010.2

  Meridianins, marine alkaloids known as kinase Inhibitors with an indole skeleton, and meridianin analogues were produced regioselectivity and in moderate to good yields by thermal annulation of nitrosoarenes with 2-amino-4-ethynylpyrimidine and 2-chloro-4-ethynylpyrimidine, respectively, through a novel and atom-economical indolization process (C) 2009 Elsevier Ltd All rights reserved
• Structure-Based design of Marine-derived Meridianin C derivatives as glycogen synthase kinase 3β inhibitors with improved oral bioavailability: From aminopyrimidyl-indoles to the sulfonyl analogues
  作者：Shuwen Han、Wei Zhou、Chunlin Zhuang、Fener Chen

  DOI：10.1016/j.bioorg.2021.105537

  日期：2022.2

  product (MNP) isolated from Aplidium meridianum. However, this compound has a moderate inhibitory activity toward GSK-3β (IC50 = 24.4 μM), moderate glucose uptake (38%), and especially, a low oral bioavailability (F = 11.4%). In the present study, applying the structure-based design strategy, a series of derivatives modified on the indole moiety were synthesized based on the lead compound I, followed

  糖原合酶激酶 3β (GSK-3β) 已成为治疗糖尿病的有吸引力的靶点。化合物I是一种基于吲哚的 GSK-3β 抑制剂，由 Meridianin C 设计，Meridianin C 是一种从Aplidium meridianum中分离的海洋天然产物 (MNP) 。然而，该化合物对 GSK-3β 具有中等抑制活性（IC 50  = 24.4 μM），葡萄糖摄取中等（38%），尤其是口服生物利用度低（F = 11.4%）。在本研究中，应用基于结构的设计策略，在先导化合物I的基础上合成了一系列吲哚部分修饰的衍生物，随后评估了它们的细胞毒活性、抗高血糖活性和激酶抑制活性。在这个系列中，复合6x磺酰基在肌肉 L6 细胞中显示出最高的葡萄糖摄取 (83.5%)，对 GSK-3β 显示出更高的抑制活性 (IC 50  = 5.25 μM)。分子对接表明，与化合物I （-6.950 kcal/mol）相比，化合物6x正确插入到
• In(OTf)3 promoted sonochemical approach to 3-(2-chloropyrimidin-4-yl)indoles: their in silico and in vitro evaluation against SIRT1
  作者：Hemalatha Kotakommula、Vaishnavi Chintala、Satya Sree Nannapaneni、Naresh Kumar Katari、Ravikumar Kapavarapu、Manojit Pal

  DOI：10.1016/j.molstruc.2024.138471

  日期：2024.4

  A majority of compounds participated in H-bond interaction with GLN345 residue mainly through their indole “NH” moiety. However, higher binding affinities were observed for compounds possessing a sulfonamide moiety at C-5 position of the indole ring. Correlating the findings of studies a number of synthesized compounds showed inhibition of SIRT1 in vitro. With the inhibition > 70 % the compound and

  我们报告探索 3-(2-氯嘧啶-4-基)吲哚框架来鉴定新的 SIRT1 抑制剂。通过超声辅助杂芳基化方法合成了基于该框架的化合物库。该方法涉及 In(OTf) 介导的 2,4-二氯嘧啶和吲哚之间的 CC 键形成反应，以良好到可接受的收率得到所需产物。该方法的区域选择性似乎是一个关键特征，因为该方法涉及同时声化学取代 (i) 吲哚的 C-3 氢和 (ii) 嘧啶环的 C-4 氯基团。通过将一种合成化合物转化为天然存在的生物碱，证明了其合成应用。所制备的 3-(2-氯嘧啶-4-基)吲哚对接显示出与 SIRT1 的良好相互作用，此外，该蛋白相对于 SIRT2 可能具有选择性。大多数化合物主要通过其吲哚“NH”部分参与与 GLN345 残基的氢键相互作用。然而，对于在吲哚环的 C-5 位具有磺酰胺部分的化合物，观察到更高的结合亲和力。与研究结果相关联，许多合成化合物在体外显示出对 SIRT1 的抑制作用。该化合物的抑制率>