alternating L and D amino acids, is characterized by its wide central pore; upon insertion into membranes, it forms channels that disrupts ion gradients. We present helical peptidomimetics with this characteristic wide central pore that have been designed to mimic gramicidin A channels. Mimetics were designed using molecular modeling focused on oligomers of heterochiral dipeptides of proline analogs,
短杆菌肽 A 是一种由交替的 L 和 D
氨基酸制成的局部抗生素,其特点是中央孔宽;插入膜后,它会形成破坏离子梯度的通道。我们提出了螺旋
肽模拟物,它具有这种特征性的宽中央孔,旨在模拟
短杆菌肽 A 通道。模拟物是使用专注于脯
氨酸类似物异手性二肽寡聚体的分子模型设计的,特别是氮杂脯
氨酸 (AzPro)。
水中的分子动力学模拟证实了设计螺旋的稳定性。合成了十六个残基的甲酰基-(AzPro-Pro) 8 -NHCH 2 CH 2 OH 螺旋以及完整的三十二个残基 Cbz-(AzPro-Pro) 16 -O t卜渠道。没有观察到脂质体裂解活性,表明缺乏通道形成,可能是由于膜中不适当的氢键相互作用。与
短杆菌肽 A 不同,这些
肽模拟物也不会溶血红细胞。