6-(1-(2,6-difluorophenyl)ethyl)-5-methyl-3,4-dihydro-2-thioxopyrimidin-4(3H)-one | 255898-86-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 6-(1-(2,6-difluorophenyl)ethyl)-5-methyl-3,4-dihydro-2-thioxopyrimidin-4(3H)-one
• 英文别名: 6-[1-(2,6-difluorophenyl)ethyl]-5-methyl-2-thioxo-2,3-dihydropyrimidin-4(1H)-one；6-[1-(2,6-difluorophenyl)ethyl]-5-methyl-2-sulfanylidene-1H-pyrimidin-4-one
• CAS: 255898-86-3
• 化学式: C₁₃H₁₂F₂N₂OS
• 分子量: 282.314
• InChiKey: QVRYGAWBKFUTTJ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.36±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  73.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(1-(2,6-difluorophenyl)ethyl)-5-methyl-3,4-dihydro-2-thioxopyrimidin-4(3H)-one 在 间氯过氧苯甲酸 、 potassium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 62.0h， 生成 4-[1-(2,6-difluorophenyl)ethyl]-5-methyl-2-[methyl-[[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]methyl]amino]-1H-pyrimidin-6-one
  参考文献：
  名称：

  新型非核苷类逆转录酶抑制剂属于N-二氢烷氧基苄基氧嘧啶类（N-DABOs）家族的杀菌剂凝胶制剂的开发和体外评估

  摘要：

  通过使用阴道杀微生物剂来防止艾滋病毒传播是与艾滋病作斗争的重要课题。开发成功的杀菌剂既需要有效的抗HIV剂，又需要有效的制剂。在这方面，能够将HIV DNA整合到宿主细胞的遗传物质之前抑制HIV复制的分子，例如进入抑制剂或逆转录酶抑制剂（RTIs），是预防目的的理想候选物。在RTI，S-和N中-二氢烷氧基苄基氧嘧啶（S-DABO和N-DABO）是有趣的化合物，其在纳摩尔浓度下对野生型RT具有活性，并且对RT突变具有非常有趣的活性。本文中，合成了新的N-DABO，并作为抗HIV剂进行了测试。此外，通过分子建模研究了它们的结合方式。同时，开发了一种阴道杀菌剂凝胶制剂，并针对最有前途的候选药物进行了测试。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.5b01979
• 作为产物：
  描述：

  2,6-二氟苯乙酸 在 六甲基磷酰三胺 、 sodium ethanolate 、 三乙胺 、 magnesium chloride 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 正庚烷 、 乙基苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 9.83h， 生成 6-(1-(2,6-difluorophenyl)ethyl)-5-methyl-3,4-dihydro-2-thioxopyrimidin-4(3H)-one
  参考文献：
  名称：

  构象受限的新型2-烷硫基-6- [1-（2,6-二氟苯基）烷基] -3,4-二氢-5-烷基嘧啶-4（3H）-的结构设计，合成和生物学评估HIV-1逆转录酶的非核苷抑制剂。

  摘要：

  最近已将5-烷基-2-（烷硫基）-6-（2,6-二氟苄基）-3,4-二氢嘧啶-4（3H）-ones（S-DABOs，2）描述为一类新的人类免疫缺陷在纳摩尔浓度下具有活性的病毒1型（HIV-1）非核苷逆转录酶（RT）抑制剂（Mai，A. et al.J.Med.Chem.1999，42，619-627）。为了进行领先的优化工作，我们设计了新颖的构象受限的S-DABO，3，其苄基碳原子（Y = Me）和嘧啶5位（R = Me）具有甲基。构象分析和对接模拟表明，两种甲基的存在将显着降低构象柔性，而不会损害R对映异构体适合RT非核苷结合口袋的能力。要发展结构与活动的关系，我们准备了几种3型同源物，它们属于胸腺嘧啶（R = Me）和尿嘧啶（R = H）系列，具有各种2-烷硫基侧链（X = Me，i-Pr，n-Bu，i-Bu，s -Bu，c-戊基和c-己基）和不同于2,6-二氟苯基（Ar =苯基，2,

  DOI：

  10.1021/jm010853h

文献信息

• Domino Alkylation-Cyclization Reaction of Propargyl Bromides with Thioureas/Thiopyrimidinones: A New Facile Synthesis of 2-Aminothiazoles and 5H-Thiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-ones
  作者：Maurizio Botta、Daniele Castagnolo、Mafalda Pagano、Martina Bernardini

  DOI：10.1055/s-0029-1217700

  日期：2009.8

  A new synthesis of 2-aminothiazoles and 5H-thiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-ones was developed as a domino alkylation-cyclization reaction of propargyl bromides with thioureas and thio¬pyrimidinones, respectively. Domino reactions were performed under microwave irradiation leading to desired compounds in a few minutes and high yields

  2-氨基噻唑和5H-噻唑并[3,2-a]嘧啶-5-酮的新合成被开发为炔丙基溴分别与硫脲和硫代嘧啶酮的多米诺烷基化-环化反应。在微波辐射下进行多米诺骨牌反应，在几分钟内产生所需的化合物，产率高
• Synthesis, Biological Activity, and ADME Properties of Novel S-DABOs/N-DABOs as HIV Reverse Transcriptase Inhibitors
  作者：Marco Radi、Mafalda Pagano、Luigi Franchi、Daniele Castagnolo、Silvia Schenone、Gianni Casaluce、Claudio Zamperini、Elena Dreassi、Giovanni Maga、Alberta Samuele、Encarna Gonzalo、Bonaventura Clotet、José A. Esté、Maurizio Botta

  DOI：10.1002/cmdc.201200056

  日期：2012.5

  new series of S‐DABO/N‐DABO derivatives were synthesized to obtain additional SAR information on the C2‐position and in particular to improve ADME properties while maintaining a good activity profile against HIV‐1 RT. In vitro ADME properties (PAMPA permeation, water solubility, and metabolic stability) were also experimentally evaluated for the most interesting compounds to obtain a reliable indication

  以前旨在探索C2功能化S - DABOs SAR的研究表明，该位置的取代基在抑制野生型RT和耐药酶（尤其是K103N突变体）中起着关键作用。环丙基的引入使我们发现了一种有效的抑制剂，该抑制剂具有对野生型RT的皮摩尔活性和对许多关键突变体形式（如K103N）的纳摩尔活性。尽管该化合物具有出色的抗病毒特性，但它仍具有许多S- DABO类似物典型的次优ADME特性，但是，它可以作为抗HIV杀微生物剂的一种有前途的候选药物。在当前的工作中，新的S ‐DABO / N系列合成DABO衍生物以获得有关C2位置的其他SAR信息，尤其是在改善ADME特性的同时，还保持了针对HIV-1 RT的良好活性。还通过实验评估了最有趣的化合物的体外ADME特性（PAMPA渗透性，水溶性和代谢稳定性），以获得口服后血浆水平的可靠指示。
• 6-[1-(2,6-Difluorophenyl)ethyl]pyrimidinones Antagonize Cell Proliferation and Induce Cell Differentiation by Inhibiting (a Nontelomeric) Endogenous Reverse Transcriptase
  作者：Sara Bartolini、Antonello Mai、Marino Artico、Nicola Paesano、Dante Rotili、Corrado Spadafora、Gianluca Sbardella

  DOI：10.1021/jm0507330

  日期：2005.11.1

  transcriptase (endo-RT) in human differentiating cell systems to investigate their antiproliferative and cytodifferentiating activity. The two compounds significantly reduced cell proliferation and facilitated the morphological differentiation of cells. These results propose F(2)-DABOs as useful tools in preventive and/or curative therapy to counteract the loss of differentiation in dedifferentiating pathologies

  针对人类分化细胞系统中的内源性非端粒逆转录酶（endo-RT），测试了2种2,6-二氟-DABO衍生物（分别为MC 1047、1和MC 1220、2），以研究其抗增殖和细胞分化活性。这两种化合物显着降低了细胞增殖并促进了细胞的形态分化。这些结果提出F（2）-DABOs可作为预防和/或治疗中的有用工具，以抵消去分化病理学中的分化损失，并作为抗增殖药物用于肿瘤治疗。
• Structure-Based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Conformationally Restricted Novel 2-Alkylthio-6-[1-(2,6-difluorophenyl)alkyl]- 3,4-dihydro-5-alkylpyrimidin-4(3<i>H</i>)-ones as Non-nucleoside Inhibitors of HIV-1 Reverse Transcriptase
  作者：Antonello Mai、Gianluca Sbardella、Marino Artico、Rino Ragno、Silvio Massa、Ettore Novellino、Giovanni Greco、Antonio Lavecchia、Chiara Musiu、Massimiliano La Colla、Chiara Murgioni、Paolo La Colla、Roberta Loddo

  DOI：10.1021/jm010853h

  日期：2001.8.1

  5-Alkyl-2-(alkylthio)-6-(2,6-difluorobenzyl)-3,4-dihydropyrimidin-4(3H)-ones (S-DABOs, 2) have been recently described as a new class of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) non-nucleoside reverse transcriptase (RT) inhibitors (NNRTIs) active at nanomolar concentrations (Mai, A. et al. J. Med. Chem. 1999, 42, 619-627). In pursuing our lead optimization efforts, we designed novel conformationally

  最近已将5-烷基-2-（烷硫基）-6-（2,6-二氟苄基）-3,4-二氢嘧啶-4（3H）-ones（S-DABOs，2）描述为一类新的人类免疫缺陷在纳摩尔浓度下具有活性的病毒1型（HIV-1）非核苷逆转录酶（RT）抑制剂（Mai，A. et al.J.Med.Chem.1999，42，619-627）。为了进行领先的优化工作，我们设计了新颖的构象受限的S-DABO，3，其苄基碳原子（Y = Me）和嘧啶5位（R = Me）具有甲基。构象分析和对接模拟表明，两种甲基的存在将显着降低构象柔性，而不会损害R对映异构体适合RT非核苷结合口袋的能力。要发展结构与活动的关系，我们准备了几种3型同源物，它们属于胸腺嘧啶（R = Me）和尿嘧啶（R = H）系列，具有各种2-烷硫基侧链（X = Me，i-Pr，n-Bu，i-Bu，s -Bu，c-戊基和c-己基）和不同于2,6-二氟苯基（Ar =苯基，2,
• Methods for inhibiting the transmission of HIV using topically applied substituted 6-benzyl-4-oxopyrimidines
  申请人：——

  公开号：US20030008887A1

  公开（公告）日：2003-01-09

  A method for inhibiting sexual transmission of HIV comprising topically applying to the skin or epithelial tissue of a human a composition comprising a non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor (“NNRTI”) that is able to inhibit viral replication for periods exceeding 12, 24, or even 36 days, at concentrations below even 10 &mgr;M. In one embodiment the NNRTI is a dihydro-alkyloxy-benzyl-oxopyrimidine (DABO).

  一种抑制HIV性传播的方法，包括将一种含有非核苷类反转录酶抑制剂（“NNRTI”）的组合物局部涂抹于人体的皮肤或上皮组织上，该NNRTI能够在浓度低于10 &mgr;M的情况下抑制病毒复制，持续时间超过12、24或36天。在一种实施方式中，NNRTI是一种二氢烷氧基苯基嘧啶（DABO）。