(2S)-N-{4-[3-(7-methoxy-(11aS)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c]-[1,4]benzodiazepine-5,11-dione-8-yloxy)pentyloxy]-5-methoxy-2-nitrobenzoyl}pyrrolidine-2-carboxaldehyde diethyl thioacetal | 405108-18-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (2S)-N-{4-[3-(7-methoxy-(11aS)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c]-[1,4]benzodiazepine-5,11-dione-8-yloxy)pentyloxy]-5-methoxy-2-nitrobenzoyl}pyrrolidine-2-carboxaldehyde diethyl thioacetal
• 英文别名: (6aS)-3-[5-[4-[(2S)-2-[bis(ethylsulfanyl)methyl]pyrrolidine-1-carbonyl]-2-methoxy-5-nitrophenoxy]pentoxy]-2-methoxy-6a,7,8,9-tetrahydro-5H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-6,11-dione
• CAS: 405108-18-1
• 化学式: C₃₅H₄₆N₄O₉S₂
• 分子量: 730.904
• InChiKey: UYKBSJJBWZDJOY-UIOOFZCWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  203
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-N-{4-[3-(7-methoxy-(11aS)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c]-[1,4]benzodiazepine-5,11-dione-8-yloxy)pentyloxy]-5-methoxy-2-nitrobenzoyl}pyrrolidine-2-carboxaldehyde diethyl thioacetal 在 tin(ll) chloride 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以84%的产率得到(2S)-N-{4-[3-(7-methoxy-(11aS)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c]-[1,4]benzodiazepine-5,11-dione-8-yloxy)pentyloxy]-5-methoxy-2-aminobenzoyl}pyrrolidine-2-carboxaldehyde diethyl thioacetal
  参考文献：
  名称：

  具有有效的DNA结合能力和有效的抗肿瘤活性的新型非交联吡咯并苯并二氮杂二聚体的设计，合成和评估。

  摘要：

  已经开发了新的序列选择性混合的亚胺-酰胺吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体，其由DC-81和DC-81亚基的双内酰胺通过烷二氧基接头（包含三个，五个和八个碳原子）束缚在其C8位上。热变性研究表明，小牛胸腺DNA以5：1的DNA /配体比例孵育18小时后，其中一个（5c）使DeltaT（m）值增加了17.0摄氏度。因此，这些不对称分子表现出明显的DNA较小的凹槽结合亲和力和通过戊二氧链连接的5c表现出与交联DSB-120 PBD二聚体（DeltaT（m）= 15.4摄氏度）相比有效的DNA结合能力。有趣的是，这种亚胺酰胺PBD二聚体与一个5碳链连接体（不同于DSB-120）相连，其具有两个具有三个碳链接头的DC-81亚基，通过引入非共价亚基说明了非交联方面的作用。通过基于限制性内切核酸酶BamHI的抑制的限制性内切核酸酶消化测定法测量了化合物的结合亲和力。这项研究揭示了当两个结构相似部分连接在

  DOI：

  10.1021/jm020124h
• 作为产物：
  描述：

  香草酸甲酯 在 lithium hydroxide 、 氯化亚砜 、 硝酸 、 四氯化锡 、 potassium carbonate 、 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 丙酮 、 苯 为溶剂， 生成 (2S)-N-{4-[3-(7-methoxy-(11aS)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1-c]-[1,4]benzodiazepine-5,11-dione-8-yloxy)pentyloxy]-5-methoxy-2-nitrobenzoyl}pyrrolidine-2-carboxaldehyde diethyl thioacetal
  参考文献：
  名称：

  具有有效的DNA结合能力和有效的抗肿瘤活性的新型非交联吡咯并苯并二氮杂二聚体的设计，合成和评估。

  摘要：

  已经开发了新的序列选择性混合的亚胺-酰胺吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体，其由DC-81和DC-81亚基的双内酰胺通过烷二氧基接头（包含三个，五个和八个碳原子）束缚在其C8位上。热变性研究表明，小牛胸腺DNA以5：1的DNA /配体比例孵育18小时后，其中一个（5c）使DeltaT（m）值增加了17.0摄氏度。因此，这些不对称分子表现出明显的DNA较小的凹槽结合亲和力和通过戊二氧链连接的5c表现出与交联DSB-120 PBD二聚体（DeltaT（m）= 15.4摄氏度）相比有效的DNA结合能力。有趣的是，这种亚胺酰胺PBD二聚体与一个5碳链连接体（不同于DSB-120）相连，其具有两个具有三个碳链接头的DC-81亚基，通过引入非共价亚基说明了非交联方面的作用。通过基于限制性内切核酸酶BamHI的抑制的限制性内切核酸酶消化测定法测量了化合物的结合亲和力。这项研究揭示了当两个结构相似部分连接在

  DOI：

  10.1021/jm020124h

文献信息

• Design, Synthesis, and Evaluation of New Noncross-Linking Pyrrolobenzodiazepine Dimers with Efficient DNA Binding Ability and Potent Antitumor Activity
  作者：Ahmed Kamal、G. Ramesh、N. Laxman、P. Ramulu、O. Srinivas、K. Neelima、Anand K. Kondapi、V. B. Sreenu、H. A. Nagarajaram

  DOI：10.1021/jm020124h

  日期：2002.10.1

  increases the DeltaT(m) value by 17.0 degrees C. Therefore, these unsymmetrical molecules exhibit significant DNA minor groove binding affinity and 5c linked through the pentanedioxy chain exhibits efficient DNA binding ability that compares with the cross-linking DSB-120 PBD dimer (DeltaT(m) = 15.4 degrees C). Interestingly, this imine-amide PBD dimer has been linked with a five carbon chain linker unlike

  已经开发了新的序列选择性混合的亚胺-酰胺吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体，其由DC-81和DC-81亚基的双内酰胺通过烷二氧基接头（包含三个，五个和八个碳原子）束缚在其C8位上。热变性研究表明，小牛胸腺DNA以5：1的DNA /配体比例孵育18小时后，其中一个（5c）使DeltaT（m）值增加了17.0摄氏度。因此，这些不对称分子表现出明显的DNA较小的凹槽结合亲和力和通过戊二氧链连接的5c表现出与交联DSB-120 PBD二聚体（DeltaT（m）= 15.4摄氏度）相比有效的DNA结合能力。有趣的是，这种亚胺酰胺PBD二聚体与一个5碳链连接体（不同于DSB-120）相连，其具有两个具有三个碳链接头的DC-81亚基，通过引入非共价亚基说明了非交联方面的作用。通过基于限制性内切核酸酶BamHI的抑制的限制性内切核酸酶消化测定法测量了化合物的结合亲和力。这项研究揭示了当两个结构相似部分连接在