6-[(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)(cyclohexyl)amino]-1-methyl-1H-imidazo[4,5-c]pyridine-4-carbonitrile | 1443830-80-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 6-[(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)(cyclohexyl)amino]-1-methyl-1H-imidazo[4,5-c]pyridine-4-carbonitrile
• 英文别名: 6-[1,3-Benzodioxol-5-ylmethyl(cyclohexyl)amino]-1-methylimidazo[4,5-c]pyridine-4-carbonitrile；6-[1,3-benzodioxol-5-ylmethyl(cyclohexyl)amino]-1-methylimidazo[4,5-c]pyridine-4-carbonitrile
• CAS: 1443830-80-5
• 化学式: C₂₂H₂₃N₅O₂
• 分子量: 389.457
• InChiKey: PCLBIVHDJJRTRO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  76.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  柠嗪酸 在 potassium phosphate 、 sodium azide 、 草酰氯 、 tin(II) chloride dihdyrate 、 lithium hydroxide monohydrate 、 硫酸 、 硝酸 、 palladium diacetate 、 potassium carbonate 、 对甲苯磺酸 、 R-(+)-1,1'-联萘-2,2'-双二苯膦 、 三氟乙酸 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 N-甲基吡咯烷酮 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 乙醇-D1 、 水 、 丙酮 、 甲苯 、 乙腈 、 苯 为溶剂， 反应 141.53h， 生成 6-[(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)(cyclohexyl)amino]-1-methyl-1H-imidazo[4,5-c]pyridine-4-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  优化的三嗪腈作为罗德萨因抑制剂：结构与活性之间的关系，生物等位咪唑并吡啶腈和人组织蛋白酶L的X射线晶体结构分析

  摘要：

  引起非洲昏睡病的布鲁氏锥虫寄生虫的半胱氨酸蛋白酶罗氏蛋白酶已成为开发新候选药物的目标。基于三嗪腈部分作为亲电头基，使用基于结构的设计对酶的S1，S2和S3口袋的取代基进行了优化研究，得到了抑制剂，其抑制常数在个位数纳摩尔范围内。全面的结构-活性关系阐明了活性位点各个口袋的结合偏好。S1口袋可容忍各种取代基，其中优先选择挠性和碱性侧链。S2取代基的变化导致抑制亲和力低至2 n M的高亲和力配体用于带有环己基取代基的化合物。对S3口袋的系统研究表明，它有可能通过芳香族载体实现高活性，这些芳香族载体与形成口袋的一部分的平面肽骨架进行堆叠相互作用。用结构相关酶人组织蛋白酶L的X射线晶体结构分析证实了分子建模所提出的三嗪配体系列的结合模式。通过优化周期确定的最佳取代基修饰的配体可实现亚微摩尔对培养寄生虫增殖的抑制。在基于细胞的测定中，在抑制剂上引入基本侧链导致抗锥虫活性提高了35倍。最后，为了减少三

  DOI：

  10.1002/cmdc.201300112

文献信息

• Optimization of Triazine Nitriles as Rhodesain Inhibitors: Structure-Activity Relationships, Bioisosteric Imidazopyridine Nitriles, and X-ray Crystal Structure Analysis with Human Cathepsin L
  作者：Veronika Ehmke、Edwin Winkler、David W. Banner、Wolfgang Haap、W. Bernd Schweizer、Matthias Rottmann、Marcel Kaiser、Céline Freymond、Tanja Schirmeister、François Diederich

  DOI：10.1002/cmdc.201300112

  日期：2013.6

  Variation of the S2 substituent led to high‐affinity ligands with inhibition constants down to 2 nM for compounds bearing cyclohexyl substituents. Systematic investigations on the S3 pocket revealed its potential to achieve high activities with aromatic vectors that undergo stacking interactions with the planar peptide backbone forming part of the pocket. X‐ray crystal structure analysis with the structurally

  引起非洲昏睡病的布鲁氏锥虫寄生虫的半胱氨酸蛋白酶罗氏蛋白酶已成为开发新候选药物的目标。基于三嗪腈部分作为亲电头基，使用基于结构的设计对酶的S1，S2和S3口袋的取代基进行了优化研究，得到了抑制剂，其抑制常数在个位数纳摩尔范围内。全面的结构-活性关系阐明了活性位点各个口袋的结合偏好。S1口袋可容忍各种取代基，其中优先选择挠性和碱性侧链。S2取代基的变化导致抑制亲和力低至2 n M的高亲和力配体用于带有环己基取代基的化合物。对S3口袋的系统研究表明，它有可能通过芳香族载体实现高活性，这些芳香族载体与形成口袋的一部分的平面肽骨架进行堆叠相互作用。用结构相关酶人组织蛋白酶L的X射线晶体结构分析证实了分子建模所提出的三嗪配体系列的结合模式。通过优化周期确定的最佳取代基修饰的配体可实现亚微摩尔对培养寄生虫增殖的抑制。在基于细胞的测定中，在抑制剂上引入基本侧链导致抗锥虫活性提高了35倍。最后，为了减少三