((2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate | 35893-05-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: ((2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate
• 英文别名: 6-Methyluridine 5'-(Dihydrogen Phosphate)；[(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate
• CAS: 35893-05-1
• 化学式: C₁₀H₁₅N₂O₉P
• 分子量: 338.211
• InChiKey: CHBBJHPQYVYKFI-ZOQUXTDFSA-N

物化性质

• 密度：
  1.763±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.6
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate 在 氨 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 6-methyl uridine 5'-O-monophosphate ammonium salt
  参考文献：
  名称：

  WO2007/38859

  摘要：

  公开号：
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(t-butyldimethylsilyl)-2',3'-O-isopropylideneuridine 在 吡啶 、 水 、 三氟乙酸 、 lithium diisopropyl amide 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 14.17h， 生成 ((2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-(6-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl phosphate
  参考文献：
  名称：

  WO2008/83465

  摘要：

  公开号：

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US20150376611A1

  公开（公告）日：2015-12-31

  The present invention provides an oligonucleotide having improved affinity for AGO2, and the like. The oligonucleotide has a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X 1 is an oxygen atom or the like, R 1 is formula (IIA) (wherein R 5A is halogen or the like, and R 6A is a hydrogen atom or the like) or formula (IVA) (wherein Y 3A is a nitrogen atom or the like, and Y 4A is CH or the like), or the like, R 2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R 3 is a hydrogen atom or the like} at the 5′ end thereof, and the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3.

  本发明提供了一种具有改善对AGO2亲和力的寡核苷酸等。该寡核苷酸在其5'端具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基其中X 1 是氧原子或类似物，R 1 是式(IIA)（其中R 5A 是卤素或类似物，而R 6A 是氢原子或类似物）或式(IVA)（其中Y 3A 是氮原子或类似物，而Y 4A 是CH或类似物），或类似物，R 2 是氢原子、羟基、卤素或可选择地取代的较低烷氧基，而R 3 是氢原子或类似物}，并且该核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。
• OLIGONUCLEOTIDE HAVING NON-NATURAL NUCLEOTIDE AT 5'-TERMINAL THEREOF
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US20170354673A1

  公开（公告）日：2017-12-14

  An oligonucleotide having a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X 1 is an oxygen atom or the like, R 1 is formula (IIA) (wherein R 5A is halogen or the like, and R 6A is a hydrogen atom or the like), formula (IVA) (wherein Y 3A is a nitrogen atom or the like, and Y 4A is CH or the like), or the like, R 2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R 3 is a hydrogen atom or the like, or formula (VI) (wherein n2 is 1, 2 or 3)} at the 5′ end thereof, wherein the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3, is provided.

  具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基的寡核苷酸其中X1是氧原子或类似物，R1是式(IIA)（其中R5A是卤素或类似物，而R6A是氢原子或类似物），式(IVA)（其中Y3A是氮原子或类似物，而Y4A是CH或类似物），或类似物，R2是氢原子，羟基，卤素，或可选择地取代的较低烷氧基，而R3是氢原子或类似物，或式(VI)（其中n2为1、2或3）}在其5'端，其中核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。
• Enzymatic Production of Non-Natural Nucleoside-5′-Monophosphates by a Thermostable Uracil Phosphoribosyltransferase
  作者：Jon del Arco、Javier Acosta、Humberto M. Pereira、Almudena Perona、Neratur K. Lokanath、Naoki Kunishima、Jesús Fernández-Lucas

  DOI：10.1002/cctc.201701223

  日期：2018.1.23

  TtUPRT has been determined by protein crystallography, and its substrate specificity and biochemical characteristics have been analyzed, providing new structural insights into the substrate‐binding mode. Biochemical characterization of the recombinant protein indicates that the enzyme is a homotetramer, with activity and stability across a broad range of temperatures (50–80 °C), pH (5.5–9) and ionic strength

  使用酶作为生物催化剂来合成修饰的5'-单磷酸核苷（NMP）是传统的多步化学方法的有趣替代方法，该方法具有多种优势，例如立体，区域和对映选择性，简单的下游加工以及反应条件温和。在本文中，我们报道了嗜热栖热菌HB8（Tt UPRT）的尿嘧啶磷酸核糖基转移酶的重组表达，生产和纯化。Tt的结构UPRT已通过蛋白质晶体学确定，并对其底物特异性和生化特性进行了分析，从而为底物结合模式提供了新的结构见解。重组蛋白的生化特性表明该酶是同四聚体，在很宽的温度范围（50–80°C），pH（5.5–9）和离子强度（0–500 m m NaCl）中均具有活性和稳定性。令人惊讶的是，Tt UPRT能够识别几种5和6-取代的嘧啶作为底物。这些实验结果表明，Tt UPRT可能是合成修饰NMP的有价值的生物催化剂。
• Structure–Activity Relationships of C6-Uridine Derivatives Targeting <i>Plasmodia</i> Orotidine Monophosphate Decarboxylase
  作者：Angelica M. Bello、Ewa Poduch、Yan Liu、Lianhu Wei、Ian Crandall、Xiaoyang Wang、Christopher Dyanand、Kevin C. Kain、Emil F. Pai、Lakshmi P. Kotra

  DOI：10.1021/jm7010673

  日期：2008.2.1

  6-methyl uridine derivatives were studied as inhibitors of plasmodial ODCase. 6-Azidouridine 5'-monophosphate is a potent covalent inhibitor of P. falciparum ODCase. 6-Methyluridine exhibited weak antimalarial activity against P. falciparum 3D7 isolate. 6- N-Methylamino and 6- N, N-dimethylamino uridine derivatives exhibited moderate antimalarial activities.

  由疟原虫寄生虫引起的疟疾已再次成为一个主要问题，对人类健康造成致命影响，特别是由于对多种药物的耐药性。在疟原虫中，牛尿苷5'-单磷酸脱羧酶（ODCase）是尿苷5'-单磷酸从头合成的必需酶。在这些病原体中损害ODCase是开发新型疗法的一种有前途的策略。受我们最近发现6-碘尿苷是恶性疟原虫有效抑制剂的鼓励，我们研究了UMP各种C6衍生物的构效关系。针对恶性疟原虫评估了尿苷的6-氰基，6-叠氮基，6-氨基，6-甲基，6-N-甲基氨基和6-N，N-二甲基氨基衍生物。6-氰基，6-叠氮基，6-氨基，研究了6-甲基尿苷衍生物作为纤溶酶ODCase的抑制剂。6-Azidouridine 5'-monophosphate是恶性疟原虫ODCase的有效共价抑制剂。6-甲基尿苷对恶性疟原虫3D7分离株表现出弱的抗疟活性。6-N-甲基氨基和6-N，N-二甲基氨基尿苷衍生物表现出中等的抗疟活性。
• ODCASE INHIBITORS FOR THE TREATMENT OF MALARIA
  申请人：Kotra Lakshmi P.

  公开号：US20090221524A1

  公开（公告）日：2009-09-03

  The present invention includes methods of treating or preventing malaria by administering an anti-malarial effective amount of 6-substituted uridine derivatives to a subject need thereof. The invention also includes new 6-substituted uridine derivatives for use as therapeutics, in particular to treat malaria.

  本发明涉及通过向需要治疗或预防疟疾的受体施用抗疟疾有效量的6-取代尿嘧啶衍生物来治疗或预防疟疾的方法。本发明还包括新的6-取代尿嘧啶衍生物，用于作为治疗剂，特别是用于治疗疟疾。