(R)-methyl 2-(cyclopentylamino)propanoate | 755039-47-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (R)-methyl 2-(cyclopentylamino)propanoate
• 英文别名: methyl (R)-2-(cyclopentylamino)propanoate；methyl (2R)-2-(cyclopentylamino)propanoate
• CAS: 755039-47-5
• 化学式: C₉H₁₇NO₂
• 分子量: 171.239
• InChiKey: PNGQCYWJBSUECY-SSDOTTSWSA-N

物化性质

• 沸点：
  235.2±23.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.00±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.08
• 重原子数：
  12.0
• 可旋转键数：
  3.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  38.33
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-methyl 2-(cyclopentylamino)propanoate 在 盐酸 、 sodium hydride 、 potassium carbonate 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 乙醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 生成 (R)-4-((4-cyclopentyl-1,3-dimethyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydropyrido[2,3-b]pyrazin-6-yl)amino)-3-methoxybenzoic acid
  参考文献：
  名称：

  强效选择性双溴结构域 4 (BRD4)/Polo 样激酶 1 (PLK1) 抑制剂的结构引导设计和开发。

  摘要：

  通过单个分子同时抑制 Polo 样激酶 1 (PLK1) 和 BRD4 溴结构域可能会导致开发出针对 PLK1 和 BRD4 涉及的多种疾病的有效治疗策略。化合物 23 被发现是一种有效的双激酶-溴结构域抑制剂（BRD4-BD1 IC50 = 28 nM，PLK1 IC50 = 40 nM）。发现化合物 6 是我们系列中相对于 BRD4 最具选择性的 PLK1 抑制剂（BRD4-BD1 IC50 = 2579 nM，PLK1 IC50 = 9.9 nM）。 23 和 BRD4-BD1/PLK1 以及 6 的分子对接研究证实了生化测定结果。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b00765
• 作为产物：
  描述：

  D-丙氨酸甲酯 、 环戊酮 在 sodium acetate 、 三乙酰氧基硼氢化钠 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (R)-methyl 2-(cyclopentylamino)propanoate
  参考文献：
  名称：

  强效选择性双溴结构域 4 (BRD4)/Polo 样激酶 1 (PLK1) 抑制剂的结构引导设计和开发。

  摘要：

  通过单个分子同时抑制 Polo 样激酶 1 (PLK1) 和 BRD4 溴结构域可能会导致开发出针对 PLK1 和 BRD4 涉及的多种疾病的有效治疗策略。化合物 23 被发现是一种有效的双激酶-溴结构域抑制剂（BRD4-BD1 IC50 = 28 nM，PLK1 IC50 = 40 nM）。发现化合物 6 是我们系列中相对于 BRD4 最具选择性的 PLK1 抑制剂（BRD4-BD1 IC50 = 2579 nM，PLK1 IC50 = 9.9 nM）。 23 和 BRD4-BD1/PLK1 以及 6 的分子对接研究证实了生化测定结果。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b00765

文献信息

• New dihydropteridinones, processes for preparing them and their use as pharmaceutical compositions
  申请人：Boehringer Ingelheim Pharma GmbH Co. KG

  公开号：US20040176380A1

  公开（公告）日：2004-09-09

  The present invention relates to new dihydropteridinones of general formula (I) 1 wherein the groups L and R 1 - R 5 have the meanings given in the claims and specification, the isomers thereof, processes for preparing these dihydropteridinones and the use thereof as pharmaceutical compositions.

  本发明涉及一般式（I）1的新二氢叶酸酮，其中基团L和R1-R5具有索赔和规范中给出的含义，其异构体，制备这些二氢叶酸酮的过程以及其作为药物组合物的用途。
• Structure-Guided Design and Development of Potent and Selective Dual Bromodomain 4 (BRD4)/Polo-like Kinase 1 (PLK1) Inhibitors
  作者：Shuai Liu、Hailemichael O. Yosief、Lingling Dai、He Huang、Gagan Dhawan、Xiaofeng Zhang、Alex M. Muthengi、Justin Roberts、Dennis L. Buckley、Jennifer A. Perry、Lei Wu、James E. Bradner、Jun Qi、Wei Zhang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b00765

  日期：2018.9.13

  inhibition of polo-like kinase 1 (PLK1) and BRD4 bromodomain by a single molecule could lead to the development of an effective therapeutic strategy for a variety of diseases in which PLK1 and BRD4 are implicated. Compound 23 has been found to be a potent dual kinase-bromodomain inhibitor (BRD4-BD1 IC50 = 28 nM, PLK1 IC50 = 40 nM). Compound 6 was found to be the most selective PLK1 inhibitor over BRD4

  通过单个分子同时抑制 Polo 样激酶 1 (PLK1) 和 BRD4 溴结构域可能会导致开发出针对 PLK1 和 BRD4 涉及的多种疾病的有效治疗策略。化合物 23 被发现是一种有效的双激酶-溴结构域抑制剂（BRD4-BD1 IC50 = 28 nM，PLK1 IC50 = 40 nM）。发现化合物 6 是我们系列中相对于 BRD4 最具选择性的 PLK1 抑制剂（BRD4-BD1 IC50 = 2579 nM，PLK1 IC50 = 9.9 nM）。 23 和 BRD4-BD1/PLK1 以及 6 的分子对接研究证实了生化测定结果。
• Dual Inhibition of TAF1 and BET Bromodomains from the BI-2536 Kinase Inhibitor Scaffold
  作者：David Remillard、Dennis L. Buckley、Hyuk-Soo Seo、Fleur M. Ferguson、Sirano Dhe-Paganon、James E. Bradner、Nathanael S. Gray

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.9b00243

  日期：2019.10.10

  Recent reports have highlighted the dual bromodomains of TAF1 (TAF1(1,2)) as synergistic with BET inhibition in cellular cancer models, engendering interest in TAF/BET polypharmacology. Here, we examine structure activity relationships within the BI-2536 PLK1 kinase inhibitor scaffold, previously reported to bind BRD4. We examine binding by this ligand to TAF1(2) and apply structure guided design strategies to discriminate binding to both the PLK1 kinase and BRD4(1) bromodomain while retaining activity on TAF1(2). Through this effort we discover potent dual inhibitors of TAF1(2)/BRD4(1), as well as biased derivatives showing marked TAF1 selectivity. We resolve X-ray crystallographic data sets to examine the mechanisms of the observed TAF1 selectivity and to provide a resource for further development of this scaffold.