5'-deoxy-5'-methylthymidine | 129802-10-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 5'-deoxy-5'-methylthymidine
• 英文别名: 5'-deoxy-5'-iodothymidine；5'-Methyl-5'-deoxythymidine；1-[(2R,4S,5R)-5-ethyl-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 129802-10-4
• 化学式: C₁₁H₁₆N₂O₄
• 分子量: 240.259
• InChiKey: BMEXKQSLDGAVNE-DJLDLDEBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  78.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-deoxy-5'-methylthymidine 在 咪唑 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 palladium 10% on activated carbon 、 sodium hydride 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 29.5h， 生成 C-(3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-deoxythymidin-5'-yl)-N-(3'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidin-3'-yl)amido methyl malonate
  参考文献：
  名称：

  探讨修饰核苷与 DNA 核酸酶 SNM1A 的结合要求

  摘要：

  SNM1A 是一种涉及 DNA 链间交联修复的核酸酶，因此，它的抑制作用对于克服对化学治疗性交联剂的抗性很重要。然而，SNM1A活性位点中金属离子的数量和身份仍未得到证实，迄今为止报道的抑制剂数量有限。在此，我们报告了基于丙二酸的修饰核苷家族的合成和评估，以研究金属结合基团在核苷衍生的 SNM1A 抑制剂中的最佳定位。这些化合物包括酯、羧酸酯和异羟肟酸丙二酸酯衍生物，它们安装在胸苷的 5'-位或 3'-位或作为两个核苷之间的连接。作为重组 SNM1A 抑制剂的评估表明，所测试的 12 种化合物中有 9 种在 1 mM 浓度下具有抑制作用。最有效的化合物在 5'-位含有异羟肟酸丙二酸酯基团。总体而言，我们的研究促进了对 SNM1A 核苷衍生抑制剂要求的理解，并表明在金属螯合剂（如异羟肟酸丙二酸酯）附近含有带负电荷基团的基团是抑制剂设计中很有前景的结构。

  DOI：

  10.3390/molecules26020320
• 作为产物：
  描述：

  5-O-(4-甲基苯基磺酰基)胸腺嘧啶脱氧核苷 在 咪唑 、 copper(l) iodide 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 5'-deoxy-5'-methylthymidine
  参考文献：
  名称：

  Introduction of an alkyl group into the sugar portion of uracilnucleosides by the use of Gilman reagents.

  摘要：

  用Gilman试剂（R2CuLi）研究了尿嘧啶核苷糖部分的p-甲苯磺酰氧基被烷基取代的反应。对于2',3'-O-异亚丙基尿苷的5'-O-甲苯磺酸衍生物，得到了中等收率的5'-烷基化产物。与此相反，相应的2'-脱氧尿苷衍生物的反应则得到了更高收率的产物。还考察了在2'-脱氧尿苷衍生物的3'位进行类似取代反应的情况。

  DOI：

  10.1248/cpb.38.355

文献信息

• Synthesis of beta-L-2-Deoxy nucleosides
  申请人：Novartis AG

  公开号：EP2157095A2

  公开（公告）日：2010-02-24

  An improved process for the preparation of 2'-modified nucleosides and 2'-deoxynucleosides, such as, β-L-2'-deoxy-thymidine (LdT), is provided. In particular, the improved process is directed to the synthesis of a 2'-deoxynucleoside that may utilize different starting materials but that proceeds via a chloro-sugar intermediate or via a 2,2' anhydro-1-furanosyl-nucleobase intermediate. Where an 2,2'-anhydro-1-furanosyl base intermediate is utilized, a reducing agent, such as Red-Al, and a sequestering agent, such as 15-crown-5 ether, that cause an intramolecular displacement reaction and formation of the desired nucleoside product in good yields are employed. An alternative process of the present invention utilizes a 2,2'-anhydro-1-furanosyl base intermediate without a sequestering agent to afford 2'-deoxynucleosides in good yields. The compounds made according to the present invention may be used as intermediates in the preparation of other nucleoside analogues, or may be used directly as antiviral and/or antineoplastic agents.

  本发明提供了一种改进的方法，用于制备2'-修饰核苷和2'-去氧核苷，例如β-L-2'-去氧胸腺嘧啶（LdT）。特别是，改进的方法针对合成一种2'-去氧核苷，该方法可以利用不同的起始材料，但是通过氯代糖中间体或2,2'无水-1-呋喃基-核碱中间体进行。当使用2,2'-无水-1-呋喃基碱中间体时，采用还原剂（如Red-Al）和隔离剂（如15-冠-5醚），引起分子内位移反应并形成所需的核苷产物，产率良好。本发明的另一种替代方法利用无隔离剂的2,2'-无水-1-呋喃基碱中间体，以获得良好的2'-去氧核苷收率。根据本发明制备的化合物可以用作制备其他核苷类似物的中间体，或者可以直接用作抗病毒和/或抗肿瘤剂。
• HAYAKAWA, HIROYUKI;ASHIZAWA, HIROSHI;TANAKA, HIROMICHI;MIYASAKA, TADASHI, CHEM. AND PHARM. BULL., 38,(1990) N, C. 355-360
  作者：HAYAKAWA, HIROYUKI、ASHIZAWA, HIROSHI、TANAKA, HIROMICHI、MIYASAKA, TADASHI

  DOI：——

  日期：——
• Introduction of an alkyl group into the sugar portion of uracilnucleosides by the use of Gilman reagents.
  作者：Hiroyuki HAYAKAWA、Hiroshi ASHIZAWA、Hiromichi TANAKA、Tadashi MIYASAKA

  DOI：10.1248/cpb.38.355

  日期：——

  Substitution of a p-toluenesulfonyloxy group in the sugar portion of uracilnucleosides by an alkyl group was investigated by using Gilman reagents (R2CuLi). In the cases of 5'-O-tosyl derivatives of 2', 3'-O-isopropylideneuridine, moderate vields of 5'-alkylated products were obtained. In contrast to this, the reactions of the corresponding 2'-deoxyuridine derivatives gave higher yields of products. A similar substitution reaction at the 3'-position of 2'-deoxyuridine derivatives was also examined.

  用Gilman试剂（R2CuLi）研究了尿嘧啶核苷糖部分的p-甲苯磺酰氧基被烷基取代的反应。对于2',3'-O-异亚丙基尿苷的5'-O-甲苯磺酸衍生物，得到了中等收率的5'-烷基化产物。与此相反，相应的2'-脱氧尿苷衍生物的反应则得到了更高收率的产物。还考察了在2'-脱氧尿苷衍生物的3'位进行类似取代反应的情况。
• Probing the Binding Requirements of Modified Nucleosides with the DNA Nuclease SNM1A
  作者：Eva-Maria Dürr、Joanna F. McGouran

  DOI：10.3390/molecules26020320

  日期：——

  only a limited number of inhibitors have been reported to date. Herein, we report the synthesis and evaluation of a family of malonate-based modified nucleosides to investigate the optimal positioning of metal-binding groups in nucleoside-derived inhibitors for SNM1A. These compounds include ester, carboxylate and hydroxamic acid malonate derivatives which were installed in the 5′-position or 3′-position

  SNM1A 是一种涉及 DNA 链间交联修复的核酸酶，因此，它的抑制作用对于克服对化学治疗性交联剂的抗性很重要。然而，SNM1A活性位点中金属离子的数量和身份仍未得到证实，迄今为止报道的抑制剂数量有限。在此，我们报告了基于丙二酸的修饰核苷家族的合成和评估，以研究金属结合基团在核苷衍生的 SNM1A 抑制剂中的最佳定位。这些化合物包括酯、羧酸酯和异羟肟酸丙二酸酯衍生物，它们安装在胸苷的 5'-位或 3'-位或作为两个核苷之间的连接。作为重组 SNM1A 抑制剂的评估表明，所测试的 12 种化合物中有 9 种在 1 mM 浓度下具有抑制作用。最有效的化合物在 5'-位含有异羟肟酸丙二酸酯基团。总体而言，我们的研究促进了对 SNM1A 核苷衍生抑制剂要求的理解，并表明在金属螯合剂（如异羟肟酸丙二酸酯）附近含有带负电荷基团的基团是抑制剂设计中很有前景的结构。