N,N'-di-(N,N-dimethylethyl)-2,6-dibromonaphthalene-1,4,5,8-tetracarboxylic acid bisimide | 1357363-14-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡啶及其衍生物
• 英文名称: N,N'-di-(N,N-dimethylethyl)-2,6-dibromonaphthalene-1,4,5,8-tetracarboxylic acid bisimide
• 英文别名: 2,9-Dibromo-6,13-bis[2-(dimethylamino)ethyl]-6,13-diazatetracyclo[6.6.2.04,16.011,15]hexadeca-1,3,8,10,15-pentaene-5,7,12,14-tetrone；2,9-dibromo-6,13-bis[2-(dimethylamino)ethyl]-6,13-diazatetracyclo[6.6.2.04,16.011,15]hexadeca-1,3,8,10,15-pentaene-5,7,12,14-tetrone
• CAS: 1357363-14-4
• 化学式: C₂₂H₂₂Br₂N₄O₄
• 分子量: 566.249
• InChiKey: GUGZWCQAZVVSHR-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  662.5±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.675±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  81.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N'-di-(N,N-dimethylethyl)-2,6-dibromonaphthalene-1,4,5,8-tetracarboxylic acid bisimide 在 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 水 、 乙腈 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 13.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  硫糖萘二亚胺偶联物：具有抗寄生虫和抗癌活性的 G-四链体配体

  摘要：

  与非癌细胞相比，糖基与药物结合是一种利用癌细胞中葡萄糖转运蛋白 (GLUT) 过度表达的策略。与O-糖苷相比，它扩展到药物与硫糖的结合，试图利用它们更高的生物稳定性。在这里，我们合成了一系列硫糖萘二亚胺偶联物作为 G-四链体配体，并探索了氨基侧链的修饰，比较了二甲基氨基和吗啉基。然后，我们研究了它们在结肠癌细胞中的抗增殖活性，以及​​它们在T. brucei和L. major中的抗寄生虫活性寄生虫，以及它们结合四链体的能力及其细胞摄取和定位。我们在哺乳动物细胞和寄生虫中观察到糖-NDI-NMe 2衍生物的毒性高于糖-NDI-morph 化合物。我们的实验表明，与四链体的结合效率较低和对 carb-NDI-morph 衍生物的细胞摄取较差可能是这些差异的原因。我们发现O -carb-NDI 和S -carb-NDI之间的细胞毒性差异很小，除了针对非癌性人类成纤维细胞 MRC-5，其中硫糖-NDI

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114183
• 作为产物：
  描述：

  1,4,5,8-萘四甲酸酐 在 硫酸 、 溶剂黄146 、 1,3-二溴-1,3,5-三嗪-2,4,6-三酮 作用下， 反应 12.5h， 生成 N,N'-di-(N,N-dimethylethyl)-2,6-dibromonaphthalene-1,4,5,8-tetracarboxylic acid bisimide
  参考文献：
  名称：

  萘二酰亚胺支架对G-四链体具有双重可逆和共价相互作用。

  摘要：

  G-四链体寡核苷酸的选择性识别和烷基化已通过取代的萘酚二酰亚胺（NDI）通过烷基酰胺间隔基与可调节的长度和构象移动性与工程酚部分偶联而实现。已经进行了FRET-熔解测定，圆二色性滴定和凝胶电泳分析，以评估G-四链体的可逆稳定性和烷基化。通过最短的烷基-氨基间隔基偶联到醌甲基化物前体（NDI-QMP）和苯酚部分的NDI表现出平面且相当刚性的几何形状（通过DFT计算建模）。它们分别是最好的不可逆和可逆G-四链体粘合剂。上述NDI-QMP能够在纳摩尔范围内烷基化端粒G-四链体DNA，并且与单链和双链寡核苷酸相比，对G-四链体的选择性高100-1000倍。该化合物对肺癌细胞系的细胞毒性也最大。

  DOI：

  10.1016/j.biochi.2011.06.015

文献信息

• Selective Binding and Redox-Activity on Parallel G-Quadruplexes by Pegylated Naphthalene Diimide-Copper Complexes
  作者：Valentina Pirota、Enrico Lunghi、Alessandra Benassi、Emmanuele Crespan、Mauro Freccero、Filippo Doria

  DOI：10.3390/molecules26165025

  日期：——

  induce and strongly stabilize these structures. Sometimes, a reversible NDI-G4 interaction is also associated with an irreversible one, due to the cleavage and/or modification of G4s by functional-NDIs. This is the case of NDI-Cu-DETA, a copper(II) complex able to cleave G4s in the closest proximity to the target binding site. Herein, we present two original Cu(II)-NDI complexes, inspired by NDI-Cu-DETA

  G-四链体 (G4s) 是高级超分子​​结构，在许多关键过程的调节中具有生物学重要性。其中，最近与 RNA-G4 相关的发现，包括它们作为针对 COVID-19 的抗病毒靶标的潜在参与，引发了对开发能够与平行 G4 相互作用的选择性分子的日益增长的需求。萘二亚胺 (NDI) 被广泛用作 G4 配体，能够诱导并强烈稳定这些结构。有时，由于功能性 NDI 对 G4 的裂解和/或修饰，可逆的 NDI-G4 相互作用也与不可逆的相互作用有关。这是NDI-Cu-DETA 的情况，一种铜 (II) 复合物，能够在最靠近目标结合位点的位置切割 G4。在此，我们展示了两种受NDI-Cu-DETA启发的原始 Cu(II)-NDI 配合物，用 2-（2-氨基乙氧基）乙醇侧链进行不同功能化，以选择性地将氧化还原催化活性推向平行 G4。由 2-（2-氨基乙氧基）乙醇侧链的存在控制的对平行 G4 拓扑结构的选择性相互作用已经被我们使用核心扩展的
• Water-Soluble Naphthalene Diimides as Singlet Oxygen Sensitizers
  作者：Filippo Doria、Ilse Manet、Vincenzo Grande、Sandra Monti、Mauro Freccero

  DOI：10.1021/jo401347z

  日期：2013.8.16

  of the solubilizing moieties, and pH of the solution. Laser flash photolysis confirmed that the NDI lowest triplet excited state was efficiently populated, upon excitation at both 355 and 532 nm, and that free amine moieties quenched both the singlet and triplet excited states by intramolecular electron transfer, with generation of detectable radical anions. Time-resolved experiments, monitoring the

  合成了溴和/或烷基氨基取代的水溶性萘二酰亚胺（NDI），以研究它们的多峰光物理和光化学性质。含溴的NDI（即11）在532 nm辐射下既充当单线态氧（1 O 2）光敏剂，又充当荧光分子。在不含溴的NDI中，只有12个通过在610 nm以上的辐射显示出与Br-NDI相似的光物理性质，这表明对于这些NDI，单重态和三重态的激发态性质都受到长度，加溶部分结构和溶液pH的强烈影响。激光快速光解证实，在355和532 nm激发时，NDI最低的三重激发态有效地被填充，并且游离胺部分通过分子内电子转移淬灭了单重激发态和三重激发态，并产生了可检测的自由基阴离子。通过时间分辨实验，监测在532 nm激光照射下产生的1270 nm 1 O 2磷光衰减，可以基于NDI的1 O对NDI作为敏化剂进行排名2个量子产率（Φ Δ）。经四官能化的12表现出长寿命的三重态（τ〜32μs），对于光动力疗法的应用具有最有希望的吸收性，经测试可作为有效的光敏剂用于1
• Water soluble extended naphthalene diimides as pH fluorescent sensors and G-quadruplex ligands
  作者：Filippo Doria、Matteo Nadai、Giovanna Sattin、Luca Pasotti、Sara N. Richter、Mauro Freccero

  DOI：10.1039/c2ob07006e

  日期：——

  Extended naphthalene diimides (NDIs) fused to 1,4-dihydropyrazine-2,3-dione, containing two solubilizing moieties, have been synthesized. Fluorescence spectra of the new NDIs were remarkably affected by pH, as the second deprotonation of the dihydropyrazinedione moiety (pKa 6.9) switched off the emission. Binding to a G-quadruplex folded oligonucleotide and stoichiometry were evaluated by FRET melting assay and CD analysis. G-quadruplex binding was strongly enhanced shifting from pH 7.4 to pH 6.0 as a consequence of the dihydropyrazinedione moiety protonation. Cytotoxicity studies using two human telomerase-positive cell lines (HT29 and A549) revealed that the best G-quadruplex ligand was very active against the colon cell line, with an EC50 of 300 nM.

  合成了扩展的萘二酰亚胺（NDIs），与1,4-二氢吡嗪-2,3-二酮融合，并包含两个溶解化基团。新合成的NDIs的荧光光谱明显受到pH的影响，因为二氢吡嗪二酮基团的第二个去质子化（pKa 6.9）会关闭发射。通过FRET熔解分析和CD分析评估了与G-四链体折叠的寡核苷酸的结合和化学计量。随着pH从7.4下降到6.0，由于二氢吡嗪二酮基团的质子化，G-四链体结合显著增强。对两种人类端粒酶阳性细胞系（HT29和A549）的细胞毒性研究显示，最佳的G-四链体配体对结肠细胞系具有非常活跃的作用，EC50为300 nM。
• Extended Naphthalene Diimides with Donor/Acceptor Hydrogen-Bonding Properties Targeting G-Quadruplex Nucleic Acids
  作者：Filippo Doria、Matteo Nadai、Giosuè Costa、Giovanna Sattin、Caroline Gallati、Greta Bergamaschi、Federica Moraca、Stefano Alcaro、Mauro Freccero、Sara N. Richter

  DOI：10.1002/ejoc.201600757

  日期：2016.10

  Naphthalene diimides with one or two centrosymmetric arylethynyl moieties capable of synergic donor and acceptor hydrogen bonding exhibit promising binding properties and selectivity towards parallel G-quadruplex (G4) nucleic acids (c-myc, bcl-2 and parallel hTel22). The hydrogen-bonding network involving the phosphate backbone and outside rim of the G-quartet represents an opportunity to exploit G4

  具有一个或两个能够协同供体和受体氢键的中心对称芳乙炔基部分的萘二亚胺对平行 G-四链体 (G4) 核酸（c-myc、bcl-2 和平行 hTel22）表现出良好的结合特性和选择性。涉及磷酸盐骨架和 G-四重体外缘的氢键网络代表了利用 G4 选择性来扩展芳烃的机会。
• Hybrid ligand–alkylating agents targeting telomeric G-quadruplex structures
  作者：Filippo Doria、Matteo Nadai、Marco Folini、Marco Di Antonio、Luca Germani、Claudia Percivalle、Claudia Sissi、Nadia Zaffaroni、Stefano Alcaro、Anna Artese、Sara N. Richter、Mauro Freccero

  DOI：10.1039/c2ob06816h

  日期：——

  The synthesis, physico-chemical properties and biological effects of a new class of naphthalene diimides (NDIs) capable of reversibly binding telomeric DNA and alkylate it through an electrophilic quinone methide moiety (QM), are reported. FRET and circular dichroism assays showed a marked stabilization and selectivity towards telomeric G4 DNA folded in a hybrid topology. NDI–QMs’ alkylating properties

  据报道，新型萘二酰亚胺（NDI）的合成，理化性质和生物学效应能够可逆地结合端粒DNA并通过亲电子醌甲基化物部分（QM）将其烷基化。FRET和圆二色性分析显示出对杂化拓扑中折叠的端粒G4 DNA的显着稳定性和选择性。NDI-QMs的烷基化特性显示其对单个核苷具有良好的反应性，并且对端粒G4具有选择性。选定的NDI能够通过引起端粒功能障碍和端粒酶表达下调来显着损害黑素瘤细胞的生长。这些发现表明，我们的杂化配体烷基化NDI可作为开发新型靶向抗癌疗法的可能工具。