瑞德西韦杂质16 | 1355050-11-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 瑞德西韦杂质16
• 英文名称: remdesivir
• 英文别名: 2-ethylbutyl (2S)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxyphenoxyphosphoryl]amino]propanoate；(2S)-2-ethylbutyl 2-(((((2R,3S,4R,5R)-5-(4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(phenoxy)phosphoryl)amino)propanoate；2-ethylbutyl ((((2R,3S,4R,5R)-5-(4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(phenoxy)phosphoryl)-L-alaninate；GS-5734；2-ethylbutyl (2S)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-aminopyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)-5-cyano-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-phenoxyphosphoryl]amino]propanoate
• CAS: 1355050-11-1
• 化学式: C₂₇H₃₅N₆O₈P
• 分子量: 602.584
• InChiKey: RWWYLEGWBNMMLJ-MEUHYHILSA-N

物化性质

• 密度：
  1.47±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  204
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  瑞德西韦杂质16 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 2-ethylbutyl ((((2R,3S,4R,5R)-5-cyano-3,4-dihydroxy-5-(4-(4-oxo-4-((1-oxo-1-((4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)benzyl)amino)pent-4-yn-2 yl)amino)butanamido)pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(phenoxy)phosphoryl)-L-alaninate
  参考文献：
  名称：

  基于光亲和探针识别抗病毒药物抗SARS-CoV-2的潜在靶点

  摘要：

  面对突然爆发的2019冠状病毒病（COVID-19），开发针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的有效抗病毒药物迫在眉睫。药物再利用是治疗 COVID-19 的一种有前景的策略。为了确定已上市药物的精确靶蛋白，我们启动了化学生物学计划来确定潜在抗病毒药物的精确靶点。本研究基于FDA批准的药物司他夫定、瑞德西韦、阿昔洛韦和阿腺苷的结构，设计并合成了两种具有不同光亲和标记单元的重组人冠状病毒SARS-CoV-2 RdRp蛋白捕获探针。幸运的是，我们发现一种新型光亲和探针RD-1可以与残基ARG_553周围的SARS-CoV-2 RdRp表现出良好的亲和力。此外，RD-1探针还表现出对3CL蛋白酶的有效抑制活性。总而言之，我们的研究结果将阐明已上市药物功效的结构基础，并在识别新靶点的基础上探索快速有效的药物再利用策略。此外，这些结果也可为上市药物的临床应用提供科学依据。

  DOI：

  10.1002/ddr.22075
• 作为产物：
  描述：

  二氯磷酸苯酯 在 叔丁基氯化镁 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 瑞德西韦杂质16
  参考文献：
  名称：

  [EN] METHODS FOR TREATING FLAVIVIRIDAE VIRUS INFECTIONS
  [FR] MÉTHODES DE TRAITEMENT D'INFECTIONS VIRALES À FLAVIVIRIDAE

  摘要：

  提供了一种通过给予核苷类、核苷酸磷酸盐及其前药来治疗黄病毒科病毒感染的方法，其化学式为I：其中核苷糖的1'位置被取代。所提供的化合物、组合物和方法特别适用于寨卡病毒感染的治疗。

  公开号：

  WO2017184668A1

文献信息

• [EN] METHODS AND COMPOUNDS FOR TREATING PARAMYXOVIRIDAE VIRUS INFECTIONS<br/>[FR] PROCÉDÉS ET COMPOSÉS POUR TRAITER DES INFECTIONS À VIRUS PARAMYXOVIRIDAE
  申请人：GILEAD SCIENCES INC

  公开号：WO2012012776A1

  公开（公告）日：2012-01-26

  Provided are methods for treating Paramyxoviridae virus infections by administering ribosides, riboside phosphates and prodrugs thereof, of Formula (I): wherein the 1 ' position of the nucleoside sugar is substituted. The compounds, compositions, and methods provided are particularly useful for the treatment of Human parainfluenza and Human respiratory syncytial virus infections.

  提供了一种治疗Paramyxoviridae病毒感染的方法，通过给予具有以下式（I）的核苷糖苷、核苷糖磷酸和其前药：其中核苷糖的1'位置被取代。所提供的化合物、组合物和方法特别适用于治疗人类副流感病毒和人类呼吸道合胞病毒感染。
• [EN] METHODS FOR TREATING FILOVIRIDAE VIRUS INFECTIONS<br/>[FR] MÉTHODES POUR LE TRAITEMENT D'INFECTIONS VIRALES À FILOVIRIDAE
  申请人：GILEAD SCIENCES INC

  公开号：WO2016069826A1

  公开（公告）日：2016-05-06

  Provided are compounds, methods, and pharmaceutical compositions for treating Filoviridae vims infections by administering ribosides, riboside phosphates and prodrugs thereof, of Formula (IV): The compounds, compositions, and methods provided are particularly useful for the treatment of Marburg virus, Ebola virus and Cueva virus infections.

  提供了一种通过给予公式（IV）中的核糖苷、核糖苷磷酸盐及其前药来治疗Filoviridae病毒感染的化合物、方法和药物组合物。所提供的化合物、组合物和方法特别适用于治疗马尔堡病毒、埃博拉病毒和库埃瓦病毒感染。
• METHODS FOR TREATING ARENAVIRIDAE AND CORONAVIRIDAE VIRUS INFECTIONS
  申请人：Gilead Sciences, Inc.

  公开号：US20170071964A1

  公开（公告）日：2017-03-16

  Provided are methods for treating Arenaviridae and Coronaviridae virus infections by administering nucleosides and prodrugs thereof, of Formula I: wherein the 1′ position of the nucleoside sugar is substituted. The compounds, compositions, and methods provided are particularly useful for the treatment of Lassa virus and Junin virus infections.

  提供了通过给予核苷和其前药治疗Arenaviridae和Coronaviridae病毒感染的方法，其化学式为I： 其中核苷糖的1'位置被取代。所提供的化合物、组合物和方法特别适用于治疗拉沙病毒和胡宁病毒感染。
• [EN] N4-HYDROXYCYTIDINE AND DERIVATIVES AND ANTI-VIRAL USES RELATED THERETO<br/>[FR] N4-HYDROXYCYTIDINE ET SES DÉRIVÉS ET UTILISATIONS ANTIVIRALES ASSOCIÉES
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2021159044A1

  公开（公告）日：2021-08-12

  This disclosure relates to certain N4-hydroxycytidine derivatives, pharmaceutical compositions, and methods related thereto. In certain embodiments, the disclosure relates to the treatment or prophylaxis of human coronavirus 2019-nCoV.

  这项披露涉及某些N4-羟基胞苷衍生物、药物组合物以及相关方法。在某些实施方式中，该披露涉及治疗或预防人类冠状病毒2019-nCoV。
• A Chemoenzymatic Synthesis of the (<i>R</i>_P)-Isomer of the Antiviral Prodrug Remdesivir
  作者：Andrew N. Bigley、Tamari Narindoshvili、Frank M. Raushel

  DOI：10.1021/acs.biochem.0c00591

  日期：2020.8.25

  (SP)-diastereomer for remdesivir was reportedly due to the difficulty in producing the pure (RP)-diastereomer of the required precursor. However, the two currently known enzymes responsible for the initial activation step of remdesivir are each stereoselective and show differential tissue distribution. Given the ability of the COVID-19 virus to infect a wide array of tissue types, inclusion of the (RP)-diastereomer

  COVID-19 大流行可能会压垮世界各地的医疗系统。目前 FDA 批准的唯一直接针对病毒的治疗方法是 ProTide 前药瑞德西韦。在其激活形式下，瑞德西韦通过抑制必需的 RNA 依赖性 RNA 聚合酶来防止病毒复制。与其他 ProTide 前药一样，瑞德西韦含有手性磷中心。据报道，最初选择瑞德西韦的 ( SP )-非对映体是因为难以生产所需前体的纯 ( RP )-非对映体。然而，目前已知的负责瑞德西韦初始激活步骤的两种酶均具有立体选择性，并显示出不同的组织分布。鉴于 COVID-19 病毒能够感染多种组织类型，包含 ( RP ) -非对映异构体可能具有临床意义。为了帮助克服获得瑞德西韦纯 ( RP )-非对映异构体的挑战，我们开发了一种新型化学酶策略，利用来自假单胞菌的磷酸三酯酶的立体选择性变体，能够轻松分离纯 ( RP )-非对映异构体用于化学合成瑞德西韦 ( RP ) -非对映异构体的手性前体。