Design, Synthesis, and Biological and Structural Evaluations of Novel HIV-1 Protease Inhibitors To Combat Drug Resistance
作者:Maloy Kumar Parai、David J. Huggins、Hong Cao、Madhavi N. L. Nalam、Akbar Ali、Celia A. Schiffer、Bruce Tidor、Tariq M. Rana
DOI:10.1021/jm300238h
日期:2012.7.26
A series of new HIV-1 protease inhibitors (PIs) were designed using a general strategy that combines computational structure-based design with substrate-envelope constraints. The PIs incorporate various alcohol-derived P2 carbamates with acyclic and cyclic heteroatomic functionalities into the (R)-hydroxyethylamine isostere. Most of the new PIs show potent binding affinities against wild-type HIV-1
一系列新的 HIV-1 蛋白酶抑制剂 (PI) 是使用一种通用策略设计的,该策略将基于计算结构的设计与底物包络约束相结合。PI 将具有无环和环状杂原子官能团的各种醇衍生的 P2 氨基甲酸酯结合到 ( R )-羟乙胺等排体中。大多数新的 PI 显示出对野生型 HIV-1 蛋白酶和三种多重耐药 (MDR) 变体的有效结合亲和力。特别是,含有 2,2-二氯乙酰胺、吡咯烷酮、咪唑烷酮和 恶唑烷酮部分的抑制剂在 P2 处对K i最有效皮摩尔范围内的值。几种新的 PI 对来自 HIV-1 进化枝 A、B 和 C 以及两种 MDR 变体的患者来源的野生型病毒表现出纳摩尔级的抗病毒效力。四种有效抑制剂的晶体结构分析表明,新 P2 部分的羰基促进了与蛋白酶不变的 Asp29 残基的广泛氢键相互作用。这些构效关系的发现可用于设计具有增强的酶抑制和抗病毒效力的新 PI。