4-chloro-9H-pyrimido[4,5-b]indole | 5719-08-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 4-chloro-9H-pyrimido[4,5-b]indole
• CAS: 5719-08-4
• 化学式: C₁₀H₆ClN₃
• 分子量: 203.631
• InChiKey: ZCYULQVZSXKVFP-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  288-290 °C
• 沸点：
  416.8±25.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.515±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3
• 重原子数：
  14
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  41.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-chloro-9H-pyrimido[4,5-b]indole 在 氨 、 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 29.17h， 生成 4-(N,N-dimethylaminomethylidene)amino-9-(2'-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-9H-pyrido[4,5-b]indole
  参考文献：
  名称：

  具有极高空穴传输能力的DNA线的合理设计

  摘要：

  DNA 是一种很有前途的导电生物聚合物。然而，要实现真正的 DNA 线，还需要解决一些问题。这些包括空穴传输效率低和空穴传输过程中可能发生的严重氧化损伤。我们已经展示了一种用于设计 DNA 线的协议，该协议可以有效地介导空穴传输，在通过 DNA 双链的空穴传输过程中不会受到氧化的不利影响。我们通过结合设计的核碱基苯并脱氮杂腺嘌呤衍生物合成了一种稳定有效的 DNA 线，它们具有较低的氧化电位和较宽的堆积面积，但在空穴传输过程中不会分解。

  DOI：

  10.1021/ja0294008
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基吲哚-3-羧酸甲酯 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 4-chloro-9H-pyrimido[4,5-b]indole
  参考文献：
  名称：

  [EN] COMPOUNDS AND METHODS
  [FR] COMPOSÉS ET PROCÉDÉS

  摘要：

  揭示了具有化学式（I）的化合物，其中R1、R2、R3、R4、Z1、Z2、Z3和Z4如本文所定义，并且揭示了制备和使用这些化合物的方法。

  公开号：

  WO2011056739A1

文献信息

• Discovery and Evaluation of Enantiopure 9H-pyrimido[4,5-b]indoles as Nanomolar GSK-3β Inhibitors with Improved Metabolic Stability
  作者：Stanislav Andreev、Tatu Pantsar、Ahmed El-Gokha、Francesco Ansideri、Mark Kudolo、Débora Bublitz Anton、Giulia Sita、Jenny Romasco、Christian Geibel、Michael Lämmerhofer、Márcia Ines Goettert、Andrea Tarozzi、Stefan A. Laufer、Pierre Koch

  DOI：10.3390/ijms21217823

  日期：——

  Glycogen synthase kinase-3β (GSK-3β) is a potential target in the field of Alzheimer’s disease drug discovery. We recently reported a new class of 9H-pyrimido[4,5-b]indole-based GSK-3β inhibitors, of which 3-(3-((7-chloro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)(methyl)amino)piperidin-1-yl)propanenitrile (1) demonstrated promising inhibitory potency. However, this compound underwent rapid degradation by human liver microsomes. Starting from 1, we prepared a series of amide-based derivatives and studied their structure–activity relationships against GSK-3β supported by 1 µs molecular dynamics simulations. The biological potency of this series was substantially enhanced by identifying the eutomer configuration at the stereocenter. Moreover, the introduction of an amide bond proved to be an effective strategy to eliminate the metabolic hotspot. The most potent compounds, (R)-3-(3-((7-chloro-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl)(methyl)amino)piperidin-1-yl)-3-oxopropanenitrile ((R)-2) and (R)-1-(3-((7-bromo-9Hpyrimido[4,5-b]indol-4-yl)(methyl)amino)piperidin-1-yl)propan-1-one ((R)-28), exhibited IC50 values of 480 nM and 360 nM, respectively, and displayed improved metabolic stability. Their favorable biological profile is complemented by minimal cytotoxicity and neuroprotective properties.

  糖原合成酶激酶-3β（GSK-3β）是阿尔茨海默病药物发现领域的潜在靶点。我们最近报道了一类新的基于9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚的GSK-3β抑制剂，其中3-(3-((7-氯-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-4-基)(甲基)氨基)哌啶-1-基)丙腈（1）展现出有希望的抑制效能。然而，这种化合物在人类肝微粒体中迅速降解。从1开始，我们制备了一系列基于酰胺的衍生物，并通过1微秒分子动力学模拟研究了它们与GSK-3β的结构活性关系。通过确定立体中心处的优势构型，这一系列的生物效能得到了显著增强。此外，引入酰胺键被证明是消除代谢热点的有效策略。最有效的化合物，（R）-3-(3-((7-氯-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-4-基)(甲基)氨基)哌啶-1-基)-3-氧代丙腈（（R）-2）和（R）-1-(3-((7-溴-9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚-4-基)(甲基)氨基)哌啶-1-基)丙酮（（R）-28），分别展现出480 nM和360 nM的IC50值，并表现出改善的代谢稳定性。它们有利的生物特性得到了最低的细胞毒性和神经保护性质的补充。
• [EN] 9H-PYRIMIDO[4,5-B]INDOLES, 9H-PYRIDO[4',3':4,5]PYRROLO[2,3-D]PYRIDINES, AND 9H-1,3,6,9-TETRAAZA-FLUORENES AS CHK1 KINASE FUNCTION INHIBITORS<br/>[FR] 9H-PYRIMIDO[4,5-B]INDOLES, 9H-PYRIDO[4',3':4,5]PYRROLO[2,3-D]PYRIDINES, ET 9H-1,3,6,9-TÉTRAAZA-FLUORÈNES EN TANT QU'INHIBITEURS DE LA FONCTION KINASE CHK1
  申请人：CANCER REC TECH LTD

  公开号：WO2009004329A1

  公开（公告）日：2009-01-08

  The present invention pertains generally to the field of therapeutic compounds, and more specifically to certain tricyclic compounds (referred to herein as TC compounds), and especially certain 9H-pyrimido[4,5-b]indole, 9H-pyrido[4',3':4,5]pyrrolo[2,3-d)pyridine, and 9H-1,3,6,9-tetraaza-fluorene compounds, which, inter alia, inhibit Checkpoint Kinase 1 (CHK1) kinase function. The present invention also pertains to pharmaceutical compositions comprising such compounds, and the use of such compounds and compositions, both in vitro and in vivo, to inhibit CHK1 kinase function, and in the treatment of diseases and conditions that are mediated by CHK1, that are ameliorated by the inhibition of CHK1 kinase function, etc., including proliferative conditions such as cancer, etc., optionally in combination with another agent, for example, (a) a DNA topoisomerase I or Il inhibitor; (b) a DNA damaging agent; (c) an antimetabolite or TS inhibitor; (d) a microtubule targeted agent; and (e) ionising radiation.

  本发明一般涉及治疗化合物领域，更具体地涉及某些三环化合物（在此称为TC化合物），特别是某些9H-嘧啶并[4,5-b]吲哚，9H-吡啶并[4'，3'：4,5]吡咯[2,3-d]吡啶和9H-1,3,6,9-四氮杂芴化合物，这些化合物等等，能够抑制检查点激酶1（CHK1）激酶功能。本发明还涉及包含这些化合物的药物组合物，以及在体内外使用这些化合物和组合物来抑制CHK1激酶功能，并用于治疗由CHK1介导的疾病和症状，通过抑制CHK1激酶功能改善的疾病和症状等，包括癌症等增殖性疾病，可选地与另一药剂结合，例如，（a）DNA拓扑异构酶I或II抑制剂；（b）DNA损伤剂；（c）抗代谢物或TS抑制剂；（d）微管靶向剂；和（e）电离辐射。
• Synthesis and antiviral activity of 4,6-disubstituted pyrimido[4,5-b]indole ribonucleosides
  作者：Michal Tichý、Radek Pohl、Hao Ying Xu、Yen-Liang Chen、Fumiaki Yokokawa、Pei-Yong Shi、Michal Hocek

  DOI：10.1016/j.bmc.2012.08.021

  日期：2012.10

  A series of new pyrimido[4,5-b]indole ribonucleosides bearing phenyl or hetaryl group at position 4 has been prepared by selective Pd-catalyzed cross-coupling reactions of the corresponding protected 4,6-dichloropyrimido[4,5-b]indole ribonucleoside with (het)arylboronic acids or stannanes followed by deprotection. Further cross-couplings under harsher conditions and employing X-Phos ligand proceeded

  通过相应保护的4,6-二氯嘧啶基[4,5- b ]的选择性Pd催化交叉偶联反应，制备了一系列新的在位置4带有苯基或杂芳基的嘧啶并[4,5- b ]吲哚核糖核苷。吲哚核糖核苷与（杂）芳基硼酸或锡烷，然后脱保护。在更苛刻的条件下和使用X-Phos配体的进一步交叉偶联在位置6进行，得到4,6-二取代的嘧啶并[4,5- b ]吲哚核糖核苷。这些化合物中的某些显示出对登革热病毒的抗病毒活性。
• Substituent Effects on Drug–Receptor H-bond Interactions: Correlations Useful for the Design of Kinase Inhibitors
  作者：Brian G. Lawhorn、Joanne Philp、Alan P. Graves、Dennis A. Holt、Gregory J. Gatto、Lara S. Kallander

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01342

  日期：2016.12.8

  o)benzenesulfonamide inhibitors that display excellent potency and selectivity against a broad spectrum of protein kinases. Crystal structures of prototypical members bound to the ATP-binding site of TNNI3K reveal two anchoring hydrogen bond contacts: (1) from the hinge region amide N–H to the pyrimidine nitrogen and (2) from the sulfonamide N–H to the gatekeeper threonine. Evaluation of various para-substituted

  肌钙蛋白I相互作用激酶（TNNI3K）作为治疗心力衰竭的潜在靶点的研究已经产生了一系列取代的N-甲基-3-（嘧啶-4-基氨基）苯磺酰胺抑制剂，它们对广泛的药物具有优异的药效和选择性。蛋白激酶的光谱。与TNNI3K的ATP结合位点结合的原型成员的晶体结构揭示了两个锚定氢键接触：（1）从铰链区酰胺N–H到嘧啶氮和（2）从磺酰胺N–H到关守苏氨酸。不同的评价对-取代的苯磺酰胺定义了由对磺酰胺H键供体强度的调节而产生的对结合亲和力的取代作用。对于铰链NH-嘧啶H-键相互作用出现了相反的电子效应，这在计算的H-键受体强度与各种铰链结合杂环的TNNI3K亲和力的相关性中进一步阐明。这些与药物-受体H键相互作用的基本相关性通常可能是在激酶抑制剂设计中优化效价和选择性的有用工具。
• Design, synthesis, and structure–activity relationships of pyrimido[4,5- b ]indole-4-amines as microtubule depolymerizing agents that are effective against multidrug resistant cells
  作者：Ravi Kumar Vyas Devambatla、Wei Li、Nilesh Zaware、Shruti Choudhary、Ernest Hamel、Susan L. Mooberry、Aleem Gangjee

  DOI：10.1016/j.bmcl.2017.05.085

  日期：2017.8

  vitro. Compounds 2 and 6 also depolymerized microtubules comparable to the lead compound 1. Compounds 2, 3, 6 and 8 were effective in cells expressing P-glycoprotein or the βIII isotype of tubulin, mechanisms that are associated with clinical drug resistance to microtubule targeting drugs. Proton NMR and molecular modeling studies were employed to identify the structural basis for the microtubule depolymerizing

  为了鉴定9的结构特征ħ嘧啶并[4,5- b ]吲哚如微管解聚，嘧啶并[4,5- b ]吲哚2 - 8与改变的取代基在2-，4-和设计5-位并合成。2,5-取代-4-氯嘧啶并[4,5-的亲核置换b ]与适当的芳基胺的吲哚是在靶的合成的最后一步的化合物2 - 8。化合物2和6在体外对MDA-MB-435，SK-OV-3和HeLa癌细胞具有两位数的纳摩尔效能（IC 50）。化合物2和6还解聚了微管，可与铅化合物1相媲美。化合物2，3，6和8是有效的在表达P-糖蛋白或微管蛋白的同种型βIII，是与临床耐药性微管靶向药物相关的机制的细胞。质子核磁共振和分子模型研究被用来确定嘧啶[4,5- b ]吲哚的微管解聚活性的结构基础。