β-Homoalanyl-PNA: A Special Case of β-Peptides with β-Sheet-Like Backbone Conformation; Organization in Higher Ordered Structures
作者:Ulf Diederichsen、Harald W. Schmitt
DOI:10.1002/(sici)1099-0690(199805)1998:5<827::aid-ejoc827>3.0.co;2-b
日期:1998.5
Although β-homoalanyl peptide nucleic acid oligomers possess a β-peptide backbone, they contain nucleobases in their side chains and are thus an interesting special case of β-peptides. These nucleobases are mainly responsible for the formation of secondary structures through base pairing and stacking. We have investigated the pairing properties of β-homoalanyl-PNA oligomers using adenine and 7-carbaadenine
尽管 β-高丙氨酰肽核酸寡聚体具有 β-肽骨架,但它们的侧链含有核碱基,因此是 β-肽的一个有趣的特例。这些核碱基主要负责通过碱基配对和堆叠形成二级结构。我们已经使用腺嘌呤和 7-碳腺嘌呤研究了 β-高丙氨酰-PNA 低聚物的配对特性。简单的模型研究表明,Watson-Crick 和 Hoogsteen 配对平面的存在是嘌呤基 β-PNA 的固有结构特征。因此,腺嘌呤-β-PNA 六聚体和五聚体形成更高的有序结构,而缺少 Hoogsteen 配对位点的 7-碳腺嘌呤-β-PNA 六聚体则以双链形式配对。描述了腺苷酸和碳腺苷酸 β-核氨基酸的合成及其寡聚化。通过实验和简单的模型研究研究了配对模式和链方向。在 β-肽的背景下,β-PNA 寡聚体大部分倾向于以双链形式存在,并且更喜欢扩展的 β-片状骨架构象,除了观察到的 β- 31 螺旋外,它提供了一个有趣的结构基序。肽。