2-(hydroxymethyl)dodecanoic acid | 1134854-98-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 2-(hydroxymethyl)dodecanoic acid
• 英文别名: 2-decyl-3-hydroxypropionic acid
• CAS: 1134854-98-0
• 化学式: C₁₃H₂₆O₃
• 分子量: 230.348
• InChiKey: VFYUTMSIBNWUQS-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  362.6±25.0 °C(predicted)
• 密度：
  0.977±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.92
• 拓扑面积：
  57.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(hydroxymethyl)dodecanoic acid 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.5h， 以16%的产率得到3-decyloxetan-2-one
  参考文献：
  名称：

  酪蛋白水解蛋白酶（ClpP）抑制的机制

  摘要：

  如果可以，请联系我：ClpP蛋白酶介导蛋白质稳态，并且可以被β-内酯有效地抑制。分子对接，诱变，基于活性的蛋白质谱分析和动力学研究相结合，现在揭示了ClpP抑制的机制。活性位点旁边的疏水口袋允许长的脂肪族和芳香族残基结合。优选的立体异构体结合到氧阴离子孔中。

  DOI：

  10.1002/anie.201204690
• 作为产物：
  描述：

  1-碘癸烷 在 锂硼氢 、 sodium hydride 、 potassium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 异丙醇 为溶剂， 反应 25.58h， 生成 2-(hydroxymethyl)dodecanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Mechanistic analysis of aliphatic β-lactones in Vibrio harveyi reveals a quorum sensing independent mode of action

  摘要：

  β-内酰胺类似物质能够通过干扰脂肪酸合成的机制，强有力地抑制Vibrio harveyi的生物发光，而不需要依赖群体感应。

  DOI：

  10.1039/c6cc05807h

文献信息

• The Mechanism of Caseinolytic Protease (ClpP) Inhibition
  作者：Malte Gersch、Felix Gut、Vadim S. Korotkov、Johannes Lehmann、Thomas Böttcher、Marion Rusch、Christian Hedberg、Herbert Waldmann、Gerhard Klebe、Stephan A. Sieber

  DOI：10.1002/anie.201204690

  日期：2013.3.4

  Catch me if you can: The ClpP protease mediates protein homeostasis and can be efficiently inhibited by β‐lactones. A combination of molecular docking, mutagenesis, activity‐based protein profiling, and kinetics studies now reveals the mechanism of ClpP inhibition. A hydrophobic pocket next to the active site allows binding of long aliphatic and aromatic residues. The preferred stereoisomer binds into

  如果可以，请联系我：ClpP蛋白酶介导蛋白质稳态，并且可以被β-内酯有效地抑制。分子对接，诱变，基于活性的蛋白质谱分析和动力学研究相结合，现在揭示了ClpP抑制的机制。活性位点旁边的疏水口袋允许长的脂肪族和芳香族残基结合。优选的立体异构体结合到氧阴离子孔中。
• Solid-phase synthesis of a library of linear oligoester ion-channels
  作者：Thomas Murray Fyles、Horace Luong

  DOI：10.1039/b816648j

  日期：——

  A solid-phase synthesis protocol was used to prepare fifteen new linear tetra-, and penta-esters structurally related to an active lead compound. The structures were assembled from three types of hydroxyl protected building blocks: monoalkyl esters of hydroxyglutaric acid, ω-hydroxyacids, and α-hydroxymethylalkanoic acids. The standard methodology gave acceptable quantities of material free of small molecule impurities. Mass spectrometric analysis revealed the presence of deletions due to incomplete coupling, as well as additions and macrolactones due to partial acidic rearrangement on release from the solid-support. The amount of these impurities could be estimated from the 1H NMR spectra, and their implications for subsequent activity analysis are discussed.

  采用固相合成协议制备了十五种新的线性四酯和五酯，这些化合物的结构与一种活性先导化合物相关。结构由三种类型的羟基保护构建块组装而成：羟基戊二酸的单烷基酯、ω-羟基酸和α-羟基甲基烷酸。标准方法得到了数量可接受、未含小分子杂质的材料。质谱分析揭示了因耦合不完全而导致的缺失，以及因从固体支持释放后的部分酸重排而引起的附加物和大环内酯的存在。通过1H NMR光谱可以估计这些杂质的数量，并讨论它们对后续活性分析的影响。
• Mechanistic analysis of aliphatic β-lactones in Vibrio harveyi reveals a quorum sensing independent mode of action
  作者：Weining Zhao、Nicola Lorenz、Kirsten Jung、Stephan A. Sieber

  DOI：10.1039/c6cc05807h

  日期：——

  β-Lactone analogs of autoinducers potently inhibitVibrio harveyibioluminescence using a quorum sensing independent mechanism interfering with fatty acid biosynthesis.

  β-内酰胺类似物质能够通过干扰脂肪酸合成的机制，强有力地抑制Vibrio harveyi的生物发光，而不需要依赖群体感应。