ethyl 2-(5-hydroxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetate | 944249-69-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: ethyl 2-(5-hydroxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetate
• 英文别名: ethyl (5-hydroxymethyluracil-1-yl)acetate；Ethyl 2-[5-(hydroxymethyl)-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]acetate；ethyl 2-[5-(hydroxymethyl)-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]acetate
• CAS: 944249-69-8
• 化学式: C₉H₁₂N₂O₅
• 分子量: 228.205
• InChiKey: DZEMECLAAHLGPQ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  178-180 °C
• 密度：
  1.338±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  95.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 2-(5-hydroxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetate 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.83h， 生成 N-((2S,3R)-3-hydroxy-4-(N-isobutyl-4-nitrophenylsulfonamido)-1-phenylbutan-2-yl)-2-(5-hydroxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  具有嘧啶碱基作为新型P2配体以增强抗DRV耐药HIV-1变体活性的有效HIV-1蛋白酶抑制剂的初步SAR和生物学评估。

  摘要：

  将嘧啶碱基（核酸的基本成分）引入P2配体可能会增强人类免疫缺陷病毒1（HIV-1）蛋白酶抑制剂的效力，因为羰基和氨基会促进广泛的氢键相互作用的形成。在这项工作中，我们提供的证据是抑制剂10e，以N-2-（2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1（2H）-基）乙酰胺为P2配体，以4-甲氧基苯基磺酰胺为P2'配体具有显着的酶抑制和抗病毒活性，体外IC50为2.53 nM，体内对野生型HIV-1的抑制率为68％，细胞毒性低。该抑制剂还对DRV耐药的HIV-1变体表现出明显的抗病毒活性，这对进一步研究具有重要的价值。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111866
• 作为产物：
  描述：

  5-羟甲基脲嘧啶 、 溴乙酸乙酯 在 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 以30%的产率得到ethyl 2-(5-hydroxymethyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)acetate
  参考文献：
  名称：

  具有嘧啶碱基作为新型P2配体以增强抗DRV耐药HIV-1变体活性的有效HIV-1蛋白酶抑制剂的初步SAR和生物学评估。

  摘要：

  将嘧啶碱基（核酸的基本成分）引入P2配体可能会增强人类免疫缺陷病毒1（HIV-1）蛋白酶抑制剂的效力，因为羰基和氨基会促进广泛的氢键相互作用的形成。在这项工作中，我们提供的证据是抑制剂10e，以N-2-（2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1（2H）-基）乙酰胺为P2配体，以4-甲氧基苯基磺酰胺为P2'配体具有显着的酶抑制和抗病毒活性，体外IC50为2.53 nM，体内对野生型HIV-1的抑制率为68％，细胞毒性低。该抑制剂还对DRV耐药的HIV-1变体表现出明显的抗病毒活性，这对进一步研究具有重要的价值。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.111866

文献信息

• Hydrophilic modifications in peptide nucleic acid — Synthesis and properties of PNA possessing 5-hydroxymethyluracil and 5-hydroxymethylcytosine
  作者：Robert HE Hudson、Yuhong Liu、Filip Wojciechowski

  DOI：10.1139/v07-030

  日期：2007.4.1

  precedent, we prepared a peptide nucleic acid monomer, possessing 5-hydroxymethyuracil, which was compatible with Fmoc-based oligopeptide synthesis. An improved, large-scale synthesis of 5-hydroxymethylcytosine was developed, as a starting point for the synthesis of a monomer containing this nucleobase. In each case, the hydroxyl group was blocked as a t-butyldiphenylsilyl ether, and the exocyclic amino

  我们研究了在肽核酸 (PNA) 中掺入 C5-羟甲基-尿嘧啶和 -胞嘧啶的化学过程以及这种修饰对 PNA 杂交行为的后续影响。很大程度上基于文献先例，我们制备了一种肽核酸单体，具有 5-羟基甲氧嘧啶，与基于 Fmoc 的寡肽合成兼容。开发了一种改进的、大规模的 5-羟甲基胞嘧啶合成方法，作为合成含有该核碱基的单体的起点。在每种情况下，羟基被封闭为叔丁基二苯基甲硅烷基醚，胞嘧啶的环外氨基另外被苯甲酰基封闭。使用标准方案将修饰的单体并入寡聚体序列中的分离位置。
• Preliminary SAR and biological evaluation of potent HIV-1 protease inhibitors with pyrimidine bases as novel P2 ligands to enhance activity against DRV-resistant HIV-1 variants
  作者：Mei Zhu、Ling Ma、Huiyu Zhou、Biao Dong、Yujia Wang、Zhen Wang、Jinming Zhou、Guoning Zhang、Juxian Wang、Chen Liang、Shan Cen、Yucheng Wang

  DOI：10.1016/j.ejmech.2019.111866

  日期：2020.1

  to P2 ligands might enhance the potency of Human Immunodeficiency Virus-1 (HIV-1) protease inhibitors because of the carbonyl and amino groups promoting the formation of extensive hydrogen bonding interactions. In this work, we provide evidence that inhibitor 10e, with N-2-(2,4-Dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl) acetamide as the P2 ligand and a 4-methoxylphenylsulfonamide as the P2' ligand, displayed

  将嘧啶碱基（核酸的基本成分）引入P2配体可能会增强人类免疫缺陷病毒1（HIV-1）蛋白酶抑制剂的效力，因为羰基和氨基会促进广泛的氢键相互作用的形成。在这项工作中，我们提供的证据是抑制剂10e，以N-2-（2,4-二氧代-3,4-二氢嘧啶-1（2H）-基）乙酰胺为P2配体，以4-甲氧基苯基磺酰胺为P2'配体具有显着的酶抑制和抗病毒活性，体外IC50为2.53 nM，体内对野生型HIV-1的抑制率为68％，细胞毒性低。该抑制剂还对DRV耐药的HIV-1变体表现出明显的抗病毒活性，这对进一步研究具有重要的价值。