dimethyl 4-benzyl-2-oxoglutarate | 174678-99-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 酮酸及其衍生物
• 英文名称: dimethyl 4-benzyl-2-oxoglutarate
• 英文别名: dimethyl 2-oxo-4-(phenylmethyl)glutarate；Dimethyl 2-benzyl-4-oxopentanedioate；dimethyl 2-benzyl-4-oxopentanedioate
• CAS: 174678-99-0
• 化学式: C₁₄H₁₆O₅
• 分子量: 264.278
• InChiKey: BEHUVKZVQBDMTN-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  387.1±35.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.170±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  69.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  dimethyl 4-benzyl-2-oxoglutarate 在 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以100%的产率得到dilithium 4-benzyl-2-oxoglutarate
  参考文献：
  名称：

  一系列4-取代的谷氨酸类似物的化学酶法合成及其在人谷氨酸转运蛋白亚型1-3上的药理学表征。

  摘要：

  从其相应的4-取代的酮戊二酸（2a-i）以高收率和高对映体过量（> 99％ee）合成了九个L-2,4-syn-4-烷基谷氨酸类似物系列（1a-i） ，使用猪心脏或大肠杆菌中的天冬氨酸氨基转移酶（AAT）。在FLIPR膜电位（FMP）分析中，将合成的化合物评估为谷氨酸转运蛋白EAAT1，EAAT2和EAAT3（兴奋性氨基酸转运蛋白，亚型1-3）的潜在配体。当4-甲基（化合物1a，EAAT1底物和EAAT2,3抑制剂）扩展到4-乙基，化合物1b时，我们发现药理学特性发生了显着变化，因为该类似物是所有三种亚型的抑制剂，EAAT1-3。此外，我们得出的结论是，L-2的4位上的疏水取代基既大又庞大，

  DOI：

  10.1021/jm050597z
• 作为产物：
  描述：

  dimethyl 2,2-dimethoxyglutarate 在 三氟乙酸 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 dimethyl 4-benzyl-2-oxoglutarate
  参考文献：
  名称：

  使用非生物辅因子对组蛋白去甲基化酶进行等位基因特异性化学拯救

  摘要：

  由于它们在折叠和功能上的相似性，从共同祖先基因进化而来的密切相关的蛋白质家族在开发成员特异性和亚型特异性化学探针方面存在重大障碍。在这项工作中，我们探索了一种等位基因特异性化学拯救策略，以使用合成辅助因子激活野生型蛋白质的“死”变体，并证明其成功应用于依赖 α-酮戊二酸 (αKG) 的组蛋白去甲基化酶 4 的成员(KDM4) 家族。我们表明，催化位点中特定残基的突变使变体对天然共底物无活性。相比之下，具有适当立体电子特征的 αKG 衍生物赋予突变体类似天然的去甲基化酶活性，同时对一组野生型双加氧酶保持耐火性。正交酶辅因子对证明了细胞环境中全长染色体组蛋白的位点和程度特异性赖氨酸去甲基化。我们的工作提供了一种策略，通过识别和改造保守的苯丙氨酸残基来调节特定的组蛋白去甲基化酶，该残基充当 KDM4 亚家族中的看门人，使酶对一组新的 αKG 衍生物敏感。本文开发的正交对将用作研究哺乳动物基因表达

  DOI：

  10.1021/acschembio.1c00335

文献信息

• Synthesis of 2-oxoglutarate derivatives and their evaluation as cosubstrates and inhibitors of human aspartate/asparagine-β-hydroxylase
  作者：Lennart Brewitz、Yu Nakashima、Christopher J. Schofield

  DOI：10.1039/d0sc04301j

  日期：——

  natural product present in human nutrition, was the most efficient alternative cosubstrate identified; crystallographic analyses reveal the binding mode of (R)-3-methyl-2OG and other 2OG derivatives to AspH and inform on the balance between turnover and inhibition. The results will enable the use of 2OG derivatives as mechanistic probes for other 2OG utilizing enzymes and suggest 2-oxoacids other than

  2-氧戊二酸 (2OG) 参与生物过程，包括 2OG 加氧酶催化的氧化反应，它是 2OG 加氧酶的共底物。真核生物 2OG 加氧酶在胶原蛋白生物合成、脂质代谢、DNA/RNA 修饰、转录调节和缺氧反应中发挥作用。天冬氨酸/天冬酰胺-β-羟化酶 (AspH) 是一种人 2OG 加氧酶，催化内质网表皮生长因子样结构域 (EGFD) 中 Asp/Asn 残基的翻译后羟基化。 AspH 具有化学意义，因为它的 Fe( II ) 辅因子由两个而不是典型的三个残基络合。 AspH 在缺氧情况下上调，是癌细胞表面的预后标志物。我们描述了关于其天然 2OG 共底物的衍生物如何调节 AspH 活性的研究。据报道，通过氰基硫内鎓中间体进行 C3-和/或 C4-取代的 2OG 衍生物的有效合成。对 >30 2OG 衍生物进行的基于质谱的 AspH 测定表明，某些衍生物通过与 2OG 竞争来有效抑制 AspH，这
• Catalytic triple carbonylation of olefins. Enantioselective synthesis of 2-oxoglutarates
  作者：Martin Sperrle、Giambattista Consiglio

  DOI：10.1016/0022-328x(95)05654-8

  日期：1996.1

  A new carbonylation reaction, namely “triple carbonylation” of olefins catalysed by cationic palladium complexes to substituted 2-oxoglutarates, has been developed. Even though the chemoselectivity is not high, this reaction allows a one-step synthesis of substituted 2-oxoglutarates with fair to excellent enantioselectivity (enantiomeric excess up to 92%). The reaction is completely regioselective

  已经开发出一种新的羰基化反应，即通过阳离子钯络合物催化的烯烃的“三羰基化”反应生成取代的2-氧戊二酸酯。即使化学选择性不高，该反应也可以一步合成具有良好的对映选择性（对映体过量高达92％）的取代的2-氧戊二酸酯。该反应对苯乙烯是完全区域选择性的，而与脂族烯烃形成两种区域异构体。
• Chemoenzymatic Synthesis of a Series of 4-Substituted Glutamate Analogues and Pharmacological Characterization at Human Glutamate Transporters Subtypes 1−3
  作者：Sebastien Alaux、Mie Kusk、Emanuelle Sagot、Jean Bolte、Anders A. Jensen、Hans Bräuner-Osborne、Thierry Gefflaut、Lennart Bunch

  DOI：10.1021/jm050597z

  日期：2005.12.1

  4-syn-4-alkylglutamic acid analogues (1a-i) were synthesized in high yield and high enantiomeric excess (>99% ee) from their corresponding 4-substituted ketoglutaric acids (2a-i), using the enzyme aspartate aminotransferase (AAT) from pig heart or E. coli. The synthesized compounds were evaluated as potential ligands for the glutamate transporters EAAT1, EAAT2, and EAAT3 (excitatory amino acid transporter, subtypes

  从其相应的4-取代的酮戊二酸（2a-i）以高收率和高对映体过量（> 99％ee）合成了九个L-2,4-syn-4-烷基谷氨酸类似物系列（1a-i） ，使用猪心脏或大肠杆菌中的天冬氨酸氨基转移酶（AAT）。在FLIPR膜电位（FMP）分析中，将合成的化合物评估为谷氨酸转运蛋白EAAT1，EAAT2和EAAT3（兴奋性氨基酸转运蛋白，亚型1-3）的潜在配体。当4-甲基（化合物1a，EAAT1底物和EAAT2,3抑制剂）扩展到4-乙基，化合物1b时，我们发现药理学特性发生了显着变化，因为该类似物是所有三种亚型的抑制剂，EAAT1-3。此外，我们得出的结论是，L-2的4位上的疏水取代基既大又庞大，
• Allele-Specific Chemical Rescue of Histone Demethylases Using Abiotic Cofactors
  作者：Valerie Scott、Debasis Dey、Jordan Kuwik、Kathryn Hinkelman、Megan Waldman、Kabirul Islam

  DOI：10.1021/acschembio.1c00335

  日期：2022.12.16

  dioxygenases. The orthogonal enzyme-cofactor pairs demonstrated site- and degree-specific lysine demethylation on a full-length chromosomal histone in the cellular milieu. Our work offers a strategy to modulate a specific histone demethylase by identifying and engineering a conserved phenylalanine residue, which acts as a gatekeeper in the KDM4 subfamily, to sensitize the enzyme toward a novel set

  由于它们在折叠和功能上的相似性，从共同祖先基因进化而来的密切相关的蛋白质家族在开发成员特异性和亚型特异性化学探针方面存在重大障碍。在这项工作中，我们探索了一种等位基因特异性化学拯救策略，以使用合成辅助因子激活野生型蛋白质的“死”变体，并证明其成功应用于依赖 α-酮戊二酸 (αKG) 的组蛋白去甲基化酶 4 的成员(KDM4) 家族。我们表明，催化位点中特定残基的突变使变体对天然共底物无活性。相比之下，具有适当立体电子特征的 αKG 衍生物赋予突变体类似天然的去甲基化酶活性，同时对一组野生型双加氧酶保持耐火性。正交酶辅因子对证明了细胞环境中全长染色体组蛋白的位点和程度特异性赖氨酸去甲基化。我们的工作提供了一种策略，通过识别和改造保守的苯丙氨酸残基来调节特定的组蛋白去甲基化酶，该残基充当 KDM4 亚家族中的看门人，使酶对一组新的 αKG 衍生物敏感。本文开发的正交对将用作研究哺乳动物基因表达