1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-pyrrole-2-carbaldehyde | 540522-54-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-pyrrole-2-carbaldehyde
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrrole-2-carbaldehyde
• CAS: 540522-54-1
• 化学式: C₁₀H₁₃NO₄
• 分子量: 211.218
• InChiKey: IMKSQOVZNLBHNV-IVZWLZJFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.2
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  71.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-pyrrole-2-carbaldehyde 在 磷酸三甲酯 、 Proton Sponge 、 三氯氧磷 、 三正丁胺 、 三丁基焦磷酸铵 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-pyrrole-2-carbaldehyde-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  吡咯-2-甲醛和9-甲基咪唑并[(4,5)-b]吡啶之间形状互补的非天然疏水碱基对

  摘要：

  一种非天然疏水性碱吡咯-2-甲醛（表示为 Pa）被开发为 9-甲基咪唑并 [(4,5)-b] 吡啶 (Q) 的特定配对伙伴。已知 Q 碱基与 2,4-二氟甲苯 (F) 作为 AT 对的等排体配对，并且 F 在复制中也与 A 有效配对。相比之下，Q-Pa 对在复制中表现出特异性选择性，五元环碱基 Pa 与 Q 有效配对，但与 A 配对较差。 此外，与 DNA 聚合酶相比，Pa 与 DNA 聚合酶的相互作用更好F.Pa的醛基被大肠杆菌DNA聚合酶I的Klenow片段和禽成髓细胞瘤病毒的逆转录酶很好地识别。通过核磁共振分析了DNA双链体中Q-Pa对的结构特征，显示了Pa与Q拟合的形状互补性。

  DOI：

  10.1021/ja028806h
• 作为产物：
  描述：

  2-吡咯甲醛 在 氨 、 sodium hydride 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)-pyrrole-2-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  吡咯-2-甲醛和9-甲基咪唑并[(4,5)-b]吡啶之间形状互补的非天然疏水碱基对

  摘要：

  一种非天然疏水性碱吡咯-2-甲醛（表示为 Pa）被开发为 9-甲基咪唑并 [(4,5)-b] 吡啶 (Q) 的特定配对伙伴。已知 Q 碱基与 2,4-二氟甲苯 (F) 作为 AT 对的等排体配对，并且 F 在复制中也与 A 有效配对。相比之下，Q-Pa 对在复制中表现出特异性选择性，五元环碱基 Pa 与 Q 有效配对，但与 A 配对较差。 此外，与 DNA 聚合酶相比，Pa 与 DNA 聚合酶的相互作用更好F.Pa的醛基被大肠杆菌DNA聚合酶I的Klenow片段和禽成髓细胞瘤病毒的逆转录酶很好地识别。通过核磁共振分析了DNA双链体中Q-Pa对的结构特征，显示了Pa与Q拟合的形状互补性。

  DOI：

  10.1021/ja028806h

文献信息

• An Unnatural Hydrophobic Base Pair with Shape Complementarity between Pyrrole-2-carbaldehyde and 9-Methylimidazo[(4,5)-b]pyridine
  作者：Tsuneo Mitsui、Aya Kitamura、Michiko Kimoto、Taiko To、Akira Sato、Ichiro Hirao、Shigeyuki Yokoyama

  DOI：10.1021/ja028806h

  日期：2003.5.1

  with DNA polymerases was superior, in comparison to that of F. The aldehyde group of Pa was recognized well by the Klenow fragment of Escherichia coli DNA polymerase I and the reverse transcriptase of Avian myeloblastosis virus. The structural features of the Q-Pa pair in a DNA duplex were analyzed by NMR, showing the shape complementarity of the Pa fitting with Q. The structurally unique base Pa provides

  一种非天然疏水性碱吡咯-2-甲醛（表示为 Pa）被开发为 9-甲基咪唑并 [(4,5)-b] 吡啶 (Q) 的特定配对伙伴。已知 Q 碱基与 2,4-二氟甲苯 (F) 作为 AT 对的等排体配对，并且 F 在复制中也与 A 有效配对。相比之下，Q-Pa 对在复制中表现出特异性选择性，五元环碱基 Pa 与 Q 有效配对，但与 A 配对较差。 此外，与 DNA 聚合酶相比，Pa 与 DNA 聚合酶的相互作用更好F.Pa的醛基被大肠杆菌DNA聚合酶I的Klenow片段和禽成髓细胞瘤病毒的逆转录酶很好地识别。通过核磁共振分析了DNA双链体中Q-Pa对的结构特征，显示了Pa与Q拟合的形状互补性。