Synthesis and structure–activity relationships of USP48 deubiquitinylase inhibitors
作者:Kevin Böhm、Eric Schulze‐Niemand、Thilo Kähne、Elisa Siddiqui、Christian Täger、Daniel Ramsbeck、Mirko Buchholz、Michael Naumann
DOI:10.1002/ardp.202200661
日期:2023.7
yet been resolved and potent inhibitors are not known. We screened a set of 14 commercially available USP inhibitors for their activity against USP48 and identified the USP2 inhibitor “ML364” as a candidate for further optimization. Using a ligand-based approach, we derived and synthesized a series of ML364 analogs. The IC50 concentrations of the new compounds to inhibit USP48 were determined in a deubiquitinylase
泛素特异性蛋白酶代表一类酶,可催化泛素从特定底物蛋白上裂解,从而调节其活性。USP48 是一种很少被研究的 USP,最近发现它通过转录因子核因子 kappa B 的调节与炎症信号传导有关。尽管如此,USP48 的晶体结构尚未解析,有效的抑制剂也未知。我们筛选了一组 14 种市售 USP 抑制剂针对 USP48 的活性,并确定 USP2 抑制剂“ML364”作为进一步优化的候选药物。使用基于配体的方法,我们衍生并合成了一系列 ML364 类似物。IC 50通过使用四泛素罗丹明 110 作为底物测量荧光强度,在去泛素化酶活性测定中确定了抑制 USP48 的新化合物的浓度。含有羧酸官能团 ( 17e ) 的化合物可抑制 USP48 对四泛素罗丹明 110 的活性,IC 50为 12.6 µM。需要进一步基于结构的改进来提高抑制活性和特异性。