toluene-4-sulfonic acid 3-azido-5-azidomethylbenzyl ester | 1310822-74-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: toluene-4-sulfonic acid 3-azido-5-azidomethylbenzyl ester
• 英文别名: [3-Azido-5-(azidomethyl)phenyl]methyl 4-methylbenzenesulfonate
• CAS: 1310822-74-2
• 化学式: C₁₅H₁₄N₆O₃S
• 分子量: 358.381
• InChiKey: HNFMBVRVTUQDPZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  80.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-((4-hydroxyphenyl)amino)-8-oxooctanoic acid methyl ester 、 toluene-4-sulfonic acid 3-azido-5-azidomethylbenzyl ester 在 potassium carbonate 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 生成 7-[4-(3-azido-5-azidomethylbenzyloxy)phenylcarbamoyl]heptananoic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  不含锌螯合基团的新型组蛋白脱乙酰酶 8 配体：探索“倒置”结合姿势

  摘要：

  报道了一系列没有锌螯合异羟肟酸部分的新型 HDAC8 抑制剂。光亲和标记和分子建模研究表明，这些配体可能以“倒置”方式结合在靠近主要催化位点的次级结合位点。该系列中最有效的配体对 HDAC8的 IC 50为 28 μM，并发现可抑制 SH-SY5Y 细胞系中 H4 的脱乙酰化，但不抑制 α-微管蛋白的脱乙酰化。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2012.08.104
• 作为产物：
  描述：

  5-氨基间苯二甲酸二甲酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 lithium aluminium tetrahydride 、 sodium azide 、 亚硝酸特丁酯 、 叠氮基三甲基硅烷 、 氯代磷酸双(2,4-二氯苯基)酯 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 toluene-4-sulfonic acid 3-azido-5-azidomethylbenzyl ester
  参考文献：
  名称：

  新型二叠氮基异恶唑和吡唑基组蛋白脱乙酰酶探针的设计、合成、对接和生物学评价

  摘要：

  描述了新型强效 HDAC3 和 HDAC8 异恶唑和吡唑基二叠氮探针的设计、合成、对接和生物学评估，适用于结合细胞中的光亲和标记 (BEProFL) 实验进行合奏分析。基于异恶唑和吡唑的探针分别对 HDAC3 和 HDAC8 表现出低纳摩尔抑制活性。基于吡唑的探针3f似乎是文献中报道的最活跃的 HDAC8 抑制剂之一，IC 50为 17 nM。我们的对接研究表明，与基于异恶唑的配体不同，基于吡唑的配体足够灵活，可以占据 HDAC8 的第二个结合位点。探针/抑制剂2b、3a、3c和3f 通过抑制核 HDACs 在微摩尔浓度下发挥抗增殖和神经保护活性，表明它们是细胞渗透性的，叠氮化物或二叠氮化物基团的存在不会干扰神经保护特性，或增强细胞毒性，或影响细胞渗透性。

  DOI：

  10.1021/jm2001025

文献信息

• Identification of Binding Sites in the Nucleotide-Binding Domain of P-Glycoprotein for a Potent and Nontoxic Modulator, the Amine-Containing Monomeric Flavonoid <b>FM04</b>
  作者：Zhen Liu、Iris L. K. Wong、Jingcheng Sang、Fufeng Liu、Clare S. W. Yan、Jason W. Y. Kan、Tak Hang Chan、Larry M. C. Chow

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c02005

  日期：2023.5.11
• Novel histone deacetylase 8 ligands without a zinc chelating group: Exploring an ‘upside-down’ binding pose
  作者：Aditya Sudheer Vaidya、Raghupathi Neelarapu、Antonett Madriaga、He Bai、Emma Mendonca、Hazem Abdelkarim、Richard B. van Breemen、Sylvie Y. Blond、Pavel A. Petukhov

  DOI：10.1016/j.bmcl.2012.08.104

  日期：2012.11

  a zinc-chelating hydroxamic acid moiety is reported. Photoaffinity labeling and molecular modeling studies suggest that these ligands are likely to bind in an ‘upside-down’ fashion in a secondary binding site proximal to the main catalytic site. The most potent ligand in the series exhibits an IC50 of 28 μM for HDAC8 and is found to inhibit the deacetylation of H4 but not α-tubulin in SH-SY5Y cell

  报道了一系列没有锌螯合异羟肟酸部分的新型 HDAC8 抑制剂。光亲和标记和分子建模研究表明，这些配体可能以“倒置”方式结合在靠近主要催化位点的次级结合位点。该系列中最有效的配体对 HDAC8的 IC 50为 28 μM，并发现可抑制 SH-SY5Y 细胞系中 H4 的脱乙酰化，但不抑制 α-微管蛋白的脱乙酰化。
• Design, Synthesis, Docking, and Biological Evaluation of Novel Diazide-Containing Isoxazole- and Pyrazole-Based Histone Deacetylase Probes
  作者：Raghupathi Neelarapu、Denise L. Holzle、Subash Velaparthi、He Bai、Michael Brunsteiner、Sylvie Y. Blond、Pavel A. Petukhov

  DOI：10.1021/jm2001025

  日期：2011.7.14

  The design, synthesis, docking, and biological evaluation of novel potent HDAC3 and HDAC8 isoxazole- and pyrazole-based diazide probes suitable for binding ensemble profiling with photoaffinity labeling (BEProFL) experiments in cells is described. Both the isoxazole- and pyrazole-based probes exhibit low nanomolar inhibitory activity against HDAC3 and HDAC8, respectively. The pyrazole-based probe 3f

  描述了新型强效 HDAC3 和 HDAC8 异恶唑和吡唑基二叠氮探针的设计、合成、对接和生物学评估，适用于结合细胞中的光亲和标记 (BEProFL) 实验进行合奏分析。基于异恶唑和吡唑的探针分别对 HDAC3 和 HDAC8 表现出低纳摩尔抑制活性。基于吡唑的探针3f似乎是文献中报道的最活跃的 HDAC8 抑制剂之一，IC 50为 17 nM。我们的对接研究表明，与基于异恶唑的配体不同，基于吡唑的配体足够灵活，可以占据 HDAC8 的第二个结合位点。探针/抑制剂2b、3a、3c和3f 通过抑制核 HDACs 在微摩尔浓度下发挥抗增殖和神经保护活性，表明它们是细胞渗透性的，叠氮化物或二叠氮化物基团的存在不会干扰神经保护特性，或增强细胞毒性，或影响细胞渗透性。