N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1-methyl-4-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carboxamide | 155791-67-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1-methyl-4-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carboxamide
• 英文别名: N-<2-(dimethylamino)ethyl>-1-methyl-4-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamide；N-(N',N'-dimethylaminoethyl)-1-methyl-4-[1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido]pyrrole-2-carboxamide；N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1-methyl-4-(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carboxamido)pyrrole-2-carboxamide；N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitropyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carboxamide
• CAS: 155791-67-6
• 化学式: C₁₆H₂₂N₆O₄
• 分子量: 362.388
• InChiKey: CAKKTAGGGMGMCQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1-methyl-4-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carboxamide 在 5%-palladium/activated carbon 、 氢气 、 sodium carbonate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 生成 4-amino-N-[5-[2-(dimethylamino)ethylcarbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1-methylpyrrole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  吡咯-聚酰胺直接连接的二嗪等位基因的合成，可光化学裂解DNA †

  摘要：

  一种 双霉素设计并合成了包含等排的二嗪连接的吡咯的模型。合成的关键步骤涉及成功的重氮化反应。4-氨基吡咯 衍生给 重氮 盐，它们与 N-甲基吡咯得到直接连接的二嗪化合物。酰胺是等位的二嗪吡咯 在紫外线（365 nm）照射下，我证明了光诱导的DNA损伤。分光光度法和质谱法鉴定表明I中的偶氮键在辐照期间未解离。此外，化合物I在AT位点的HexB DNA片段以及其他一些混合序列产生了DNase I足迹。5′-ATGTCG-3'），表明二嗪键对双链DNA相互作用的额外作用。

  DOI：

  10.1039/c1ob06803b
• 作为产物：
  描述：

  1-甲基-4-硝基吡咯-2-羧酸 在 氯化亚砜 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 17.08h， 生成 N-[2-(dimethylamino)ethyl]-1-methyl-4-{[(1-methyl-4-nitro-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Lee; Roldan; Haskell, Journal of Medicinal Chemistry, 1994, vol. 37, # 8, p. 1208 - 1213

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Influence of a Terminal Formamido Group on the Sequence Recognition of DNA by Polyamides
  作者：Eilyn R. Lacy、N. Minh Le、Carly A. Price、Moses Lee、W. David Wilson

  DOI：10.1021/ja016154b

  日期：2002.3.1

  synthesized, and their interactions with predicted DNA recognition sequences in the two different stacking modes were evaluated. Experimental difficulties in monitoring DNA complex formation with polyamides were overcome by using surface plasmon resonance (SPR) detection of the binding to immobilized DNA hairpin duplexes. Both equilibrium and kinetic results from SPR show that a terminal formamido group

  含有吡咯 (Py)-咪唑 (Im) 的聚酰胺结合在 DNA 的小沟中，可以通过堆叠的反平行二聚体识别特定序列。已经提出有两种不同的低能量方式来形成堆叠的二聚体，并且它们对末端甲酰氨基的存在很敏感：（i）完全重叠的堆叠模式，其中二聚体的 N 端杂环堆叠在 C 端两个杂环之间的酰胺基团上和 (ii) 交错堆叠模式，其中 N 端杂环在 C 端方向上移动大约一个单位（结构 1997, 5, 1033-1046） . 两种不同的 DNA 序列将被以这两种不同模式堆叠的相同聚酰胺识别。尽管聚酰胺作为序列特异性 DNA 识别剂的重要性，尚未系统地探索这些堆叠的可能性。作为开发可识别 DNA 中错配碱基对的试剂的计划的一部分，合成了一组具有和不具有末端甲酰胺基团的四个聚酰胺三聚体，并评估了它们与两种不同堆叠模式下预测的 DNA 识别序列的相互作用。通过使用表面等离子体共振 (SPR) 检测与固定化 DNA
• Novel Minor Groove Binders Cure Animal African Trypanosomiasis in an in Vivo Mouse Model
  作者：Federica Giordani、Abedawn I. Khalaf、Kirsten Gillingwater、Jane C. Munday、Harry P. de Koning、Colin J. Suckling、Michael P. Barrett、Fraser J. Scott

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b01847

  日期：2019.3.28

  Animal African trypanosomiasis (AAT) is a significant socioeconomic burden for sub-Saharan Africa because of its huge impact on livestock health. Existing therapies including those based on minor groove binders (MGBs), such as the diamidines, which have been used for decades, have now lost efficacy in some places because of the emergence of resistant parasites. Consequently, the need for new chemotherapies

  动物非洲锥虫病 (AAT) 是撒哈拉以南非洲的重大社会经济负担，因为它对牲畜健康产生巨大影响。现有疗法，包括基于小沟结合剂 (MGB) 的疗法，例如已经使用了数十年的二脒，现在由于耐药寄生虫的出现而在某些地方失去了疗效。因此，迫切需要新的化学疗法。在这里，我们描述了结构不同的一类 MGB，Strathclyde MGB (S-MGB)，它们对 AAT 的主要致病生物表现出出色的体外活性：刚果锥虫和间日锥虫。我们还展示了许多这些化合物对 T. congolense 感染小鼠的治疗。特别是，我们通过两次腹腔注射 50 mg/kg 将 S-MGB-234（化合物 7）鉴定为治疗剂。至关重要的是，我们证明 S-MGB 不显示与当前二脒药物的交叉耐药性，并且不会通过二脒使用的转运蛋白内化。这项研究表明，S-MGBs 作为 AAT 的新型治疗剂具有巨大的潜力。
• Synthesis of a netropsin conjugate of a water-soluble epi -quinocarcin analogue: the importance of stereochemistry at nitrogen
  作者：Brad Herberich、Jack D. Scott、Robert M. Williams

  DOI：10.1016/s0968-0896(99)00314-4

  日期：2000.3

  The efficient synthesis of a water-soluble C11a-epi-analogue (6b) of quinocarcin is described. This substance, and a netropsin amide conjugate (8) lack the capacity to inflict oxidative damage on DNA due to the stereoelectronic geometry of their oxazolidine nitrogen atoms. The capacity of these substances to alkylate DNA through the generation of an iminium species has been examined. Both compounds were found to be unreactive as DNA alkylating agents. The results of this study are discussed in the context of previous proposals on the mode of action of this family of antitumor alkaloids. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Synthesis of directly linked diazine isosteres of pyrrole-polyamide that photochemically cleave DNA
  作者：Chi Wi Ong、Ya-Ting Yang、Meng-Chi Liu、Keith R. Fox、Ping Hao Liu、Hung-Wei Tung

  DOI：10.1039/c1ob06803b

  日期：——

  photo-induced DNA damage upon iradiation with UV light (365 nm). Spectrophotometric and mass spectrometric identification suggest that the azo-linkage in I did not dissociate during irradiation. Moreover, compound I produced DNase I footprints with the HexB DNA fragment at AT sites, as well as some other mixed sequences (5′-ATGTCG-3′), indicative of the additional role of the diazine-linkage for interaction at

  一种 双霉素设计并合成了包含等排的二嗪连接的吡咯的模型。合成的关键步骤涉及成功的重氮化反应。4-氨基吡咯 衍生给 重氮 盐，它们与 N-甲基吡咯得到直接连接的二嗪化合物。酰胺是等位的二嗪吡咯 在紫外线（365 nm）照射下，我证明了光诱导的DNA损伤。分光光度法和质谱法鉴定表明I中的偶氮键在辐照期间未解离。此外，化合物I在AT位点的HexB DNA片段以及其他一些混合序列产生了DNase I足迹。5′-ATGTCG-3'），表明二嗪键对双链DNA相互作用的额外作用。
• Lee; Roldan; Haskell, Journal of Medicinal Chemistry, 1994, vol. 37, # 8, p. 1208 - 1213
  作者：Lee、Roldan、Haskell、McAdam、Hartley

  DOI：——

  日期：——