(2S,3S)-3-((benzyloxy)methylamino)-2-(tert-bytoxyformamido)butyric acid | 286939-12-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S,3S)-3-((benzyloxy)methylamino)-2-(tert-bytoxyformamido)butyric acid
• 英文别名: (2S,3S)-2-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-3-[(N-benzyloxy-N-methyl)amino]butanoic acid；(2S,3S)-3-((benzyloxy)(methyl)amino)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)butanoic acid；(2S,3S)-3-[methyl(phenylmethoxy)amino]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoic acid
• CAS: 286939-12-6
• 化学式: C₁₇H₂₆N₂O₅
• 分子量: 338.404
• InChiKey: YEMMONSDSSYSIS-JSGCOSHPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3S)-3-((benzyloxy)methylamino)-2-(tert-bytoxyformamido)butyric acid 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 3-methylamino-2-aminobutyric acid trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  半合成帕西霉素二氢帕西霉素 D 的立体化学解析和全合成

  摘要：

  已显示太平洋霉素的 C(4') 环外烯烃的氢化作用产生一系列半合成化合物，即二氢太平洋霉素，其抗菌活性类似于天然产物。通过天然产物降解实验以及最低分子量二氢太平洋霉素 D 的全合成，已经完成了太平洋霉素中立体化学的阐明。 太平洋霉素 D 中包含的色氨酸和两个丙氨酸残基的立体化学身份已经确定显示为天然 (S) 构型，而该系列抗生素中所含的独特 3-甲基氨基-2-氨基丁酸已显示为 (2S,3S) 构型。最后，通过氢化 C(4')-C(5'

  DOI：

  10.1021/ja003292c
• 作为产物：
  描述：

  (3S,4S)-1-benzyloxy-3-N-tert-butyloxycarbonylamino-4-methyl-2-azetidinone 在 sodium cyanoborohydride 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 6.25h， 生成 (2S,3S)-3-((benzyloxy)methylamino)-2-(tert-bytoxyformamido)butyric acid
  参考文献：
  名称：

  作为有效的结核分枝杆菌转位酶 I 抑制剂的合成三三霉素类似物

  摘要：

  在这里，我们报告了结核分枝杆菌( Mtb ) 磷酸-MurNAc-五肽转位酶 I (MurX) 抑制剂的设计和合成，这是肽聚糖合成的第一个膜相关步骤，利用了尿苷肽天然产物三三霉素家族的特权结构。产生了许多对天然产物支架的假肽末端进行疏水酰胺修饰的类似物，它们在体外表现出对Mtb MurX 的纳摩尔抑制活性和对 Mtb 的有效活性. 我们表明，带有附加新戊酰胺部分的铅类似物具有快速的抗分枝杆菌作用，其特征类似于一线结核病药物异烟肼。该分子还能够抑制体内分枝杆菌存在的巨噬细胞中的Mtb生长，并减少体内斑马鱼结核病模型中的分枝杆菌负担。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.1c01407

文献信息

• Elucidating the Structural Requirement of Uridylpeptide Antibiotics for Antibacterial Activity
  作者：Yuma Terasawa、Chisato Sataka、Toyotaka Sato、Kazuki Yamamoto、Yukari Fukushima、Chie Nakajima、Yasuhiko Suzuki、Akira Katsuyama、Takanori Matsumaru、Fumika Yakushiji、Shin-ichi Yokota、Satoshi Ichikawa

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c00973

  日期：2020.9.10

  The synthesis and biological evaluation of analogues of uridylpeptide antibiotics were described, and the molecular interaction between the 3′-hydroxy analogue of mureidomycin A (3′-hydroxymureidomycin A) and its target enzyme, phospho-MurNAc-pentapeptide transferase (MraY), was analyzed in detail. The structure–activity relationship (SAR) involving MraY inhibition suggests that the side chain at the

  描述了尿苷肽抗生素类似物的合成和生物学评估，并证明了莫来霉素A（3'-羟基尿素霉素A）的3'-羟基类似物与其靶酶磷酸-MurNAc-五肽转移酶（MraY）之间的分子相互作用。详细分析。涉及MraY抑制的结构活性关系（SAR）表明，尿素-二肽部分的侧链不影响MraY抑制。但是，抗铜绿假单胞菌活性形成了鲜明的对比，而尿素-二肽基序是关键的贡献者。还建议核苷肽渗透酶NppA1A2BCD负责3'-羟基mureidomycin A进入细胞质的转运。进一步进行了3'-羟基mureidomycin A尿素-二肽部分的系统SAR分析，并确定了抗菌活性。该研究为基于尿苷肽抗生素的类似物的合理设计提供了指导。
• [EN] NOVEL COMPOUNDS AS ANTI-MYCOBACTERIALS<br/>[FR] NOUVEAUX COMPOSÉS EN TANT QU'AGENTS ANTI-MYCOBACTÉRIENS
  申请人：UNIV SYDNEY

  公开号：WO2018107236A1

  公开（公告）日：2018-06-21

  The present disclosure relates to antibacterial compounds. In particular, the compounds are for inhibiting the growth of bacteria, particularly Mycobacterium tuberculosis (Mtb), and/or targeting bacteria having phospho-MurNAc-pentapeptidetranslocase. The present disclosure also relates to compositions containing these compounds and methods of the use of these compounds and compositions.

  本公开涉及抗菌化合物。具体来说，这些化合物用于抑制细菌的生长，特别是结核分枝杆菌（Mtb），和/或针对具有磷酸-MurNAc-五肽转位酶的细菌。本公开还涉及含有这些化合物的组合物以及使用这些化合物和组合物的方法。
• Total Synthesis and Biological Evaluation of Pacidamycin D and Its 3′-Hydroxy Analogue
  作者：Kazuya Okamoto、Masahiro Sakagami、Fei Feng、Hiroko Togame、Hiroshi Takemoto、Satoshi Ichikawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/jo202159q

  日期：2012.2.3

  copper-catalyzed cross-coupling with the tetrapeptide carboxamide 5, a thermally unstable compound containing a number of potentially reactive functional groups. This synthetic route also allowed us to easily prepare 3′-hydroxy analogue 32. The assemblage by cross-coupling of the Z-oxyvinyl halide 6 and the carboxamide 5 at a late stage of the synthesis provided ready access to a range of uridylpeptide antibiotics

  描述了pacidamycin D（4）及其3'-羟基类似物32的总合成的全部细节。化学上不稳定的Z-氧酰基烯酰胺部分是在尿肽天然产物中发现的最具挑战性的化学结构。我们合成4的方法的关键要素包括有效且立体控制的Z-氧乙烯基卤化物6和7的构建以及它们在铜催化下与四肽羧酰胺5的交叉偶联，四肽羧酰胺5是一种热不稳定的化合物，含有许多潜在的反应性官能团组。这种合成途径还使我们能够轻松制备3'-羟基类似物32。Z-氧乙烯基卤化物6和羧酰胺5在合成的后期通过交叉偶联而组装在一起，尽管它们固有的不稳定性质和潜在的差向异构化作用，但只要改变它们，就可以轻易地获得一系列的尿肽肽抗生素及其类似物。四肽部分。
• Total Synthesis of Pacidamycin D by Cu(I)-Catalyzed Oxy Enamide Formation
  作者：Kazuya Okamoto、Masahiro Sakagami、Fei Feng、Hiroko Togame、Hiroshi Takemoto、Satoshi Ichikawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/ol202124b

  日期：2011.10.7

  The first total synthesis of pacidamycin D, which is expected to be a good candidate as an antibacterial agent against P. aeruginosa, is described. The key elements of our approach feature an efficient and stereocontrolled construction of the Z-oxyvinyl iodide and copper-catalyzed cross-coupling with the tetrapeptide carboxamide.
• US6482921B1
  申请人：——

  公开号：US6482921B1

  公开（公告）日：2002-11-19