benzyl (2S)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoate | 165266-70-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl (2S)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoate
• CAS: 165266-70-6
• 化学式: C₂₁H₂₆N₆O₄
• 分子量: 426.475
• InChiKey: LJYPNHVQWIISPZ-HNNXBMFYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.5
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (2S)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoate 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 (S)-N-tert-butoxycarbonyl-γ-(9-adeninyl)homoalanine
  参考文献：
  名称：

  以核碱基残基为构建基的N-Boc-α-氨基酸的合成，用于制备手性PNA（肽核酸）

  摘要：

  使用Barton-Crich方案将N-Boc-谷氨酸α-苄基酯转化为4-溴-2-（叔丁氧基羰基氨基）-丁酸苄基酯。该溴代衍生物经核碱基进行亲核取代，得到旋光的N-Boc-4-腺嘌呤丁胺（Boc-Aby），N-Boc-4-胸腺嘧啶（Boc-Tby），N-Boc-4-鸟嘌呤丁胺（Boc-Gby）或N-Boc-4-cytosinbutyrine（Boc-Cby），它们是合成手性肽核酸（PNA）的有用组成部分。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)00052-e
• 作为产物：
  描述：

  (S)-2-tert-Butoxycarbonylamino-pentanedioic acid 1-benzyl ester 5-(2-thioxo-2H-pyridin-1-yl) ester 在 三氯溴甲烷 、 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 benzyl (2S)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]butanoate
  参考文献：
  名称：

  丙氨酰肽核酸的侧链同源性：配对选择性和堆积。

  摘要：

  丙氨酰肽核酸（丙氨酰-PNA）是基于规则的肽主链和氨基酸的交替构型的寡聚体。所有侧链均被共价连接的核碱基修饰。基于互补链的氢键键合，堆积和溶剂化，丙氨酰-PNAs形成非常刚性，定义明确且线性的双链。通过比较亚甲基接头（丙氨酰基-PNA）与乙烯接头（同丙氨酰基-PNA），三亚甲基接头（降冰片基-PNA）和PNA序列（核碱基和主链之间的接头长度混合）来检查侧链同源性。侧链同源性与线性双链拓扑结构相结合，对于选择性地选择配对选择性（配对模式）和碱基对堆积非常有价值。

  DOI：

  10.1039/b411545g

文献信息

• Synthesis of N-Boc-α-amino acids with nucleobase residues as building blocks for the preparation of chiral PNA (peptidic nucleic acids)
  作者：Alessandro Lenzi、Gianna Reginato、Maurizio Taddai

  DOI：10.1016/0040-4039(95)00052-e

  日期：1995.3

  N-Boc-Glutamic acid α-benzyl ester was transformed into 4-bromo-2-(tert-butoxycarbonylamino)-butyric acid benzyl ester using the Barton-Crich protocol. This bromo derivative undergoes nucleophilic substitution with nucleobases to give optically active N-Boc-4-adeninbutyrine (Boc-Aby), N-Boc-4-thyminbutyrine (Boc-Tby), N-Boc-4-guaninbutyrine (Boc-Gby) or N-Boc-4-cytosinbutyrine (Boc-Cby), useful building

  使用Barton-Crich方案将N-Boc-谷氨酸α-苄基酯转化为4-溴-2-（叔丁氧基羰基氨基）-丁酸苄基酯。该溴代衍生物经核碱基进行亲核取代，得到旋光的N-Boc-4-腺嘌呤丁胺（Boc-Aby），N-Boc-4-胸腺嘧啶（Boc-Tby），N-Boc-4-鸟嘌呤丁胺（Boc-Gby）或N-Boc-4-cytosinbutyrine（Boc-Cby），它们是合成手性肽核酸（PNA）的有用组成部分。
• Side chain homologation of alanyl peptide nucleic acids: pairing selectivity and stacking
  作者：Ulf Diederichsen、Daniel Weicherding、Nicola Diezemann

  DOI：10.1039/b411545g

  日期：——

  Alanyl peptide nucleic acids (alanyl-PNAs) are oligomers based on a regular peptide backbone with alternating configuration of the amino acids. All side chains are modified by covalently linked nucleobases. Alanyl-PNAs form very rigid, well defined, and linear double strands based on hydrogen bonding of complementary strands, stacking, and solvation. Side chain homology was examined by comparing a

  丙氨酰肽核酸（丙氨酰-PNA）是基于规则的肽主链和氨基酸的交替构型的寡聚体。所有侧链均被共价连接的核碱基修饰。基于互补链的氢键键合，堆积和溶剂化，丙氨酰-PNAs形成非常刚性，定义明确且线性的双链。通过比较亚甲基接头（丙氨酰基-PNA）与乙烯接头（同丙氨酰基-PNA），三亚甲基接头（降冰片基-PNA）和PNA序列（核碱基和主链之间的接头长度混合）来检查侧链同源性。侧链同源性与线性双链拓扑结构相结合，对于选择性地选择配对选择性（配对模式）和碱基对堆积非常有价值。