1'-(6-trifluoroacetamidohexyl)-2'-deoxy-α,β-D-ribofuranose | 637330-11-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1'-(6-trifluoroacetamidohexyl)-2'-deoxy-α,β-D-ribofuranose
• 英文别名: 2,2,2-trifluoro-N-[6-[(4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxyhexyl]acetamide
• CAS: 637330-11-1
• 化学式: C₁₃H₂₂F₃NO₅
• 分子量: 329.317
• InChiKey: PAGLISNINOTKEG-MTULOOOASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.92
• 拓扑面积：
  88
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1'-(6-trifluoroacetamidohexyl)-2'-deoxy-α,β-D-ribofuranose 在 吡啶 、 sodium hydroxide 、 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 34.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-1'-β-(6-amido(2-(4-N,N'-dimethylaminophenylazo)phenyl)hexyl)-2'-deoxy-D-ribofuranose
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of fluorophore and quencher monomers for use in Scorpion primers and nucleic acid structural probes

  摘要：

  我们报告了合成单体的方法，以将荧光素和美克红融入修饰的寡核苷酸的序列和末端。这些单体已应用于固相合成荧光基寡核苷酸，用于基因分析和多链核酸结构的研究。

  DOI：

  10.1039/b301859h
• 作为产物：
  描述：

  1'-(6-trifluoroacetamidohexyl)-3',5'-ditoluoyl-2'-deoxy-α,β-D-ribofuranose 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以80%的产率得到1'-(6-trifluoroacetamidohexyl)-2'-deoxy-α,β-D-ribofuranose
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of fluorophore and quencher monomers for use in Scorpion primers and nucleic acid structural probes

  摘要：

  我们报告了合成单体的方法，以将荧光素和美克红融入修饰的寡核苷酸的序列和末端。这些单体已应用于固相合成荧光基寡核苷酸，用于基因分析和多链核酸结构的研究。

  DOI：

  10.1039/b301859h

文献信息

• Synthesis of fluorophore and quencher monomers for use in Scorpion primers and nucleic acid structural probes
  作者：Catherine M. McKeen、Lynda J. Brown、Jamie T. G. Nicol、John M. Mellor、Tom Brown

  DOI：10.1039/b301859h

  日期：——

  We report the syntheses of monomers to incorporate fluorescein and methyl red within the sequence and at the termini of modified oligonucleotides. These monomers have been used in the solid-phase synthesis of fluorogenic oligonucleotides for genetic analysis and the study of multi-stranded nucleic acid structures.

  我们报告了合成单体的方法，以将荧光素和美克红融入修饰的寡核苷酸的序列和末端。这些单体已应用于固相合成荧光基寡核苷酸，用于基因分析和多链核酸结构的研究。