8-azanebularine | 38874-46-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 8-azanebularine
• 英文别名: 8-azanebularine ribonucleoside；8-Azanebutarin；1-[1,2,3]triazolo[4,5-d]pyrimidin-3-yl-β-D-1-deoxy-ribofuranose；(2R,3S,4R,5R)-2-(hydroxymethyl)-5-(triazolo[4,5-d]pyrimidin-3-yl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 38874-46-3
• 化学式: C₉H₁₁N₅O₄
• 分子量: 253.217
• InChiKey: XOUCEKYAMMLQRC-JXOAFFINSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.9
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-azanebularine 在 吡啶 、 TEA 、 silver nitrate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-8-azanebularine
  参考文献：
  名称：

  RNA 编辑反应的过渡态类似物

  摘要：

  由 ADAR 酶催化的 RNA 中 C6 腺苷的脱氨基作用在相应位置产生肌苷。由于肌苷在翻译过程中被解码为鸟苷，因此这种修饰会导致信使 RNA 中的密码子发生变化。8-氮杂碳氢化合物通过 C6-N1 双键的水合产生了对 ADAR 催化的水解脱氨基反应提出的过渡态的极好模拟。在这里，我们报告了 8-氮芥亚磷酰胺的合成及其在制备 RNA 中的用途，该 RNA 模仿在谷氨酸受体 B 亚基 pre-mRNA 中的已知编辑位点发现的二级结构。含有类似物的 RNA 的结合特性表明 ADAR 的紧密结合配体可以通过掺入 8-azanebularine 产生。观察到的高亲和力结合取决于功能活性位点、ADAR2 的两个双链 RNA 结合基序 (dsRBMs) 中一个而不是另一个的存在，以及核苷类似物在序列中的正确位置/已知编辑站点的结构上下文。这些结果促进了我们对 ADAR 催化的 RNA 编辑过程中底物识别的理解，并且对于

  DOI：

  10.1021/ja0472073
• 作为产物：
  描述：

  3-beta-D-呋喃核糖基-3H-1,2,3-三唑并[4,5-d]嘧啶-7-胺 在 吡啶 、 亚硝酸正戊酯 、 氨 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 为溶剂， 反应 126.0h， 生成 8-azanebularine
  参考文献：
  名称：

  Reductive Deamination of Aminopurine Nucleosides

  摘要：

  DOI：

  10.1055/s-1984-30851

文献信息

• Substrate Analogues for an RNA-Editing Adenosine Deaminase:  Mechanistic Investigation and Inhibitor Design
  作者：Eduardo A. Véliz、LaHoma M. Easterwood、Peter A. Beal

  DOI：10.1021/ja029742d

  日期：2003.9.1

  ADARs are adenosine deaminases that act on RNA and are responsible for RNA-editing reactions that occur in eukaryotic mRNAs, including the mRNAs of glutamate and serotonin receptors. ADARs capable of editing biologically relevant RNA substrates have been identified. In addition, the consequence of the RNA-editing reaction on the function of the gene product is known in several cases. However, our understanding

  ADAR 是作用于 RNA 的腺苷脱氨酶，负责发生在真核 mRNA 中的 RNA 编辑反应，包括谷氨酸和血清素受体的 mRNA。已经确定了能够编辑生物相关 RNA 底物的 ADAR。此外，在几种情况下，RNA 编辑反应对基因产物功能的影响是已知的。然而，我们对 ADAR 催化的 RNA 腺苷脱氨基的化学机制的理解滞后。通过研究 ADAR2 天然存在的底物的类似物，我们推断出该酶的活性位点和反应机制的特征。各种 RNA 底物中腺苷处的 8-Aza 取代加速了 ADAR2 在这些位点的脱氨基速率（2.8-17 倍）。这种“氮杂效应”的程度 取决于反应核苷酸的 RNA 结构背景。RNA 中的 N(6)-甲基腺苷是 ADAR2 的缓慢底物（比率是腺苷的 2%），没有观察到 N(6)-乙基腺苷的产物，表明离去基团的大小有限。RNA 中的 2,6-二氨基嘌呤核糖核苷不是 ADAR 的底物，与催化核苷类似反应的腺苷脱氨酶
• Reductive Deamination of Aminopurine Nucleosides
  作者：Vasu Nair、Stanley D. Chamberlain

  DOI：10.1055/s-1984-30851

  日期：——
• A Transition State Analogue for an RNA-Editing Reaction
  作者：Brittany L. Haudenschild、Olena Maydanovych、Eduardo A. Véliz、Mark R. Macbeth、Brenda L. Bass、Peter A. Beal

  DOI：10.1021/ja0472073

  日期：2004.9.1

  adenosine in RNA catalyzed by the ADAR enzymes generates inosine at the corresponding position. Because inosine is decoded as guanosine during translation, this modification can lead to codon changes in messenger RNA. Hydration of 8-azanebularine across the C6-N1 double bond generates an excellent mimic of the transition state proposed for the hydrolytic deamination reaction catalyzed by ADARs. Here

  由 ADAR 酶催化的 RNA 中 C6 腺苷的脱氨基作用在相应位置产生肌苷。由于肌苷在翻译过程中被解码为鸟苷，因此这种修饰会导致信使 RNA 中的密码子发生变化。8-氮杂碳氢化合物通过 C6-N1 双键的水合产生了对 ADAR 催化的水解脱氨基反应提出的过渡态的极好模拟。在这里，我们报告了 8-氮芥亚磷酰胺的合成及其在制备 RNA 中的用途，该 RNA 模仿在谷氨酸受体 B 亚基 pre-mRNA 中的已知编辑位点发现的二级结构。含有类似物的 RNA 的结合特性表明 ADAR 的紧密结合配体可以通过掺入 8-azanebularine 产生。观察到的高亲和力结合取决于功能活性位点、ADAR2 的两个双链 RNA 结合基序 (dsRBMs) 中一个而不是另一个的存在，以及核苷类似物在序列中的正确位置/已知编辑站点的结构上下文。这些结果促进了我们对 ADAR 催化的 RNA 编辑过程中底物识别的理解，并且对于