Automated parallel synthesis of 5′-triphosphate oligonucleotides and preparation of chemically modified 5′-triphosphate small interfering RNA
作者:Ivan Zlatev、Jeremy G. Lackey、Ligang Zhang、Amy Dell、Kathy McRae、Sarfraz Shaikh、Richard G. Duncan、Kallanthottathil G. Rajeev、Muthiah Manoharan
DOI:10.1016/j.bmc.2012.11.043
日期:2013.2
5′-triphosphates and 5′-diphosphates. The method was readily translated into a scalable and high-throughput synthesis protocol compatible with the current DNA/RNA synthesizers yielding a large variety of unique 5′-polyphosphorylated oligonucleotides. Using this approach, we accomplished the synthesis of chemically modified 5′-triphosphate oligonucleotides that were annealed to form small-interfering RNAs
描述了用于5'-三磷酸和5'-二磷酸寡核苷酸的平行和高通量固相合成的全自动化学方法。首先使用标准的自动化DNA / RNA固相合成程序构建所需的全长寡核苷酸。然后,在相同的色谱柱和仪器上,不间断的连续循环的有效实施提供了相应的未修饰或化学修饰的5'-三磷酸酯和5'-二磷酸酯。该方法可轻松转换为可扩展的高通量合成方案,与目前的DNA / RNA合成仪兼容,可产生多种独特的5'-多磷酸化寡核苷酸。使用这种方法,我们完成了化学修饰的5'-三磷酸寡核苷酸的合成,将其退火以形成小干扰RNA(ppp-siRNA),这是一类可能令人感兴趣的新型RNAi治疗工具。5'-三磷酸基团附着到siRNA构建体的过客链上,不会引起体外RNAi介导的基因沉默活性的显着改善,也不会引起强烈的特异性体外RIG-I激活。报道的方法将能够筛选许多经过化学修饰的ppp-siRNA,从而产生新型的双功能RNAi治疗平台。5'-三