N2-formamidino-8N-(2-aminofluorenyl)-2'-deoxyguanosine | 1125587-22-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N2-formamidino-8N-(2-aminofluorenyl)-2'-deoxyguanosine
• CAS: 1125587-22-5
• 化学式: C₂₆H₂₇N₇O₄
• 分子量: 501.545
• InChiKey: RYFCJJJVJSHJMT-PWRODBHTSA-N

物化性质

• 熔点：
  209 °C
• 沸点：
  807.7±75.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.56±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  37.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  140.89
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N2-formamidino-8N-(2-aminofluorenyl)-2'-deoxyguanosine 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 以 吡啶 为溶剂， 反应 3.5h， 以78%的产率得到N2-formamidino-8N-(2-aminofluorenyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  c8-芳基胺嘌呤加合物对DNA链位点特异性损伤的合成及其对各种DNA聚合酶的影响。

  摘要：

  使用钯交叉偶联化学已经制备了C8-芳胺-dG和C8-芳基胺-dA加合物。随后将这些加合物转化为相应的5'-O-DMTr-C8-芳基胺-3'-O-亚磷酰胺，然后用于自动合成不同的位点特异性修饰的寡核苷酸。这些“损坏”的寡核苷酸已通过ESI-MS，UV热稳定性测定和圆二色性进行了表征，它们已用于EcoRI测定以及使用各种DNA聚合酶的引物延伸研究中。

  DOI：

  10.1002/chem.200800979
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧-8-(9H-芴-2-基氨基)-鸟苷 、 N,N-二甲基甲酰胺二乙基缩醛 以 吡啶 为溶剂， 反应 16.0h， 以237 mg的产率得到N2-formamidino-8N-(2-aminofluorenyl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  c8-芳基胺嘌呤加合物对DNA链位点特异性损伤的合成及其对各种DNA聚合酶的影响。

  摘要：

  使用钯交叉偶联化学已经制备了C8-芳胺-dG和C8-芳基胺-dA加合物。随后将这些加合物转化为相应的5'-O-DMTr-C8-芳基胺-3'-O-亚磷酰胺，然后用于自动合成不同的位点特异性修饰的寡核苷酸。这些“损坏”的寡核苷酸已通过ESI-MS，UV热稳定性测定和圆二色性进行了表征，它们已用于EcoRI测定以及使用各种DNA聚合酶的引物延伸研究中。

  DOI：

  10.1002/chem.200800979