Fmoc-D-OHAsm | 1346982-08-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Fmoc-D-OHAsm
• 英文别名: (2R,3R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-hydroxy-4-(methylamino)-4-oxobutanoic acid
• CAS: 1346982-08-8
• 化学式: C₂₀H₂₀N₂O₆
• 分子量: 384.389
• InChiKey: XRCHYTRQMPNRHJ-IAGOWNOFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-D-OHAsm 在 2,6-二甲基吡啶 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 碳酸氢钠 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 41.0h， 生成 Fmoc-D-βOTBSAsm-OH
  参考文献：
  名称：

  形成通道的 48-mer 肽聚乙酰胺 B 的固相全合成和双重作用机制

  摘要：

  Polytheonamide B (1) 由于其极其复杂的结构、体外通道形成能力和极强的细胞毒性，是一种独特的肽天然产物。1 的 48 聚体序列包含交替的 d,l-氨基酸，并拥有一系列空间庞大的 β-四取代和氢键形成残基。据信，这些不寻常的结构特征驱动 1 折叠成 4.5 nm 长的管，在质膜上形成跨膜离子通道，并发挥细胞毒性。然而，尽管其潜在的生物学应用，这些不寻常的残基的多次取代显着增加了合成挑战，阻碍了 1 的固相肽合成 (SPPS)。在这项研究中，我们首先通过广泛优化各种因素来解决合成问题。 SPPS。新的保护组策略的适应允许树脂上的 37 聚体肽延长，N 端 11 聚体片段缩合到树脂上。去除 18 个保护基团和树脂以优异的总产率产生了 1 个（4.5%，从 17 个步骤开始 76 个步骤）。SPPS 协议在操作上很简单，并且被证明很容易适应荧光 48 聚体探针 2 的全合成。合成

  DOI：

  10.1021/jacs.8b06755
• 作为产物：
  描述：

  (3R)-3-hydroxy-N-methyl-D-asparagine 、 氯甲酸-9-芴基甲酯 在 碳酸氢钠 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 生成 Fmoc-D-OHAsm
  参考文献：
  名称：

  Total synthesis of the large non-ribosomal peptide polytheonamide B

  摘要：

  聚糖酰胺 B 是目前已知的最大的非核糖体肽，具有非凡的细胞毒性（EC50 = 68 pg mlâ1, 小鼠白血病 P388 细胞）。它的 48 个氨基酸残基包括多种非蛋白原性 d 和 l 氨基酸，这些氨基酸的绝对立体化学结构依次交替。这些结构特征促使形成稳定的δ-strand 型结构，从而形成长度超过 30 Ã 的整体管状结构。在生物环境中，这种折叠结构被认为可以通过一个孔隙在脂质双分子层中运输阳离子，从而起到离子通道的作用。在此，我们首次报告了聚神酰胺 B 的化学结构。我们的合成依赖于四个关键阶段的结合：非蛋白源氨基酸的合成、聚草酰胺 B 四个片段的固相组装、银介导的片段连接以及最后的全局脱保护。现在可用的合成材料将有助于研究其构象特性、通道功能和细胞毒性之间的关系。聚神酰胺 B 是一种大型非核糖体多肽，具有极高的生物活性。本文描述的合成包括首次制备几种非蛋白源氨基酸和大型非天然肽的一般偶联策略。该合成是了解和利用该化合物及类似化合物生物活性的关键一步。

  DOI：

  10.1038/nchem.554

文献信息

• Functional Analysis of Synthetic Substructures of Polytheonamide B: A Transmembrane Channel-Forming Peptide
  作者：Shigeru Matsuoka、Naoki Shinohara、Tomoaki Takahashi、Maiko Iida、Masayuki Inoue

  DOI：10.1002/anie.201101533

  日期：2011.5.16

  Longer is better: Polytheonamide B, the largest nonribosomal linear peptide identified to date, is a transmembrane channel‐forming peptide. Nine of its substructures have now been chemically synthesized. The membrane‐disrupting and ion‐channel‐forming sequences as well as the cytotoxicity‐enhancing sequence have been identified.

  越长越好： Polytheonamide B是迄今为止鉴定出的最大的非核糖体线性肽，是一种跨膜通道形成肽。现在已经化学合成了其9个亚结构。已经确定了破坏膜和形成离子通道的序列以及增强细胞毒性的序列。