H-(β-SH)DSPGYS-NH₂ | 1460214-03-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: H-(β-SH)DSPGYS-NH₂
• 英文别名: H-cis-D(β-SH)SPGYS-NH2；(2R,3R)-3-amino-4-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[2-[[(2S)-1-[[(2S)-1-amino-3-hydroxy-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-3-hydroxy-1-oxopropan-2-yl]amino]-4-oxo-2-sulfanylbutanoic acid
• CAS: 1460214-03-2
• 化学式: C₂₆H₃₇N₇O₁₁S
• 分子量: 655.686
• InChiKey: HQZCJYKUMDDCJS-BUJXUYPKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.3
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  305
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Ac-LYRANM-SCH2CH2COOEt 、 H-(β-SH)DSPGYS-NH₂ 在 苯硫酚 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 以71%的产率得到Ac-LYRANMD(β-SH)SPGYS-NH₂
  参考文献：
  名称：

  化学选择性肽连接-天冬氨酸的脱硫

  摘要：

  特别有用：合成的β-巯基天冬氨酸残基有助于快速连接各种肽硫酯。连接反应（无需纯化）后，在未保护的半胱氨酸残基存在下，β-巯基部分的化学选择性脱硫提供了天然肽产物。

  DOI：

  10.1002/anie.201304793
• 作为产物：
  描述：

  FMOC-O-叔丁基-L-丝氨酸 、 Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-O-叔丁基-L-酪氨酸 、 Fmoc-L-脯氨酸 、 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 4-甲基哌啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以48 %的产率得到H-(β-SH)DSPGYS-NH₂
  参考文献：
  名称：

  硫代天冬氨酸在天然化学连接中的意外立体化学效应

  摘要：

  这项研究提出了一个意外的发现，即-硫代-Asp 的异构体比该异构体表现出更高的连接活性。这一发现揭示了天然化学连接的复杂性质，并强调了侧链空间效应之外的因素在调节连接活性中的重要性。

  DOI：

  10.1016/j.cclet.2023.109434

文献信息

• Internal Activation of Peptidyl Prolyl Thioesters in Native Chemical Ligation
  作者：Yue Gui、Lingqi Qiu、Yaohao Li、Hongxing Li、Suwei Dong

  DOI：10.1021/jacs.6b01202

  日期：2016.4.13

  suggest that the ligation of two peptide segments proceeds through an NCL-like pathway instead of a direct aminolysis, which ensures the chemoselectivity and compatibility of various amino acid side chains. This 4-mercaptoprolyl thioester-based protocol also allows an efficient one-pot ligation-desulfurization procedure. The utility of this method has been further demonstrated in the synthesis of a proline-rich

  与丙氨酰硫酯相比，脯氨酰硫酯在天然化学连接 (NCL) 中显示出显着较低的反应性。本报告描述了 NCL 中肽基脯氨酰硫酯的温和有效的内部活化方案，不使用任何基于硫醇的添加剂，其中在 C 端脯氨酸上引入 4-硫醇取代基显着提高了脯氨酰硫酯的反应性，通过形成双环硫内酯中间体。动力学数据表明反应速率与丙氨酰硫酯的报道数据相当，机理研究表明两个肽段的连接是通过 NCL 样途径而不是直接氨解进行的，这确保了化学选择性和各种氨基酸侧链的相容性。这种基于 4-巯基硫酯的协议还允许高效的一锅连接脱硫程序。该方法的效用已在 Wilms 肿瘤蛋白 1 的富含脯氨酸区域的合成中得到进一步证明。
• Peptide Ligation
  申请人：THE UNIVERSITY OF SYDNEY

  公开号：US20160122383A1

  公开（公告）日：2016-05-05

  The invention relates to a process for introducing a thiol group a to a carbonyl group in a side chain of a protected a-amino acid, said protected a-amino acid having protecting groups on both the α-amine group and the a-carboxyl group. The process comprises a) if the side chain contains a functional group comprising a heteroatom bearing a hydrogen atom, protecting said functional group; b) treating the protected amino acid with a base of sufficient strength to abstract a hydrogen atom a to the carbonyl group, so as to form an anion; c) treating the anion with a reagent of structure Pr-S-L in which L is a leaving group and Pr is a thiol-protecting group, so as to introduce a Pr-S- group a to the carbonyl group; and d) converting the Pr-S- group to an H-S-(thiol) group. This process may be used to prepare ligated peptides.

  该发明涉及一种将巯基引入受保护的α-氨基酸侧链中的羰基的过程，所述受保护的α-氨基酸在α-氨基团和α-羧基团上均具有保护基。该过程包括a) 如果侧链含有包含带有氢原子的杂原子的官能团，则保护该官能团；b) 用足够强度的碱处理受保护的氨基酸，以提取到羰基的氢原子，从而形成负离子；c) 用具有结构Pr-S-L的试剂处理该负离子，其中L是一个离去基团，Pr是一个巯基保护基，以引入Pr-S-基团到羰基；d) 将Pr-S-基团转化为H-S-(巯基)基团。该过程可用于制备连接的肽。