21-chloro-3,6,9,12,15-pentaoxahenicosan-1-amine | 1261238-22-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 21-chloro-3,6,9,12,15-pentaoxahenicosan-1-amine
• 英文别名: NH2-PEG5-C6-Cl；2-[2-[2-[2-[2-(6-chlorohexoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanamine
• CAS: 1261238-22-5
• 化学式: C₁₆H₃₄ClNO₅
• 分子量: 355.903
• InChiKey: PPGFKRLCLUQKRT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  72.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  21-chloro-3,6,9,12,15-pentaoxahenicosan-1-amine 在 盐酸 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 2-amino-8-(23-chloro-5,8,11,14,17-pentaoxa-2-azatricos-1-yl)-9-(4-fluorobenzyl)-1,9-dihydro-6H-purin-6-one
  参考文献：
  名称：

  用于靶向自噬降解的第二代 AUTAC

  摘要：

  通过泛素-蛋白酶体系统进行的靶向蛋白质降解已成为最有前途的药物发现方式之一。自噬是另一种细胞内降解系统，可以靶向多种非蛋白质底物以及蛋白质，但其在靶向降解中的应用仍处于起步阶段。我们之前的工作揭示了细胞内蛋白质上半胱氨酸残基的鸟嘌呤修饰与选择性自噬之间的关系，从而产生了第一个基于自噬的降解剂，即自噬靶向嵌合体（AUTAC）。基于研究背景，所有报道的AUTACs化合物都含有半胱氨酸作为子结构。在这里，我们通过进行 SAR 研究来检查该子结构的重要性，并报告通过用其他部分替换半胱氨酸来显着改善降解剂的活性。几种衍生物表现出亚μM范围的降解活性，证明了AUTAC增加的实用价值。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c00861

文献信息

• Efficient protein knockdown of HaloTag-fused proteins using hybrid molecules consisting of IAP antagonist and HaloTag ligand
  作者：Shusuke Tomoshige、Yuichi Hashimoto、Minoru Ishikawa

  DOI：10.1016/j.bmc.2016.05.035

  日期：2016.7

  of alkyl chloride, which binds covalently to HaloTag, linked to BE04 (2), a bestatin (3) derivative with an affinity for cellular inhibitor of apoptosis protein 1 (cIAP1, a kind of ubiquitin ligase). This system addressed several limitations of prior protein knockdown technology, and was applied to degrade two HaloTag-fused proteins. However, the degradation activity of these hybrid small molecules

  我们先前曾报道过HaloTag融合蛋白的蛋白敲低系统，该蛋白使用由烷基氯组成的杂化小分子，该分子与HaloTag共价结合，并与BE04（2），与细胞凋亡蛋白1的细胞抑制剂具有亲和力的Bestatin（3）衍生物连接。 （cIAP1，一种泛素连接酶）。该系统解决了现有蛋白敲低技术的几个局限性，并被用于降解两种HaloTag融合蛋白。但是，这些杂化小分子的降解活性不强。因此，我们着手改进此系统。我们在这里报告了由IAP拮抗剂MV1连接的烷基氯化物组成的新型杂化化合物4a和4b的设计，合成和生物学评估（5）。证实化合物4a和4b可以比BE04更有效地降低活细胞中HaloTag融合的肿瘤坏死因子α（HaloTag-TNFα），HaloTag融合的细胞分裂控制蛋白42（HaloTag-Cdc42）和未融合的HaloTag蛋白的水平。 -连接的化合物1b。作用方式的分析表明，HaloTag-TNFα的
• Degradation of HaloTag-fused nuclear proteins using bestatin-HaloTag ligand hybrid molecules
  作者：Shusuke Tomoshige、Mikihiko Naito、Yuichi Hashimoto、Minoru Ishikawa

  DOI：10.1039/c5ob01395j

  日期：——

  We successfully knocked down HaloTag-fused nuclear proteins in living cells by using protein knockdown technology.

  我们使用蛋白质敲除技术成功地在活细胞中敲除了与HaloTag融合的核蛋白。
• Targeted Protein O-GlcNAcylation Using Bifunctional Small Molecules
  作者：Bowen Ma、Khadija Shahed Khan、Tongyang Xu、Josefina Xeque Amada、Zhihao Guo、Yunpeng Huang、Yu Yan、Henry Lam、Alfred Sze-Lok Cheng、Billy Wai-Lung Ng

  DOI：10.1021/jacs.3c14380

  日期：2024.4.10

  for protein- and site-specific O-GlcNAc modification, rendering the precise study of the O-GlcNAcylation challenging. To address this, we have developed heterobifunctional small molecules, named O-GlcNAcylation TArgeting Chimeras (OGTACs), which enable protein-specific O-GlcNAcylation in living cells. OGTACs promote O-GlcNAcylation of proteins such as BRD4, CK2α, and EZH2 in cellulo by recruiting FKBP12F36V-fused

  蛋白质 O-连接 β- N-乙酰氨基葡萄糖修饰 (O-GlcNAcylation) 在调节重要的细胞过程中发挥着至关重要的作用。 O-GlcNAcylation 稳态的破坏与多种人类疾病有关，包括癌症、糖尿病和神经退行性疾病。然而，用于蛋白质和位点特异性 O-GlcNAc 修饰的化学工具有限，这使得 O-GlcNAc 酰化的精确研究具有挑战性。为了解决这个问题，我们开发了异双功能小分子，称为 O-GlcNAcylation TArgeting Chimeras (OGTAC)，它能够在活细胞中实现蛋白质特异性 O-GlcNAcylation。 OGTAC 通过招募 FKBP12 F36V融合 O-GlcNAc 转移酶 (OGT) 来促进纤维素中BRD4、CK2α 和 EZH2 等蛋白质的 O-GlcNAc 酰化，并具有时间、幅度和可逆控制。总体而言，OGTAC 代表了一种诱导蛋白质特异性 O-GlcNAc
• HETEROCYCLIC COMPOUND
  申请人：TOHOKU UNIVERSITY

  公开号：US20200163970A1

  公开（公告）日：2020-05-28

  Provided is a novel compound or salt thereof that induces degradation by autophagy of an intracellular molecule. In this compound, a ligand having activity to bind to an intracellular molecule and a structure having activity to induce autophagy of an intracellular molecule are linked via a linker without loss of the activity of the ligand and the structure.
• Heterocyclic compound
  申请人：TOHOKU UNIVERSITY

  公开号：US11986480B2

  公开（公告）日：2024-05-21

  Provided is a novel compound or salt thereof that induces degradation by autophagy of an intracellular molecule. In this compound, a ligand having activity to bind to an intracellular molecule and a structure having activity to induce autophagy of an intracellular molecule are linked via a linker without loss of the activity of the ligand and the structure.