(S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(5-((N-(tert-butoxycarbonyl)carbamimidoyl)carbamoyl)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanoic acid | 1361215-05-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(5-((N-(tert-butoxycarbonyl)carbamimidoyl)carbamoyl)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanoic acid
• CAS: 1361215-05-5
• 化学式: C₂₀H₃₀N₆O₈
• 分子量: 482.494
• InChiKey: UXKGHROWKYOFKP-LBPRGKRZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.91
• 重原子数：
  34.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  211.8
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(5-((N-(tert-butoxycarbonyl)carbamimidoyl)carbamoyl)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanoic acid 在 N-甲基吗啉 、 O-(6-chlorobenzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 42.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  多阳离子双（胍基碘羰基吡咯）受体与双链核酸的相互作用：合成，绑定研究和原子力显微镜成像。

  摘要：

  化合物1 - 3中，两个guanidiniocarbonylpyrrole部分由低聚酰胺桥连接并且在数量上和碱性基团的类型不同的组成，制备。该网站和质子化程度1 - 3对pH值的强烈依赖。这些化合物与几种双链（ds）DNA和dsRNA的相互作用通过UV / Vis和CD光谱以及等温滴定微量热（ITC）进行了研究。这些研究表明，结合1 – 3多核苷酸对多核苷酸的结合由三个因素驱动，脂肪族氨基的存在，化合物的质子化状态以及多核苷酸结合位点的空间性质，即它们的凹槽的形状和结构。所有施加的方法得到的结果一致表明，受体1 - 3结合DNA的小沟，但是，相比之下，对RNA的大沟。此外，通过原子力显微镜（AFM）成像表明，化合物2与小牛胸腺（ct）DNA相互作用后，发生了DNA诱导的聚集，导致其二级结构发生了明显变化。

  DOI：

  10.1002/chem.201101544
• 作为产物：
  描述：

  GCP-L-Dap(Cbz)-OMe 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 (S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-(5-((N-(tert-butoxycarbonyl)carbamimidoyl)carbamoyl)-1H-pyrrole-2-carboxamido)propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  多阳离子双（胍基碘羰基吡咯）受体与双链核酸的相互作用：合成，绑定研究和原子力显微镜成像。

  摘要：

  化合物1 - 3中，两个guanidiniocarbonylpyrrole部分由低聚酰胺桥连接并且在数量上和碱性基团的类型不同的组成，制备。该网站和质子化程度1 - 3对pH值的强烈依赖。这些化合物与几种双链（ds）DNA和dsRNA的相互作用通过UV / Vis和CD光谱以及等温滴定微量热（ITC）进行了研究。这些研究表明，结合1 – 3多核苷酸对多核苷酸的结合由三个因素驱动，脂肪族氨基的存在，化合物的质子化状态以及多核苷酸结合位点的空间性质，即它们的凹槽的形状和结构。所有施加的方法得到的结果一致表明，受体1 - 3结合DNA的小沟，但是，相比之下，对RNA的大沟。此外，通过原子力显微镜（AFM）成像表明，化合物2与小牛胸腺（ct）DNA相互作用后，发生了DNA诱导的聚集，导致其二级结构发生了明显变化。

  DOI：

  10.1002/chem.201101544