N-[3-[2-[2-(3-氨基丙氧基)乙氧基]乙氧基]丙基]-2,2,2-三氟- | 452309-60-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: N-[3-[2-[2-(3-氨基丙氧基)乙氧基]乙氧基]丙基]-2,2,2-三氟-
• 英文名称: N-trifluoroacetyl-4,7,10-trioxa-1,13-tridecanediamine
• 英文别名: N-[3-[2-[2-(3-aminopropoxy)ethoxy]ethoxy]propyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 452309-60-3
• 化学式: C₁₂H₂₃F₃N₂O₄
• 分子量: 316.321
• InChiKey: LFOMFFILGHKCPZ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  417.4±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.164±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.92
• 拓扑面积：
  82.8
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[3-[2-[2-(3-氨基丙氧基)乙氧基]乙氧基]丙基]-2,2,2-三氟- 在 三(2-羰基乙基)磷盐酸盐 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 2,2’-azobis[2-(2-imidazolin-2-yl)propane] dihydrochloride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 14.33h， 生成 9-aza-8,24-dioxo-4-thia-25,25,25-trifluoro-13,16,19-trioxapentacosyl α-D-sulfoquinovoside
  参考文献：
  名称：

  磺基奎诺糖修饰琼脂糖上磺基奎诺糖结合蛋白的捕获和释放

  摘要：

  周质结合蛋白依赖性 ATP 结合盒 (ABC) 型转运蛋白的溶质结合蛋白 (SBP) 成分通常对其同源配体具有精细的选择性。麦芽糖结合蛋白 (MBP) 是这些 SBP 中研究最深入的，已被广泛用作融合伴侣，以实现重组蛋白的亲和纯化。然而，其他 SBP 和基于 SBP 配体的亲和系统仍未得到充分探索。磺基奎诺糖结合蛋白 SmoF 是根癌农杆菌中 ABC 转运蛋白盒的底物结合蛋白成分，参与导入磺基奎诺糖 (SQ) 及其衍生物以进行 SQ 分解代谢。在这里，我们证明 SmoF 以高亲和力与 SQ 的辛基糖苷 (octyl-SQ) 结合，表现出对异头取代基延伸的显着耐受性。 SmoF·辛基-SQ复合物的3D X射线结构揭示了辛基链的调节，辛基链投射到蛋白质表面，为以硫醇-烯反应为关键合成带有连接子的SQ-胺提供动力步骤，及其与溴化氰修饰的琼脂糖的缀合。我们展示了使用 SQ 作为竞争性洗脱液从 SQ-琼脂糖树脂中成功捕获和释放

  DOI：

  10.1039/d4ob00307a
• 作为产物：
  描述：

  4,7,10-三氧-1,13-十三烷二胺 、 三氟乙酸乙酯 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 6.0h， 以1.27 g的产率得到N-[3-[2-[2-(3-氨基丙氧基)乙氧基]乙氧基]丙基]-2,2,2-三氟-
  参考文献：
  名称：

  双功能分子探针，用于基于醌的胺氧化酶基于活性的可视化

  摘要：

  介绍了两种双功能分子探针的设计，合成和评估，该探针可用于以活性依赖性方式可视化醌依赖性胺氧化酶。这些探针使用烷基肼不可逆地结合目标酶，然后可以通过蛋白质印迹法或凝胶内荧光法对其进行可视化。结果表明，Western blotting读数利用市售的抗硝基苯基抗体检测简单的二硝基苯基抗原，比基于荧光素的荧光读数提供了更强的读数。通过选择性地可视化用抑制剂处理后残留的活性酶，可以将这种可视化策略用于测量酶抑制剂的效力。期待，

  DOI：

  10.1002/chem.201804247

文献信息

• New affinity-based probes for capturing flavonoid-binding proteins
  作者：Hélène Carrié、Dong Tien Tran、Sabrina Rousseau、Stéphane Chaignepain、Jean-Marie Schmitter、Denis Deffieux、Stéphane Quideau

  DOI：10.1039/c4cc04557b

  日期：——

  Flavonoid-bearing probes have been designed and synthesized to explore their ability to selectively capture target proteins or biosynthetic enzymes under oxidative activation.

  含有黄酮类化合物的探针已被设计和合成，以探索它们在氧化活化下选择性捕获目标蛋白质或生物合成酶的能力。
• Enzyme-Mediated Site-Specific Bioconjugation of Metal Complexes to Proteins: Sortase-Mediated Coupling of Copper-64 to a Single-Chain Antibody
  作者：Brett M. Paterson、Karen Alt、Charmaine M. Jeffery、Roger I. Price、Shweta Jagdale、Sheena Rigby、Charlotte C. Williams、Karlheinz Peter、Christoph E. Hagemeyer、Paul S. Donnelly

  DOI：10.1002/anie.201402613

  日期：2014.6.10

  The enzyme‐mediated site‐specific bioconjugation of a radioactive metal complex to a single‐chain antibody using the transpeptidase sortase A is reported. Cage amine sarcophagine ligands that were designed to function as substrates for the sortase A mediated bioconjugation to antibodies were synthesized and enzymatically conjugated to a single‐chain variable fragment. The antibody fragment scFvanti‐LIBS

  报道了使用转肽酶分选酶A将放射性金属复合物与单链抗体进行酶介导的位点特异性生物缀合。旨在用作分选酶底物的笼型胺石棺配体被合成，并酶联缀合到单链可变片段上。抗体片段scFv抗LIBS靶向糖蛋白受体GPIIb / IIIa上的配体诱导的结合位点（LIBS），后者存在于活化的血小板上。免疫偶联物用正电子发射同位素64进行放射性标记铜 显示新的放射性标记的缀合物选择性结合活化的血小板。使用正电子发射断层扫描在颈动脉血栓形成的体内模型中证明了最有希望的结合物的诊断潜力。这种方法通过位点特异性酶介导的偶联产生均质的产物，应广泛应用于其他金属络合物和蛋白质。
• [EN] METHODS TO INDUCE TARGETED PROTEIN DEGRADATION THROUGH BIFUNCTIONAL MOLECULES<br/>[FR] PROCÉDÉS POUR INDUIRE LA DÉGRADATION CIBLÉE DE PROTÉINES PAR DES MOLÉCULES BIFONCTIONNELLES
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2016105518A1

  公开（公告）日：2016-06-30

  The present application provides bifunctional compounds which act as protein degradation inducing moieties. The present application also relates to methods for the targeted degradation of endogenous proteins through the use of the bifunctional compounds that link a cereblon-binding moiety to a ligand that is capable of binding to the targeted protein which can be utilized in the treatment of proliferative disorders. The present application also provides methods for making compounds of the application and intermediates thereof.