(2R,3R,4S,5R)-2-(8-bromo-6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol | 35665-66-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3R,4S,5R)-2-(8-bromo-6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol
• 英文别名: (2R,3R,4S,5R)-2-[8-bromo-6-(dimethylamino)purin-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 35665-66-8
• 化学式: C₁₂H₁₆BrN₅O₄
• 分子量: 374.194
• InChiKey: WOLWSEGAQKYQEF-IOSLPCCCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5R)-2-(8-bromo-6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol 在 磷酸三甲酯 、 三正丁胺 、 1,8-双二甲氨基萘 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 (dibromo((((((2R,3S,4R,5R)-5-(8-(butylamino)-6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)(hydroxy)phosphoryl)methyl)phosphonic acid
  参考文献：
  名称：

  核苷酸类似物ARL67156作为CD39和CD39 / CD73双重Ectonucleotidase抑制剂发展的牵头结构。

  摘要：

  核苷三磷酸二磷酸水解酶1（NTPDase1，CD39）抑制剂具有作为癌症（免疫）治疗新药的潜力。它们增加了免疫刺激性ATP的细胞外浓度，并减少了AMP的形成，后者可以被ecto-5'-核苷酸酶（CD73）进一步水解为免疫抑制，促进癌症的腺苷。在本研究中，我们合成了标准CD39抑制剂ARL67156的类似物和衍生物，这是一种显示出竞争性抑制机制的核苷酸类似物。在人酶处分析了结构-活性之间的关系。ñ腺嘌呤核的6-和C8-位，以及三磷酸（on）酸酯链的修饰。使用荧光标记的ATP衍生物的毛细管电泳与激光诱导的荧光检测耦合，以确定化合物的效力。相对于天然底物ATP，还通过正交的孔雀石绿分析法评估了选定的抑制剂。本系列中最有效的CD39抑制剂是ARL67156及其衍生物31和33ķ我值约为1 µM。选择性研究表明，所有三个核苷酸类似物还阻断了CD73作为双重靶标抑制剂的作用。对接研究为两个靶标提供了可

  DOI：

  10.3389/fphar.2020.01294
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R)-2-(acetoxymethyl)-5-(6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-3,4-diyl diacetate 在 氨 、 溴 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 (2R,3R,4S,5R)-2-(8-bromo-6-(dimethylamino)-9H-purin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3,4-diol
  参考文献：
  名称：

  OLIGONUCLEOTIDE HAVING NON-NATURAL NUCLEOTIDE AT 5'-TERMINAL THEREOF

  摘要：

  具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基的寡核苷酸{其中X1是氧原子或类似物，R1是式(IIA)（其中R5A是卤素或类似物，而R6A是氢原子或类似物），式(IVA)（其中Y3A是氮原子或类似物，而Y4A是CH或类似物），或类似物，R2是氢原子，羟基，卤素，或可选择地取代的较低烷氧基，而R3是氢原子或类似物，或式(VI)（其中n2为1、2或3）}在其5'端，其中核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。

  公开号：

  US20170354673A1

文献信息

• OLIGONUCLEOTIDE
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US20150376611A1

  公开（公告）日：2015-12-31

  The present invention provides an oligonucleotide having improved affinity for AGO2, and the like. The oligonucleotide has a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X 1 is an oxygen atom or the like, R 1 is formula (IIA) (wherein R 5A is halogen or the like, and R 6A is a hydrogen atom or the like) or formula (IVA) (wherein Y 3A is a nitrogen atom or the like, and Y 4A is CH or the like), or the like, R 2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R 3 is a hydrogen atom or the like} at the 5′ end thereof, and the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3.

  本发明提供了一种具有改善对AGO2亲和力的寡核苷酸等。该寡核苷酸在其5'端具有由式(I)表示的核苷酸残基或核苷酸残基其中X 1 是氧原子或类似物，R 1 是式(IIA)（其中R 5A 是卤素或类似物，而R 6A 是氢原子或类似物）或式(IVA)（其中Y 3A 是氮原子或类似物，而Y 4A 是CH或类似物），或类似物，R 2 是氢原子、羟基、卤素或可选择地取代的较低烷氧基，而R 3 是氢原子或类似物}，并且该核苷酸残基或核苷酸残基通过位于位置3的氧原子与相邻核苷酸残基结合。
• Oligonucleotide having non-natural nucleotide at 5′-terminal thereof
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US10342819B2

  公开（公告）日：2019-07-09

  An oligonucleotide having a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X1 is an oxygen atom or the like, R1 is formula (IIA) (wherein R5A is halogen or the like, and R6A is a hydrogen atom or the like), formula (IVA) (wherein Y3A is a nitrogen atom or the like, and Y4A is CH or the like), or the like, R2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R3 is a hydrogen atom or the like, or formula (VI) (wherein n2 is 1, 2 or 3)} at the 5′ end thereof, wherein the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3, is provided.

  具有由式(I)代表的核苷酸残基或核苷残基的寡核苷酸其中X1是氧原子或类似物，R1是式(IIA)（其中R5A是卤素或类似物，R6A是氢原子或类似物），式(IVA)（其中Y3A是氮原子或类似物，Y4A是CH或类似物），或类似物、R2是氢原子、羟基、卤素或任选取代的低级烷氧基，R3是氢原子或类似物，或式（VI）（其中n2是1、2或3）}在其5′端，其中核苷酸残基或核苷残基通过位置3的氧原子与相邻的核苷酸残基结合。
• Oligonucleotide
  申请人：Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd.

  公开号：US10378011B2

  公开（公告）日：2019-08-13

  An oligonucleotide having improved affinity for AGO2 is disclosed. The oligonucleotide has a nucleotide residue or a nucleoside residue represented by formula (I) wherein X1 is an oxygen atom or the like, R1 is formula (IIA), wherein R5A is halogen or the like, and R6A is a hydrogen atom or the like, or formula (IVA) wherein Y3A is a nitrogen atom or the like, and Y4A is CH or the like, or the like, R2 is a hydrogen atom, hydroxy, halogen, or optionally substituted lower alkoxy, and R3 is a hydrogen atom or the like at the 5′ end thereof, and the nucleotide residue or the nucleoside residue binds to an adjacent nucleotide residue through the oxygen atom at position 3. A method for improving the knockdown activity of an oligonucleotide wherein the oligonucleotide has a knockdown activity against an mRNA encoding a protein involved in a disease.

  本发明公开了一种对 AGO2 具有更好亲和力的寡核苷酸。该寡核苷酸具有由式（I）代表的核苷酸残基或核苷残基，其中 X1 是氧原子或类似物，R1 是式（IIA），其中 R5A 是卤素或类似物，R6A 是氢原子或类似物，或式（IVA），其中 Y3A 是氮原子或类似物、和 Y4A 是 CH 或类似物，或类似物，R2 是氢原子、羟基、卤素或任选取代的低级烷氧基，R3 是其 5′端的氢原子或类似物，核苷酸残基或核苷残基通过位置 3 的氧原子与相邻的核苷酸残基结合。一种提高寡核苷酸敲除活性的方法，其中寡核苷酸对编码涉及疾病的蛋白质的mRNA具有敲除活性。
• OLIGONUCLEOTIDE HAVING A NON-NATURAL NUCLEOTIDE AT THE 5'-TERMINAL
  申请人：Kyowa Kirin Co., Ltd.

  公开号：EP3130597B1

  公开（公告）日：2021-11-10