(5'R)-2-N-isobutyryl-3',5'-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(tert-butylcarbonyl)-2'-deoxyguanosine | 940952-31-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: (5'R)-2-N-isobutyryl-3',5'-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(tert-butylcarbonyl)-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: N-[9-[(2R,4S,5S)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[(1R)-1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-3,3-dimethyl-2-oxobutyl]oxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-2-methylpropanamide
• CAS: 940952-31-8
• 化学式: C₃₁H₅₅N₅O₆Si₂
• 分子量: 649.979
• InChiKey: OKVYZPPJGDSIBU-PABCKOPISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.4
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  133
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (5'R)-2-N-isobutyryl-3',5'-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(tert-butylcarbonyl)-2'-deoxyguanosine 在 叔丁基硫醇 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以27%的产率得到N²-isobutyryl-3',5'-di-O-tert-butyldimethylsilyl-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  在胸苷和2'-脱氧鸟苷中独立生成C5'-核苷基自由基

  摘要：

  胸腺嘧啶核苷1a和2'-脱氧鸟苷2的C5'叔丁基酮的合成是通过5'- C-氰基衍生物与叔丁基锂反应，然后进行酸水解来实现的。5' - [R配置是通过一个适当地保护的衍生物的X射线晶体结构测定分配1A。两个核苷的（5 'S）-异构体不稳定，并且在反应介质中发生完全分解。1a和2的光化学有效地分别产生了胸苷5'-基和2'-脱氧鸟苷-5'-基。在胸苷系统中，在生理浓度的硫醇存在下，C5'基团被完全淬灭。在2'-脱氧鸟苷系统中，C5'自由基对鸟嘌呤的C8-N7双键进行分子内攻击，最终导致5'，8-环-2'-脱氧鸟苷衍生物。2'-脱氧鸟苷-5'-基团的环化以约0.2的速率常数发生。1×10 6 s - 1且高度立体选择性，仅提供（5 'S）-非对映异构体。

  DOI：

  10.1021/jo062518c
• 作为产物：
  描述：

  N-(9-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-6-oxo-6,9-dihydro-1H-purin-2-yl)isobutyramide 在 二甲基亚砜 吡啶 、 咪唑 、 溶剂黄146 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 、 zinc(II) iodide 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 正戊烷 为溶剂， 反应 8.33h， 生成 (5'R)-2-N-isobutyryl-3',5'-di-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-(tert-butylcarbonyl)-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  在胸苷和2'-脱氧鸟苷中独立生成C5'-核苷基自由基

  摘要：

  胸腺嘧啶核苷1a和2'-脱氧鸟苷2的C5'叔丁基酮的合成是通过5'- C-氰基衍生物与叔丁基锂反应，然后进行酸水解来实现的。5' - [R配置是通过一个适当地保护的衍生物的X射线晶体结构测定分配1A。两个核苷的（5 'S）-异构体不稳定，并且在反应介质中发生完全分解。1a和2的光化学有效地分别产生了胸苷5'-基和2'-脱氧鸟苷-5'-基。在胸苷系统中，在生理浓度的硫醇存在下，C5'基团被完全淬灭。在2'-脱氧鸟苷系统中，C5'自由基对鸟嘌呤的C8-N7双键进行分子内攻击，最终导致5'，8-环-2'-脱氧鸟苷衍生物。2'-脱氧鸟苷-5'-基团的环化以约0.2的速率常数发生。1×10 6 s - 1且高度立体选择性，仅提供（5 'S）-非对映异构体。

  DOI：

  10.1021/jo062518c