1-(3-sulfonatopropyl)-2,3,3-trimethylindoleninium-4,6-dicarboxylic acid | 1361398-03-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-(3-sulfonatopropyl)-2,3,3-trimethylindoleninium-4,6-dicarboxylic acid
• 英文别名: 3-(4,6-dicarboxy-2,3,3-trimethylindol-1-ium-1-yl)propane-1-sulfonate
• CAS: 1361398-03-9
• 化学式: C₁₆H₁₉NO₇S
• 分子量: 369.395
• InChiKey: XBQWMZVHYANGOR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.41
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  134.81
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-sulfonatopropyl)-2,3,3-trimethylindoleninium-4,6-dicarboxylic acid 在 吡啶 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  MULTIMERIC PROTECTED FLUORESCENT REAGENTS

  摘要：

  提供了多聚保护荧光试剂及其合成方法。这些试剂在各种基于荧光的分析方法中很有用，包括在高密度下分析高度多重光学反应，比如单分子实时核酸测序反应。这些试剂包含荧光染料元素，允许化合物在理想波长下以高灵敏度被检测，结合元素，允许化合物被目标生物分子特异性识别，以及保护屏障元素，减少荧光染料元素与结合的目标生物分子之间的不良接触，从而减少荧光染料元素对结合的目标生物分子的光损伤。这些试剂还包含耦合元素，将单体化合物连接成多聚形式，从而增加亮度。

  公开号：

  US20160237279A1
• 作为产物：
  描述：

  5-肼基异邻苯二甲酸 在 环丁砜 、 溶剂黄146 作用下， 以 乙酸酐 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 1-(3-sulfonatopropyl)-2,3,3-trimethylindoleninium-4,6-dicarboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] FUNCTIONALIZED CYANINE DYES
  [FR] COLORANTS DE TYPE CYANINE FONCTIONNALISÉS

  摘要：

  公开号：

  WO2012027618A3

文献信息

• Protected fluorescent reagent compounds
  申请人：Pacific Biosciences of California, Inc.

  公开号：US09957291B2

  公开（公告）日：2018-05-01

  Protected fluorescent reagent compounds and their methods of synthesis are provided. The compounds are useful in various fluorescence-based analytical methods, including the analysis of highly multiplexed optical reactions in large numbers at high densities, such as single molecule real time nucleic acid sequencing reactions. The compounds contain fluorescent dye elements, that allow the compounds to be detected with high sensitivity at desirable wavelengths, binding elements, that allow the compounds to be recognized specifically by target biomolecules, and protective shield elements, that decrease undesirable contacts between the fluorescent dye elements and the bound target biomolecules and that therefore decrease photodamage of the bound target biomolecules by the fluorescent dye elements.

  提供了受保护的荧光试剂化合物及其合成方法。这些化合物在各种基于荧光的分析方法中很有用，包括在大量高密度下进行高度多重光学反应的分析，例如单分子实时核酸测序反应。这些化合物包含荧光染料元素，使得这些化合物能够在理想波长下以高灵敏度被检测到，结合元素使这些化合物能够被目标生物分子特异性识别，并且保护性屏障元素减少了荧光染料元素与结合的目标生物分子之间的不良接触，从而减少了荧光染料元素对结合的目标生物分子的光损伤。