(1R,5R,7R,8S)-8-hydroxy-5-hydroxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane | 1104192-42-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (1R,5R,7R,8S)-8-hydroxy-5-hydroxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane
• 英文别名: 1-[(1R,5R,7R,8S)-8-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-6-oxabicyclo[3.2.1]octan-7-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1104192-42-8
• 化学式: C₁₃H₁₈N₂O₅
• 分子量: 282.296
• InChiKey: OGZHJDFXIIRFMG-INTNWOOBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (1R,5R,7R,8S)-8-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane 在 Pd(OH)2/C 、 甲酸铵 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以90%的产率得到(1R,5R,7R,8S)-8-hydroxy-5-hydroxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane
  参考文献：
  名称：

  异常的自由基6-内酯环化成碳环-ENA，并通过600 MHz NMR和从头算计算阐明其溶液构象。

  摘要：

  在我们以前的论文（J. Am。Chem。Soc。，2007，129，8362）中，我们报道了通过5-己烯基或6-庚烯基合成7-Me-Carba-LNA和8-Me-Carba-ENA胸腺嘧啶核苷自由基环化。5-己烯基和6-庚烯基均以环外形式环化，从而得到不需要的环外C7-甲基。在本研究中，我们表明，可以通过将羟基引入烯属双键来调节5-己烯基自由基环化的区域选择性，产生约9％的6-内环化环化产物。与负责产生5-exo环化产物5的中间体相比，已经讨论了产生6-endo环化产物9的可能途径。基于这种独特的6内环化策略，已成功合成了碳环ENA修饰的胸苷（carba-ENA），

  DOI：

  10.1039/b813870b

文献信息

• Synthesis of 2′,4′-Propylene-Bridged (Carba-ENA) Thymidine and Its Analogues: The Engineering of Electrostatic and Steric Effects at the Bottom of the Minor Groove for Nuclease and Thermodynamic Stabilities and Elicitation of RNase H
  作者：Yi Liu、Jianfeng Xu、Mansoureh Karimiahmadabadi、Chuanzheng Zhou、Jyoti Chattopadhyaya

  DOI：10.1021/jo101207d

  日期：2010.11.5

  any, effect on nuclease resistance but 8′S-OH resulted in significantly decreased nucleolytic stability; and (3) 8′-NH2 substituted carba-ENA leads to obvious loss in the nuclease resistance. The RNA strand in all of the carba-ENA derivatives modified AON:RNA hybrid duplexes can be digested by RNase H1 with high efficiency, even at twice the rate of those of the native and ENA modified counterpart.

  2'，4'-丙烯桥胸苷（carba-ENA-T）和5个8'-Me / NH 2通过将分子内自由基加成到束缚的肟-醚的C═N中，已经制备了/ OH修饰的氨基-ENA-T类似物。这些碳烯-ENA核苷随后被掺入15mer寡脱氧核苷酸（AON）中，并且与天然和ENA对应物相比，已研究了它们对cDNA和RNA的亲和力，核酸酶抗性和RNase H募集能力。这些碳烯-ENA修饰的AON具有高度的RNA选择性，因为它们都对AON：RNA双链体产生轻微的热稳定作用，但对AON：DNA双链体产生相当大的去稳定作用。发现在carba-ENA-T上不同的C8'取代基（在小凹槽的底部）仅导致AON：RNA双链体的热稳定性变化很小。但是，我们 观察到，亲代碳酸酯-ENA-T修饰的AONs表现出比ENA-T修饰的对应物更高的核酸分解稳定性。不仅取决于化学性质，而且取决于C8'取代基的立体化学取向，C8'取代基还可以进一
• FIVE- AND SIX-MEMBERED CONFORMATIONALLY LOCKED 2',4'-CARBOCYCLIC RIBO-THYMIDINES FOR THE TREATMENT OF INFECTIONS AND CANCER
  申请人：Chattopadhyaya Jyoti

  公开号：US20100087387A1

  公开（公告）日：2010-04-08

  Compounds (1, 2, 3, 4) according to the formulae shown below: (Formula 1, 2, 3, 4). For General Formula1-4:N=1-Thyminyl,9-Adeninyl,9-Guaninyl,1-Cytosinyl, 5-methyl-1-cytosinyl, 5-trifluoromethyl-1-cytosinyl, 5-fluoro-1-cytosinyl, 5-fluoro-1-cytosinyl, 5-trifluoromethyl-1-Uracilyl or Formula (A) (12a/12b) wherein for 12a: n=1, Q=CH 3 (R) [5-membered carbocyclic with C7′ in R configuration], 12b: n=1, Q=CH 3 (S) [5-membered carbocyclic with C7′ in S configuration].

  根据下面所示的公式，化合物（1、2、3、4）：（公式1、2、3、4）。对于一般的公式1-4：N = 1-胸腺嘧啶基，9-腺嘌呤基，9-鸟嘌呤基，1-胞嘧啶基，5-甲基-1-胞嘧啶基，5-三氟甲基-1-胞嘧啶基，5-氟-1-胞嘧啶基，5-氟-1-胞嘧啶基，5-三氟甲基-1-尿嘧啶基或公式（A）（12a / 12b），其中对于12a：n = 1，Q = CH3（R）[C7'以R构型的5元环碳环]，12b：n = 1，Q = （S）[C7'以S构型的5元环碳环]。
• US8461124B2
  申请人：——

  公开号：US8461124B2

  公开（公告）日：2013-06-11