(1R,5R,7R,8S)-8-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane | 1104192-41-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (1R,5R,7R,8S)-8-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane
• 英文别名: 5-methyl-1-[(1R,5R,7R,8S)-8-phenylmethoxy-5-(phenylmethoxymethyl)-6-oxabicyclo[3.2.1]octan-7-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1104192-41-7
• 化学式: C₂₇H₃₀N₂O₅
• 分子量: 462.546
• InChiKey: YUSPAVODDWTPGW-VJPXLHPWSA-N

物化性质

• 密度：
  1.28±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  77.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,5R,7R,8S)-8-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane 在 Pd(OH)2/C 、 甲酸铵 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以90%的产率得到(1R,5R,7R,8S)-8-hydroxy-5-hydroxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane
  参考文献：
  名称：

  异常的自由基6-内酯环化成碳环-ENA，并通过600 MHz NMR和从头算计算阐明其溶液构象。

  摘要：

  在我们以前的论文（J. Am。Chem。Soc。，2007，129，8362）中，我们报道了通过5-己烯基或6-庚烯基合成7-Me-Carba-LNA和8-Me-Carba-ENA胸腺嘧啶核苷自由基环化。5-己烯基和6-庚烯基均以环外形式环化，从而得到不需要的环外C7-甲基。在本研究中，我们表明，可以通过将羟基引入烯属双键来调节5-己烯基自由基环化的区域选择性，产生约9％的6-内环化环化产物。与负责产生5-exo环化产物5的中间体相比，已经讨论了产生6-endo环化产物9的可能途径。基于这种独特的6内环化策略，已成功合成了碳环ENA修饰的胸苷（carba-ENA），

  DOI：

  10.1039/b813870b
• 作为产物：
  描述：

  O-[(1R,2S,5R,7R,8S)-7-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-8-phenylmethoxy-5-(phenylmethoxymethyl)-6-oxabicyclo[3.2.1]octan-2-yl] methylsulfanylmethanethioate 在 偶氮二异丁腈 、 三正丁基氢锡 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 1.5h， 以73.5%的产率得到(1R,5R,7R,8S)-8-benzyloxy-5-benzyloxymethyl-7-(thymin-1-yl)-6-oxa-bicyclo[3.2.1]octane
  参考文献：
  名称：

  2'，4'-丙烯桥联的（Carba-ENA）胸苷的合成及其类似物：小沟槽底部的静电和立体效应对核酸酶和热力学稳定性的影响以及对RNase H的诱导作用

  摘要：

  2'，4'-丙烯桥胸苷（carba-ENA-T）和5个8'-Me / NH 2通过将分子内自由基加成到束缚的肟-醚的C═N中，已经制备了/ OH修饰的氨基-ENA-T类似物。这些碳烯-ENA核苷随后被掺入15mer寡脱氧核苷酸（AON）中，并且与天然和ENA对应物相比，已研究了它们对cDNA和RNA的亲和力，核酸酶抗性和RNase H募集能力。这些碳烯-ENA修饰的AON具有高度的RNA选择性，因为它们都对AON：RNA双链体产生轻微的热稳定作用，但对AON：DNA双链体产生相当大的去稳定作用。发现在carba-ENA-T上不同的C8'取代基（在小凹槽的底部）仅导致AON：RNA双链体的热稳定性变化很小。但是，我们 观察到，亲代碳酸酯-ENA-T修饰的AONs表现出比ENA-T修饰的对应物更高的核酸分解稳定性。不仅取决于化学性质，而且取决于C8'取代基的立体化学取向，C8'取代基还可以进一

  DOI：

  10.1021/jo101207d

文献信息

• Unusual radical 6-endo cyclization to carbocyclic-ENA and elucidation of its solution conformation by 600 MHz NMR and ab initio calculations
  作者：Chuanzheng Zhou、Oleksandr Plashkevych、Jyoti Chattopadhyaya

  DOI：10.1039/b813870b

  日期：——

  through 5-hexenyl or 6-heptenyl radical cyclization. Both 5-hexenyl and 6-heptenyl radical cyclized exclusively in the exo form, giving unwanted exocyclic C7-methyl group. In the present study, we showed that the regioselectivity of the 5-hexenyl radical cyclization could be favorably tuned by introduction of a hydroxyl group to the olefinic double bond, yielding about 9% of the 6-endo cyclization product

  在我们以前的论文（J. Am。Chem。Soc。，2007，129，8362）中，我们报道了通过5-己烯基或6-庚烯基合成7-Me-Carba-LNA和8-Me-Carba-ENA胸腺嘧啶核苷自由基环化。5-己烯基和6-庚烯基均以环外形式环化，从而得到不需要的环外C7-甲基。在本研究中，我们表明，可以通过将羟基引入烯属双键来调节5-己烯基自由基环化的区域选择性，产生约9％的6-内环化环化产物。与负责产生5-exo环化产物5的中间体相比，已经讨论了产生6-endo环化产物9的可能途径。基于这种独特的6内环化策略，已成功合成了碳环ENA修饰的胸苷（carba-ENA），
• FIVE- AND SIX-MEMBERED CONFORMATIONALLY LOCKED 2',4'-CARBOCYCLIC RIBO-THYMIDINES FOR THE TREATMENT OF INFECTIONS AND CANCER
  申请人：Chattopadhyaya Jyoti

  公开号：US20100087387A1

  公开（公告）日：2010-04-08

  Compounds (1, 2, 3, 4) according to the formulae shown below: (Formula 1, 2, 3, 4). For General Formula1-4:N=1-Thyminyl,9-Adeninyl,9-Guaninyl,1-Cytosinyl, 5-methyl-1-cytosinyl, 5-trifluoromethyl-1-cytosinyl, 5-fluoro-1-cytosinyl, 5-fluoro-1-cytosinyl, 5-trifluoromethyl-1-Uracilyl or Formula (A) (12a/12b) wherein for 12a: n=1, Q=CH 3 (R) [5-membered carbocyclic with C7′ in R configuration], 12b: n=1, Q=CH 3 (S) [5-membered carbocyclic with C7′ in S configuration].

  根据下面所示的公式，化合物（1、2、3、4）：（公式1、2、3、4）。对于一般的公式1-4：N = 1-胸腺嘧啶基，9-腺嘌呤基，9-鸟嘌呤基，1-胞嘧啶基，5-甲基-1-胞嘧啶基，5-三氟甲基-1-胞嘧啶基，5-氟-1-胞嘧啶基，5-氟-1-胞嘧啶基，5-三氟甲基-1-尿嘧啶基或公式（A）（12a / 12b），其中对于12a：n = 1，Q = CH3（R）[C7'以R构型的5元环碳环]，12b：n = 1，Q = CH3（S）[C7'以S构型的5元环碳环]。
• US8461124B2
  申请人：——

  公开号：US8461124B2

  公开（公告）日：2013-06-11
• Synthesis of 2′,4′-Propylene-Bridged (Carba-ENA) Thymidine and Its Analogues: The Engineering of Electrostatic and Steric Effects at the Bottom of the Minor Groove for Nuclease and Thermodynamic Stabilities and Elicitation of RNase H
  作者：Yi Liu、Jianfeng Xu、Mansoureh Karimiahmadabadi、Chuanzheng Zhou、Jyoti Chattopadhyaya

  DOI：10.1021/jo101207d

  日期：2010.11.5

  any, effect on nuclease resistance but 8′S-OH resulted in significantly decreased nucleolytic stability; and (3) 8′-NH2 substituted carba-ENA leads to obvious loss in the nuclease resistance. The RNA strand in all of the carba-ENA derivatives modified AON:RNA hybrid duplexes can be digested by RNase H1 with high efficiency, even at twice the rate of those of the native and ENA modified counterpart.

  2'，4'-丙烯桥胸苷（carba-ENA-T）和5个8'-Me / NH 2通过将分子内自由基加成到束缚的肟-醚的C═N中，已经制备了/ OH修饰的氨基-ENA-T类似物。这些碳烯-ENA核苷随后被掺入15mer寡脱氧核苷酸（AON）中，并且与天然和ENA对应物相比，已研究了它们对cDNA和RNA的亲和力，核酸酶抗性和RNase H募集能力。这些碳烯-ENA修饰的AON具有高度的RNA选择性，因为它们都对AON：RNA双链体产生轻微的热稳定作用，但对AON：DNA双链体产生相当大的去稳定作用。发现在carba-ENA-T上不同的C8'取代基（在小凹槽的底部）仅导致AON：RNA双链体的热稳定性变化很小。但是，我们 观察到，亲代碳酸酯-ENA-T修饰的AONs表现出比ENA-T修饰的对应物更高的核酸分解稳定性。不仅取决于化学性质，而且取决于C8'取代基的立体化学取向，C8'取代基还可以进一