5-aminopentyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside | 1393444-29-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5-aminopentyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
• CAS: 1393444-29-5
• 化学式: C₂₁H₃₉N₃O₁₁
• 分子量: 509.554
• InChiKey: FDSKWWMNYMHSKC-NUYWHQHHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.96
• 重原子数：
  35.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.9
• 拓扑面积：
  222.29
• 氢给体数：
  8.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Bis(sodium) guanosine 5'-β-L-fucopyranosyl-diphosphate 、 5-aminopentyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside 在 manganese(ll) chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 40.08h， 以0.60 mg的产率得到5-aminopentyl β-D-galactopyranosyl-(1→4)-α-L-fucopyranosyl-(1→3)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  使用GlycoPEG标签的三维阵列：聚糖的合成，纯化和固定化

  摘要：

  聚糖阵列已成为快速建立凝集素和碳水化合物加工酶结合或底物特异性的主要工具。需要新的方法来加速碳水化合物的合成以解决天然聚糖结构的巨大复杂性。此外，优化聚糖固定化是开发选择性，灵敏和可重现的基于阵列的检测方法的关键。我们提出了一种基于标签的方法，可通过改善寡糖的合成，纯化和固定化来加速所有水平的聚糖阵列的制备。将聚糖引物化学连接至双功能聚乙二醇（PEG）标签，借助重组糖基转移酶进行酶促延伸，最后通过超滤纯化。当直接在激活的载玻片上打印时，这些glycoPEG标签为阵列提供了极高的灵敏度，低背景和出色的斑点形态。同样，糖PEG标签与乳胶纳米颗粒的缀合产生了用于碳水化合物结合测定的多价支架，具有非常低的非特异性结合。

  DOI：

  10.1002/chem.201204004
• 作为产物：
  描述：

  P'-[2-(acetylamino)-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl] ester uridine 5'-(trihydrogen diphosphate), disodium salt 、 aminopentyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside 在 Caenorhabditis elegans β-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 8.08h， 以76%的产率得到5-aminopentyl 2-acetamido-2-deoxy-β-D-galactopyranosyl-(1→4)-2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  使用GlycoPEG标签的三维阵列：聚糖的合成，纯化和固定化

  摘要：

  聚糖阵列已成为快速建立凝集素和碳水化合物加工酶结合或底物特异性的主要工具。需要新的方法来加速碳水化合物的合成以解决天然聚糖结构的巨大复杂性。此外，优化聚糖固定化是开发选择性，灵敏和可重现的基于阵列的检测方法的关键。我们提出了一种基于标签的方法，可通过改善寡糖的合成，纯化和固定化来加速所有水平的聚糖阵列的制备。将聚糖引物化学连接至双功能聚乙二醇（PEG）标签，借助重组糖基转移酶进行酶促延伸，最后通过超滤纯化。当直接在激活的载玻片上打印时，这些glycoPEG标签为阵列提供了极高的灵敏度，低背景和出色的斑点形态。同样，糖PEG标签与乳胶纳米颗粒的缀合产生了用于碳水化合物结合测定的多价支架，具有非常低的非特异性结合。

  DOI：

  10.1002/chem.201204004