5'-d(ACTXACT)-3'; X = 2'-deoxy-5-(3-{[4-({1-[4-(dihydroxyboryl)benzyl]-9,9-difluoro-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1H-cycloocta[d][1,2,3]triazol-8-yl}methyl)benzoyl]amino}prop-1-yn-1-yl)uridine | 1289361-21-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: 5'-d(ACTXACT)-3'; X = 2'-deoxy-5-(3-{[4-({1-[4-(dihydroxyboryl)benzyl]-9,9-difluoro-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1H-cycloocta[d][1,2,3]triazol-8-yl}methyl)benzoyl]amino}prop-1-yn-1-yl)uridine
• 英文别名: [4-[[5-[[4-[3-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-[[[(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxymethyl]-4-[[(2R,3S,5R)-3-[[(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3-[hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]prop-2-ynylcarbamoyl]phenyl]methyl]-4,4-difluoro-6,7,8,9-tetrahydro-5H-cycloocta[d]triazol-3-yl]methyl]phenyl]boronic acid
• CAS: 1289361-21-2
• 化学式: C₉₃H₁₁₁BF₂N₂₆O₄₄P₆
• 分子量: 2531.7
• InChiKey: JQOJYJWSOYUBBW-GMECSCTISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.07
• 重原子数：
  172
• 可旋转键数：
  46
• 环数：
  20.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  945
• 氢给体数：
  18
• 氢受体数：
  56

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-d(ACTXACT)-3'; X = 2'-deoxy-5-[3-({4-[(2,2-difluorocyclooct-3-yn-1-yl)methyl]benzoyl}amino)prop-1-yn-1-yl]uridine 、 (4-(azidomethyl)phenyl)boronic acid 反应 0.5h， 生成 5'-d(ACTXACT)-3'; X = 2'-deoxy-5-(3-{[4-({3-[4-(dihydroxyboryl)benzyl]-9,9-difluoro-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1H-cycloocta[d][1,2,3]triazol-8-yl}methyl)benzoyl]amino}prop-1-yn-1-yl)uridine 、 5'-d(ACTXACT)-3'; X = 2'-deoxy-5-(3-{[4-({1-[4-(dihydroxyboryl)benzyl]-9,9-difluoro-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1H-cycloocta[d][1,2,3]triazol-8-yl}methyl)benzoyl]amino}prop-1-yn-1-yl)uridine
  参考文献：
  名称：

  通过无铜点击反应进行硼酸修饰的DNA的第一化学合成。

  摘要：

  报道了使用无铜咔嗒试剂将硼酸基团第一次化学掺入DNA。与基于PCR的方法相比，此方法可进行更大的位点特异性结合和合成。

  DOI：

  10.1039/c0cc04546b